山東聞香教案的破獲，使朱有孝對自己對新政有了足夠的信心，也對繼續擴大新式官員的培訓加大了力度，他準備今年再次舉行考試，繼續招收培訓新式官員，並且把試驗的範圍擴大到直隸、河南、陝西、甘肅，以便徹底穩固大明朝在北部的基礎。
在遼東的熊廷弼自開春以來一直也沒有閑著，自從去年奪取鐵嶺、同化以來，他一直在囤積糧草和練兵。在軍備方麵，槍炮彈藥不斷的在改進，新式的大炮裝備了二十多門，迫擊炮準備了一百多門，“二踢腳”小炮裝備到了各個小隊。
按照朱有孝的整軍安排，熊廷弼新式的軍隊全部是募兵製。因為遼東有足夠的土地，再加上從直隸和山東不斷遷徙過來的老百姓，熊廷弼的兵源沒有任何問題，現在已經募集了十萬精兵，這十萬精兵分別由賀世賢、尤世功、滿桂、趙率教、毛文龍各帶一萬五千人。因為現在的武器還不像後世那麼猛烈，就是炮火的覆蓋力度還不是太強大，火槍還需要密集的隊形進行排射，所以編隊方式也不可能像後世的那樣精簡。熊廷弼手下這幾員猛將都包括“二踢腳”小炮兵營二千人，步兵五千人，槍騎兵五千人，後勤兵三千人，平時集中訓練，到戰事發生時根據實際情況派出兵力。每一個主將下麵的這一萬五千人又分為三個千戶，以千戶作為基本的作戰單位，既可以單獨作戰，又可以互相協助作戰。
熊廷弼自己則和孫傳庭帶領其餘的二萬五千人馬，這裏麵就包括所有的大炮和迫擊炮，騎兵全部是一人雙馬的輕騎兵。因為在遼東真正需要一下子出動十萬人馬的戰事現在並不太多，除非是要想大規模對女真人圍剿，所以分散的小圍剿比較多，熊廷弼就把這些小戰鬥當作是實戰練兵。
隨著明軍不斷的越來越強，努爾哈赤和科爾沁蒙古人的聯係就越來越困難，尤其是葉赫那拉部落和明軍聯合以後勢力更是不斷向北發展，逐漸就有了切斷他們聯係的趨勢。努爾哈赤部落還稍好一點，畢竟他的地盤稍大一點，再加上眼看著西邊明軍不斷強大，他就開始向東和北的方向發展，同時和朝鮮開始悄悄的做起了生意。
科爾沁蒙古人的運氣可以說是糟透了，在和女真人聯合作戰時，二萬精銳騎兵被孫傳庭打得落花流水，幾乎全軍覆沒，好歹孫傳庭並沒有乘勝進入科爾沁大草原，讓他們有了喘口氣的機會。不過察哈爾部落的林丹汗卻不放過他，林丹汗在明朝的支持下強大起來，通過不斷的牛羊脂肪貿易，把廢料變成了銀子，通過商品壟斷貿易控製了其他蒙古部落的糧食、茶葉和其他日常生活用品渠道，其他的部落不得不交好林丹汗。可是科爾沁蒙古人聯合了女真人一起欺負了其他蒙古部落，這麼以來它就成了林丹汗打擊的重點對象。因此一些較小的附屬在科爾沁蒙古部落的小部落就開始離心離德，於是就發生了西遷的現象。科爾沁蒙古人部落幾百年以來一直居住在這裏，就是想遷徙也是很困難的事情，因為遷徙就意味著要打仗，剛剛受到明軍打擊的科爾沁蒙古人可沒有那麼多精銳騎兵再去消耗了。於是科爾沁蒙古人決定向明朝軍隊妥協，其首領奧巴召集諸部落台吉商議，在部落會議上奧巴和諸位台吉一致決定放棄和努爾哈赤的盟約關係，向明朝靠攏。離明軍最近的科爾沁蒙古部落台吉宰桑*布和對此非常激動，因為一旦與明軍合作，他將是受益最大的部落，奧巴也覺得台吉宰桑*布和離明軍最近，便委托他全權和明軍談判合作事宜。