關於秘書長的人選，曾任偉還堅持一定要由校方的人來擔任，同時秘書長下設秘書處，也應該由校方聘請專職人員來擔任。在曾任偉看來，由校方的人擔任秘書長更便於開展工作，而由企業家學員們擔任秘書長，由於學員們隻能兼職工作，而且大家都是企業家，沒有太多精力負責秘書處的工作，會導致很多工作難以開展。
事實證明，這種設置是正確的。過去和現在，很多地方的同學會都由學校與同學分別擔任秘書長、執行秘書長的工作，有時候由於大家意見不統一，或溝通不到位，導致工作無法有效推行。
另外，很多協會、商會、同學會等組織是沒有專職人員的，大都由某個骨幹成員兼任，有的行業協會、商會、同學會最多隻有一個專職秘書長。
而博商會一開始就設置了專職負責的體製，且隨著工作量的增加，其專職人員也在不斷增配。
鄭義林坦誠，開始做秘書長的時候，隻是覺得壓力很大，並沒有任何概念，不知道要做什麼。
秘書處成立後前半年一直處於摸索期。為此，博商會召開了很多次理事會會議，鄭義林也參考了校友會和商會兩種運作模式，決定先從舉辦一些小活動、辦《博商》雜誌等開始。
2010年3月，博商會會刊《博商》創刊，每月出一期，免費寄發給各位博商會員。《博商》會刊定位為引領中小企業管理思潮，為中小企業提供成長的思想動力。《博商》雜誌秉承“博商貫通，商行天下”的理念，立足於中國國情，重點突出中國管理熱點，適當兼顧宏觀經濟，融入中國人文底蘊，演繹本土中小民營企業管理案例。
鄭義林擔任《博商》執行主編，他提出以博商會動態作為常規內容，以每期專題進行深入探討，以企業訪談作為充實材料，以廣告傳遞客戶價值，以好書推薦培育博商學習環境。
《博商》編輯部成員通過多次欄目策劃，形成了企業訪談、專家論壇、經典案例、本期專題、管理時評、同學會動態等精華欄目。采編的時候，編輯部成員出入各種博商會的商務活動和行業交流會，采訪博商會員企業，總結和歸納博商企業的成功經驗，以優美平實的文字表達出來。《博商》雜誌最大的亮點在於每期策劃一個觀點鮮明的專題，先後涉及商業模式、創業與投資、周易與企業管理、營銷與市場、家族企業的成長與傳承、亞洲管理模式等。這些專題從解剖博商企業發展到剖析中國市場和海外商業模式，大大開拓了博商同學的眼界和思路，廣受博商會員的喜愛。
最初，一個叫張一凡的員工做鄭義林的助手，後來，張一凡調到了外地，秘書處隻有鄭義林一個人了。當時谘詢部有一個叫黎海波的同事，年齡與鄭相仿，他倆經常一起吃午飯，成了很好的朋友。於是，鄭義林將黎海波從谘詢部要到了秘書處，成為強有力的搭檔；後來，經濟學碩士許愛琴、海歸學子申桂寧等陸續加盟秘書處。到2011年下半年，博商會秘書處已經有6個人了。
隨著秘書處服務範圍擴大、工作任務加重，秘書處的團隊不斷擴充。目前，博商會秘書處有15個專職人員。可謂所有行業協會、商會、同學會裏“史上最龐大的秘書處”。
這15個專職人員，要負責數千名博商會會員的管理、服務，發展新會員、開展各種活動，出版雜誌、維護網站，對外溝通等等紛繁複雜的工作。在這種高強度的工作中，秘書處的工作能力、工作效率也得到了極大地提升。一開始，博商會秘書處籌備每年年會的時候，要由教務人員支援，後來，數千人的年會，秘書處都可以自己搞定了。
2010年3月25日，“清華深圳惠州同學虎年首屆聯誼會暨第一屆博商論壇”在深圳麒麟山莊舉辦，活動邀請全國政協委員、著名經濟學家蔡繼明作“兩會經濟熱點解讀”報告；邀請王濤作“中小企業九大死穴”專題演講。博商會三大俱樂部負責人要作2010年工作計劃彙報。
這是博商會秘書處成立後籌辦的第一個大型活動，時間緊、任務重、不確定因素多。此刻，博商會秘書處才隻有幾個人。在鄭義林的帶領下，博商會秘書處幾位同事加班加點，高強度工作了一個月，終於保證了活動如期成功舉辦。
這也是博商會第一次在大型活動中亮相，由於秘書處組織工作非常得力，這次活動非常成功，吸引了500多人前去聽講。此時，博商會有三個副會長，分別負責商務、行業和興趣三大俱樂部。論壇上，三個副會長也都分別作了所負責活動的介紹，讓更多人了解到博商會是做什麼的。博商會以其獨特的定位、優質的服務吸引了眾多企業家，會議現場，有200多人加入了博商會。
這次活動也成為“博商名師大講堂”的前身。
首戰告捷，顯示了博商會秘書處高效的執行力。而他們此次籌辦活動的緊張工作節奏，也成了秘書處日後工作的常態。
隨後，博商會相繼成立了多個俱樂部和球隊。