定親王如何神通廣大，也沒能挽救了林大人的病逝。就在帝國二年的年末，林大人不幸病逝了，享年六十六歲。據彙報說，大人臨終指天三呼“星鬥南”，眾人不解其意。大人過世之後，朝廷賜其太子太傅，以總督例賜恤，並且宣布以往一切處分悉行開複，諡文忠。
為表彰林大人殊功，彰顯愛國敬業大臣的楷模，定親王帶領部分文武大臣晝夜兼程奔赴福州，親自主持了大人的葬禮，並題寫祭文墓誌銘等。又將朝廷諭令，以及萬兩紋銀交到了林家人之手，以資助其家庭生活開銷。同時還明確規定地方政府負責了林大人故居的維修，墓地的建設保護等工作，可以說盡最大可能的處理了林大人身後事宜。
諸事安排妥當，問及林大人臨終遺言，尤其聽說大人死前指天高呼“星鬥南”的傳聞，林公子也不得其意。後來據說有人不斷推測，得出了似乎不很確切的兩個版本的解說。
一個傳聞是：林大人主政廣州的時候疝氣舊病發作，大商人，曾經與洋人勾結的伍豪官極力建議林大人延請西醫治療。開始的時候，大人很是忌諱洋醫生，更不會放下架子到洋人的醫館無看病，但是病魔折騰之下，隻好以伍豪官代替自己向當時的洋醫生“新豆欄洋醫局”的伯駕為他開具藥方子。伯駕拒絕了林大人的要求，並且解說一番西醫治療的原理，要求他親自到醫館進行診治手術，起初遭到了林大人回絕。
再後來，林大人發現了洋醫生為同樣犯有疝氣的病人綁紮的疝氣帶，加上疝氣折磨難耐，竟然托人之名，綁上了疝氣帶，果然覺得有效果，據說曾經回信致謝伯駕。
最後竟然托他人名義綁上了疝氣帶，並回複伯駕，說道疝氣帶的好處。
疝氣帶帶來的好處，使得林大人接受了洋醫生治療，然後不久就因病而死，而且死前還大瀉不止，林大人是否懷疑是新豆欄的洋醫生給自己下了藥，毒害自己呢？因為福建話“星鬥南”與“新豆欄”是同音。
在名臣張之洞看來，林大人之死的確有些疑惑。他的疑慮在侄子張祖繼的《拜林則徐小像》中有：“為謝金人罷李綱，英姿想見讋重洋，傷心新豆闌猶在，竟死奸民一寸香。”後麵注釋曰：“‘新豆闌’廣東要地，林公臨歿連呼之，人訛為星鬥南。孝達公（張之洞）蒞此，始悟其語，恐世不知，告予記之。”那意思是：林大人死前三呼“星鬥蘭”是人們誤解了他的本意“新豆欄”的奸人害了他的性命，後來張之洞大人主事廣東才領悟了其中含義，囑咐詩人記下來，並且示之後人。
也因此，當年林大人曾經聘用過十三行廚師鄭發，而林大人懷疑被這些人串通起來毒害自己，故臨死醒悟過來，大呼“新豆欄”而氣絕身亡，也成為了一種版本。而且後人多數信任林大人是被洋人買通的漢奸所毒死的。
另有版本說，林大人被遣戍伊犁時候，了解了西北的鄂羅斯的威脅，而恰恰此國與大清邊疆線上萬裏，既在星鬥之北，常有對我星鬥之南的野心，不得不引人關注。林公經常夜觀天象，憂慮北方敵寇威脅，常憂慮在心。據說後進之學向林公請教治國方略，林公明確表示：“英易與耳，終為中國患者，其鄂羅斯乎！”那意思是說，英夷好對付，因為他們離著我國十萬八千裏，真正打起來那可占不到便宜的，而真正對我國威脅巨大的，應該是鄂人。又因為中俄之間在四五十年代沒有什麼大的衝突，時人也就忘記了它的存在，它對我西北疆域的覬覦，這就更加讓林公擔憂，故而臨死之際都在警示人們，不忘西北威脅。
現如今物是人非，定親王自然沒有忘記列強對我疆域的威脅，因而勵精圖治，先發製人，解決了不少原本曆史上讓國人痛心的國土淪喪，洋貨肆虐，大量賠款等不公正待遇，反而在很多方麵超越了不少傳統列強，比如疆域安定，比如機器生產，比如外貿昌盛，比如海軍實力強大等等。但是卻也沒有忘記對於宵小陰謀手段的懷疑，因而借著此次東南之行，倒也采取了一些措施。多虧了十年布局，尤其廣州地區的明暗實力，可是沒人能夠比林小子更加強大了，短期之內就搜捕了數十名內外奸邪，經過審訊自然得到了不少有用的情報，其中也有跡象，有人曾經串通過要謀害林大人，隻是限於實力不夠強大沒能成功而已。