水環境汙染直接或間接地影響人體健康是人們普遍關心的問題。水環境汙染對人體健康的影響主要有以下幾方麵。
1.急性或慢性中毒
水體受化學有毒物質汙染後，通過飲水或食物鏈便可能造成中毒，如甲基汞中毒（水俁病）、鎘中毒（骨痛病）、砷中毒、鉻中毒、氰化物中毒、農藥中毒、多氯聯苯中毒等。鉛、鋇、氟等也可對人體造成危害。這些急性和慢性中毒是水汙染對人體健康危害的主要方麵。
2.致癌作用
某些有致癌作用的化學物質，如砷、鉻、鎳、鈹、苯胺和其他的多環芳烴、鹵代烴汙染水體後，可以在懸浮物、底泥和水生生物體內蓄積。長期飲用含有這類物質的水，或食用體內蓄積有這類物質的生物就可能誘發癌症。有些飲用以地麵水為水源的自來水的居民患癌症的死亡率較飲用地下水為水源的自來水的高，這是因為地麵水受汙染較地下水為重。
3.以水為媒介的傳染病
人畜糞便等生物汙染物汙染水體可能引起細菌性腸道傳染病，如傷寒、副傷寒、痢疾、腸炎、霍亂、副霍亂等。腸道內常見的病毒，如脊髓灰質炎病毒、柯薩奇病毒、腺病毒、腸弧病毒、傳染性肝炎病毒等，皆可通過水汙染引起相應的傳染病。某些寄生蟲病，如阿米巴痢疾、血吸蟲病、賈第蟲病等，以及由鉤端螺旋體引起的鉤端螺旋體病等，也可通過水傳播。
4.間接影響
水體汙染後，常可引起水的感官性狀惡化。例如，某些汙染物在一般濃度下，對人的健康雖無直接危害，但可使水發生異臭、異味、異色、呈現泡沫和油膜等，妨礙水體的正常利用。銅、鋅、鎳等物質在一定濃度下能抑製微生物的生長和繁殖，從而影響水中有機物的分解和生物氧化，使水體的天然自淨能力受到抑製，影響水體的衛生狀況。