公元6世紀時，安第斯山區和沿海地帶大約共生活著100多個部落，其中最主要的有4個：艾馬拉、莫契卡、普基那和克丘亞。
到了公元13世紀，克丘亞部落群中的印加部落開始崛起，建立了奴隸製國家。印加國家由大酋長統治，它與周圍的部落和國家進行著和平的產品互換和社會交往。隨著國勢日益強大，印加國家開始譜寫自己的征服史。
宗教在印加帝國各族人民的生活中占有很重要的地位。印加人崇拜祖先，崇拜自然力，更崇拜太陽神。
圖騰崇拜的殘餘是最為古老的。印加入崇拜一些被認為是神聖的草、木和動物。動物主要有美洲豹，還有南美兀鷲、大鷹和猿。植物的宗教化身，首先是玉米神和馬鈴薯神，因為這兩種農作物在印加人的生活中起了重大作用。
瓦卡崇拜也是最為普遍和較原始的宗教。瓦卡就是崇拜聖地或聖物，或者說是崇拜能引起人們崇敬之心以及能使人聯想起傳說中的曆史事件的地點，如山嶽、岩石、河流、湖泊、泉水和山洞等等。有的地方被看作是一個部落或村社的起源地，因此，人們經過此地時，都要唱哀歌進行祈禱。有些瓦卡崇拜已成為一種習俗而保持至今。如一條道路上的某一處被認為是地方神的所在地點，行人經過該地時就把一塊石頭加在多年堆起來的石頭堆上，以求地方神保佑行人一路平安。還有些地方，如橋梁、河流、岩石，或傳說中英雄首領的墓地，也成為瓦卡崇拜的對象。譬如，庫斯科附近山上的一些石頭，被認為是曾變成人來幫助帕查庫蒂打敗昌卡人的聖物，所以，這些石頭就成為受崇拜的神。庫斯科的瓦納考裏小山上有一塊奇形怪狀的石頭，人們認為它是傳說中印加始姐的兄弟卡奇變的，這塊石頭也就成了印加青年們舉行成年儀式的聖地標誌。庫斯科附近的帕卡裏——坦普岩洞也被當作瓦卡祟拜，因為，它是傳說中印加首領曼科·卡帕克的出生地。
印加人祟拜木乃伊之風也很盛行，這與崇拜祖先是密不可分的。人們常把木乃伊埋葬在用岩石鑿成的墳墓裏，木乃伊穿著盛裝，戴著首飾，旁邊放有日常用品以及食物和勞動工具。
印加人還熱心於對自然力的崇拜，各種星辰和星座都被看作是神。印加人同樣崇拜地球和海洋。
大地母親崇拜影響深遠，根深蒂固。大地母親崇拜是地方性的，在每個地方，人們都把大地母親當作自然界的女主人，無論土地的收成、駱馬的繁殖和經濟的繁榮，都取決於她。在專門的節慶時，人們用玉米和馬鈴薯做成類似婦女的形狀，來作為他們的保護神。