千人之旅分為十隊，與君子國和龍族戰士的分配基本相同，但在人員安排上，軒轅卻花費了大量的心血，因為他要組成一支絕對聽從自己的命令而完全不受蒙絡和創世大祭司影響的軍旅。因此，軒轅將把身份仍值得懷疑的所有人分到一隊之中。然後再將每隊分為十組，十人為一組，每組設立一個小頭目，每隊設立一個隊長，一位副隊長。每個小組長必須對組中隊員的訓練情況作出記錄，每半個月上報一次隊長。在山海戰士之中再設兩個副統領，每個副統領分管四隊，另外便是由軒轅指定幾個專門組織強化訓練的教頭，與那由兩百精銳戰士所組成的兩支大隊專門對其他八隊新丁進行各項技能的訓練，將這些人在七大營中所學的東西全部教出來。而這些自七大營中所選出來的兩百戰士則由軒轅親自負責，隻是這兩隊的隊長卻是分別由花猛和獵豹擔任。當然，這兩隊戰士也要接受軒轅和獵豹、花猛諸人的強化訓練。新丁隊長全都是由龍族戰士之中的高手擔任，而蛟龍和蒙絡所推薦的蒙英便是軒轅的副手，任副統領。少典神農和葉七諸人則成了教頭。
軒轅自然會在山海戰士之中大量培植親信，也隻有這樣才能將山海戰士的控製權牢牢抓在手上。
事實上，副統領並不能管多大的事，真正管事的還是隊長和統領，副統領隻是個虛銜，尤其是蒙英所掌管的那四隊，隊長全都是軒轅的親信龍族戰士，蒙英根本就管不了。當然，一時之間蒙英仍不會發現手中的權力是空的。當蒙英和蒙絡發現軒轅完全不受他們控製之時，軒轅早已將實力穩固了下來。當然，那時候大概也是蒙絡翻臉的時候。
蒙絡自不是好惹的主兒，軒轅很清楚這一點，如果蒙絡發現軒轅自始至終都在耍他、利用他，不恨得要扒掉軒轅的皮才怪。不過，這一切到最後終是無法避免的。
軒轅對每一件事情都想得極為周密，這十隊山海戰士分三個地點加強訓練，所有的訓練都是絕對機密的，不準任何不同組別的人相互交談，而且每隊中各組所訓練的項目都絕不相同，地點也不相同。因此，每組人都隻知道自己一組人接受了哪些訓練，對其他組別的人如何訓練則一無所知，隻有正副隊長清楚，連副領統也不明白當天每隊都進行了些什麼訓練，這就是軒轅想出來的絕對保密訓練法。但每個月都有十天時間是各隊集體合作訓練項目，隻有在這時，各小組人才能夠在一起交流，但僅限於合作訓練的項目。
蒙英、少典神農、蛟龍及葉七諸人不得不承認軒轅是個真正的軍事天才。
山海戰士的軍規極為嚴厲，但這群人的待遇也極好，因為這是宗廟所特訓的精銳戰士，因此在生活上比普通戰士好得多，甚至可與宗廟衛隊相比。而且這群戰士自己所獵的獵物可以獨享，不必交公。因此，每個山海戰士都為自己能進入這個組織而驕傲自豪，何況這些人大多都是依附有熊族的各部落子民，一向身份不如正統有熊子民，但在加入這個組織後，身份大大地提高了，甚至連其家人都受到他人的尊敬。就因為領導山海戰士的是有熊族英雄軒轅，且山海戰士也是有熊族未來的希望。因此，每個戰士都鬥誌極為高昂，訓練的熱情極高。何況軒轅還隔三差五地便到每隊之中激勵士氣，親自指點表現好的戰士武功，以示獎勵，有時對表現突出者還獎予一斤熟牛肉和一壺酒，使得戰士之中人人爭先進，人人欲表現得更優異。
軒轅還施行每隊與每隊之間作整體的比賽，在相同的項目上，小組與小組也有比賽，拔尖者整體有獎。他所製定的一些獎罰分明的製度使得山海戰士整體充滿了無盡的活力和鬥誌，如果讓創世大祭司和蒙絡親見，定會驚訝不已，更不會懷疑軒轅的豪言壯語。但蒙絡和創世大祭司很難知道其具體情況，在新丁訓練之時，便是副統領也無權幹涉和過問，這是軒轅親自下的命令，由此可見副統領的權力極有限。因此，軒轅並不怕蒙英深知山海戰士的秘密，何況便是身為副統領也不能將內部秘密外漏，否則同樣以軍法處置。
這些日子，軒轅自不會忘了與外界聯係，他身邊有韓雁和始鳩兩人，以飛鳥與外界通書，方便快捷至極。韓雁擅養雁鷹、鴻雁，雁鷹乃極為凶猛的飛禽，可在海中叼得大魚為食，便是大鯊魚也敢攻擊。若是有一群雁鷹飛臨，便是大鯊魚也會害怕。此鷹體大翅闊，幾可與始鳩所養靈鳩相比。以雁鷹傳信，安全至極，因為一般鳥雀見了都駭然走避。不過，雁鷹沒有鴻雁那般富有靈性，它隻會記得某一條或幾條路線，但鴻雁則可以很快熟知主人所在環境。因此，除了像範林和各固定部落才會用到雁鷹，其他諸如蓋山氏和君子國則以鴻雁傳書。而靈鳩則能分敵我雙方，就能清晰地認出主人來。因此靈鳩可專針對某一人送信，極為安全方便。