預算編製過程已經明確了公司各個責任主體的努力方向，預算的實施過程以及超額預算的監控則是各個責任主體實現預算以及公司控製財務風險的過程。公司預算管理能否達到預期效果，主要取決於預算實施過程以及公司對預算執行的有效控製。
一、預算實施的內容
預算的實施主要包括預算責任書的簽訂、預算的調整和仲裁以及年終的預算考核。1.預算責任書的簽訂
正式預算確定後，公司內各部門、事業部及子公司的負責人要與預算管理委員會主任簽訂預算目標責任書。預算目標責任書由總部預算編製部門統一製作，責任書中包括：預算方案中的核心指標，與預算值對應的獎懲辦法。該協議要在人力資源部門備案。
2.預算的調整和仲裁
預算執行中往往會發生許多與預算編製初期的假設條件不一致的事件，公司預算管理委員會要根據這些事件對公司的影響程度以及公司化解風險的能力決定公司是否調整預算。此外，公司內部可能因為預算（因為預算是資金資源的分配）而產生資源供給矛盾，總部要對各事業部、子公司的供給矛盾進行協調。因此，公司必須建立預算的仲裁流程。
（1）預算的調整。當公司內外環境發生變化，預算出現較大偏差，原有預算不符合公司實際經營時，就需要進行預算調整。預算調整是一個十分規範的過程，需要建立嚴格、規範的調整審批製度和程序，按照規定的程序進行調整。預算調整不僅影響到各事業部、各子公司的利益，而且可能影響到總部職能部門的利益，所以需要從嚴把握。預算調整的審批權限應該高度集中，而預算管理委員會是全麵預算管理的最高權力機構，所以通常將預算調整的審批權限集中於預算管理委員會。
（2）預算的仲裁。預算仲裁是當預算責任主體之間發生利益糾紛時，由公司最高預算管理機關對責任主體之間的利益衝突進行的裁決。預算管理涉及很多責任主體，公司各職能部門、事業部、子公司之間存在著無法割裂的連帶關係，預算執行過程中各責任主體難免產生利益衝突，從而影響預算的順利執行。因此，必須借助仲裁維護預算的嚴肅性，維護公司的整體利益。
①內部仲裁機構。內部仲裁機構是負責調解和裁決各預算責任主體之間的經濟糾紛的權力機構。內部仲裁機構應該由公司預算管理委員會負責。當責任主體之間發生糾紛時，首先由預算管理委員會進行調解，調解成功則由糾紛雙方根據協議自行解決；若調解無效，則由預算管理委員會進行裁決，並將裁決結果強製執行。
②內部仲裁原則。內部仲裁應當堅持公正原則和整體利益高於局部利益原則。各預算執行主體均是公司內部的責任實體，所以預算管理委員會進行內部仲裁時必須一視同仁。當職能部門、事業部或子公司與公司利益發生衝突時，局部利益均應以公司利益為重，不允許為了局部利益而犧牲公司利益的事情發生。
3.預算考核
（1）預算考核的組織級次。預算考評應當按照組織級次逐級考評。公司的預算考核可按照三個級次進行：董事會負責對高級經營管理團隊預算執行結果的考評，預算管理委員會（部分公司為績效管理委員會，但組成人員基本相同）負責對事業部、子公司預算結果的考評，委員會通常由公司總經理、副總經理、審計部、財務部、人力資源部、預算編製部的經理聯合組成。審計部、財務部、人力資源部、預算編製部的經理則由總經理親自考評。事業部及子公司基層人員的預算考評主體是直接上級主管。
（2）預算考評的基本程序。預算考評既是一種動態考評，也是一種綜合考評。作為動態考評，各責任主體在預算執行過程中對預算執行情況和預算指標之間的差異即時確認、即時處理，進行的定期檢查，屬於事中控製。作為綜合考評，各責任主體在預算期末對於各預算執行主體的預算完成情況進行的整體分析評價，更關注公司整體效益的評價及年終利益分配。動態考評側重過程上的控製，綜合考評側重結果，綜合考評必須建立在動態考評的基礎上，其結果是動態考評結果的“積累”。預算考評的基本程序如下：
①資料收集。預算考評所需的資料包括內部資料和外部資料。內部資料主要是預算指標以及預算的實際執行情況。預算指標來自年初的預算方案，預算的實際執行情況來自財務部門以及預算審計部門，內部資料用來確認目標與結果的差異。外部資料是影響預算執行結果的外部因素，用來保證考評結果的外部公正性。
②差異確定。公司預算編製部門將內部資料即年初的預算指標額與預算實際執行情況逐項檢查，確認差異。
③差異分析。對差異進行分析是為了界定預算執行過程中的可控因素和不可控因素。公司應當盡可能地在預算考評時剔除不可控因素對業績產生的不利影響因素，將可控的業績進行評價。對於部分情況公司應當分析考評，例如，公司年中調整政策導致被考評單位業績下滑；國家或政府政策發生重大變化，導致相關公司業績受到嚴重影響；市場發生重大變化但事業部及子公司無法控製（如原材料突然漲價導致中下遊產品成本上升）利潤出現滑坡等。被考評事業部及子公司如果發生上述情況，在經營過程中，需及時向總部提出書麵報告，得到總部確認，在考評時，被考評的單位應當提供充分依據，經考評人員確認後才能調整考評標準。