努爾哈赤不愧是一代梟雄，雖然聞知兩個兒子陣亡，心中無比悲痛，但是還是冷靜的下了命令。
接下來，攻城的女真人開始向東城門集中，東城門頓時壓力劇增，暗地裏女真人開始悄悄的安排撤退，到了傍晚，女真人漸漸停止了攻城，城裏的明軍士兵也開始懈怠下來，安排完士兵吃飯休息後，孫傳庭也就吃飯去了。
不料，孫傳庭還沒有吃完晚飯，就聽到親兵傳話，孫承宗大人要他馬上去總督府議事，孫傳庭也顧不得吃飯了，穿戴整齊直奔孫承宗處。
原來，熊廷弼見到大勢已定，顧不得等到戰鬥結束，就派人給孫承宗送信，說是莽爾古泰部已被全殲，阿爾泰部被殲在即，準備派賀世賢帥二萬騎兵在戰鬥結束後立即奔赴遼陽圍殲努爾哈赤。可惜的是這信使到了遼陽城進不了城門，直到女真人撤兵休息才進了城。等到現在孫傳庭被傳來議事時，賀世賢已經一人雙馬趕到了遼陽城。孫承宗一聲令下，號炮齊鳴，幾十裏外都能聽到反攻的炮聲，一時間所有能夠出擊的明軍全部投入了追擊的戰鬥。老奸巨猾的努爾哈赤現在已經帶著本部人馬逃出了二十裏外，斷後的人馬被殺得四處亂竄，順勢收回本溪，而熊廷弼則派出尤世功攻占了撫順。
就在孫傳庭懊悔自己的判斷能力太差，沒能及時出擊獲得更大戰果時，孫承宗也在反思自己是不是有點保守了，雖然皇帝陛下說守住遼東就行，但是能取得大勝不是更好嗎。
就在大家都認為戰爭已經結束了，戰果就要上報朝廷的時候，有人來報：“有一個叫毛文龍的遊擊求見。”
孫承宗一愣，隨即回道：“請進。”
不一會，隻見一個滿臉橫肉，渾身都是匪氣的人進來施禮：“遼東都司屬下遊擊將軍毛文龍參見大人，請大人治不遵號令之罪。”
孫承宗納悶，這家夥請罪來怎麼一點請罪的意思都沒有，便問道：“為什麼不遵號令？不尊什麼號令？”
毛文龍說道：“孫大人命令集結下屬們在遼陽等待反攻，屬下卻不等反攻私自進軍了，不過略有戰績。屬下接到命令後，整隊準備集結，聽到來往的客商說是赫圖阿拉空虛，想到既然努爾哈赤集結九萬大軍攻擊遼陽、沈陽，其老家空虛是必然的，隨即慫恿部下三千餘人，跟從屬下襲擊赫圖阿拉，並且僥幸成功。”
原來這毛文龍生性膽大包天，無所懼怕，當他聽說努爾哈赤率部來攻，後防空虛，心中一動，決定趁虛而入。於是，就率領屬下的三千餘輕騎，不管集結命令，直接就出兵赫圖阿拉，星夜兼程，爬山涉水，二日間就趕到了目的地，順手捉了幾個女真人當做士兵，夜間騙開了赫圖阿拉的城門，然後三千人是直奔努爾哈赤的老巢，把它給端了。俘虜了努爾哈赤的兒子賴幕布、多爾袞、多鐸，殺了阿齊格和努爾哈赤的兩個老婆，放火焚燒了赫圖阿拉城。