不知道是什麼年代了，整個世界洪水滔天，土地被淹沒了，人畜被淹沒了，一切都被浸泡在大水之中。世界上隻剩下兄妹兩人，他們躲在一個大葫蘆裏，葫蘆口是被蠟封住的。
這個大葫蘆在洪水中隨波逐流，漂啊，漂啊，不知漂了多少個晝夜，也不知漂過了多少個地方。有一天，洪水終於退了，山頭露出來了，樹梢露出來了。這個大葫蘆被掛在一棵大樹丫杈上。老鷹在天空盤旋，它聽到大葫蘆裏傳出聲音，那是有人在裏頭啊！於是，老鷹把葫蘆抓了起來，把它放在山頂上。這時，耗子從底下鑽了出來，它聽到葫蘆裏的聲音，知道是有人在裏麵，就把葫蘆口上的封蠟給啃掉了。葫蘆裏透進了一線光亮，兄妹二人便順著光亮爬了出來。在這個荒涼的世界上，他們是惟一的兩個人了。
這時，一隻老金龜來到他們兄妹的麵前說：“為了傳種接代，你們兄妹必須結成夫妻。”兄妹回答說：“我們是一個父母所生，怎麼能夠成親呢。”老金龜說：“人類隻有你們兩個了，如果你們不成親，人類就要滅絕了。”
兄妹兩人十分為難，哥哥想出了一個主意說：“我倆各在一方燒柱香，問問天公地神，如果香煙升起來繞在一起，我們才能成親。”結果，香煙一陣陣地升起來，在空中相互纏繞。但是妹妹依然堅持說不能成親。哥哥又說：“我們兩人各在一個山頭滾磨，如果兩扇磨攏在一起。合起來，我們才能成親。”
他們又照這樣辦了，結果兩扇磨不偏不歪，正好合攏在一起但是妹妹還是不願成親。
妹妹說：“我們再滾一次簸箕，要是兩個簸箕麵對麵地合攏了，才能成親。”結果，他們兩個人的簸箕又真地麵對麵地合攏了。最後，老金龜說：“你們還有什麼說的？馬上成親吧。”妹妹又說道：“沒有父母之命，沒有媒妁之言，怎麼能夠成親？”老金龜說：“現在人煙已經滅絕，到哪裏去找人？那棵鬆樹就是你們的父親，這棵萬年青就是你們的母親，旁邊的那棵梅樹就是你們的媒人。你們就成親吧。”兄妹二人再也堅持不下去了，為了傳下人種，他們終於結成了夫妻。
過了十二個月，妹妹懷孕了，生了一胎，可惜不成人形，是一個大肉團。這怎麼辦呢？
妹妹埋怨哥哥，哥哥埋怨老金龜。這時，老金龜又出現了，他笑哈哈地向兄妹二人賀喜，並說：“你們已經傳下人種！”說罷，他抽出寶劍，一劍劈下去，把肉團劈開，從那裏出來了五十個童男、五十個童女。
那一張包著人種的肉皮還流著血呢，金龜老人順手用劍一挑，甩到旁邊的一棵小樹上，從此，這棵小樹就開出了紅彤彤的馬櫻花。