同時，由於配套的設施的不夠完善，又有缺電和管理水平不高的原因，地下水的供水能力也是很低的，也並沒有達到設計的標準，隻有達到其58%左右。
2.水利的基礎設施不夠完善，水資源的有效利用率不高，水平差異仍然較大
由於水利的基礎的設施的建設不夠完善，這也就導致了水資源不能夠比較全麵的利用。新疆地區的地下水的開采比較嚴重，北疆天山北坡經濟帶和東疆地區的地下水過度開采的現象是比較常見的，這已經導致了地下水的大麵積區域性下降。
3.農田排水係統的管理和建設的不完善以及土壤鹽漬化問題
近些年來，大多重視強調供水，大家對於排水工程的是不夠重視的，這也就導致了有些地方的排水係統出現了荒廢的現象。同時由於缺少一定的灌區檢測體係和機構，不能夠檢測和掌握土壤中的鹽分，這也就沒有辦法采取比較科學的手段來采取措施，去解決土壤鹽漬化帶來的問題。
4.農田水利的配套建設不完善，在實行嚴格的水資源管理中存在一定難度
目前，新疆的許多的縣市的測量水的設施比較的落後，不能夠做到比較科學的分水和配水；同時許多收水費的政策和條例，由於剛剛起步，所以還並不完善，，這就使得在進行水資源的管理事存在著一定的難度。
三、增強農田水利治理的一些措施
1.統籌發展，建設完善機製
統籌並謀劃在新形勢下的農田水利改革的發展工作，同時也要建立和穩定農田水利的建設投入和增長的機製。農田水利作為比較重要的部分，它承擔的供水量幾乎是全區的供水量，它對於加快農田水利建設和提高農業的用水的效率，從而對於推進新疆的農業的現代化發展有著舉足輕重的作用，為此各級黨委以及政府，應該高度關注這個問題，積極的深入調查和研究，為農田水利的發展工作謀出路。
2.成立和完善有關農田水利的管理體製
要從多方麵進行比較科學有效的管理，要鼓勵部分地區先進行試驗，從而來加快對於統籌城鄉的水資源的管理的體製，從而能夠更加科學合理，以及更加高效的利用水資源。
3.提高認識，對於水資源進行有序的開發，實現可持續發展。
必須要實施比較嚴格的水資源的管理製度，防止出現上文所說的地下水過度開采的現象，我們必須提高自己的認識，要走可持續發展的道路，合理有序的開發水資源，同時要更加科學的進行農田澆灌等一係列活動。
四、總結
農田水利是農業發展的最基本的工程，農業能健康的發展與否，其最關鍵也是農田水利，同時農村的經濟以及農村社會發展的重中之重也是農田水利。本文通過介紹了新疆區域的農田水利的現狀，問題以及困難，和一些改善的措施，來寄予了對於我國農田水利發展的熱切希望。希望在不久的將來，我們可以利用更加先進和完善的農田水利，將水資源更加全麵的使用到農業發展中去。
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