李世民為尚書令、右翊衛大將軍，進封秦王。適時薛舉占據涇州，李淵任命李世民為西討元帥，進位雍州牧。沒過多久，李世民身染重疾，諸位將領被薛舉打敗。在李世民患病之際，複又屯兵於高坑城，雙方大約相持兩個月有餘。正在這個緊要關頭，薛舉突然暴死，他的兒子薛仁杲率其部眾請求開戰，李，民按軍不動。又過了數日，薛仁杲糧草用盡，軍心動搖，李世民終於等到了時機。於是便命令出兵。薛仁杲出城迎擊，後戰敗落荒而逃。李世民緊追不舍，至其城下，薛仁杲隻好出降。事畢班師回朝。唐王李淵派遣李密勞軍。李密初見李世民十分震驚，不敢仰視，退後讚歎道：“真英主也。”很快，拜右武候大將軍、太尉、使持節、陝東道大行台尚書令，詔蒲、陝、河北諸總管兵皆受其節度。又數月，鎮長春宮，進拜左武候大將軍、涼州總管。是時，劉武周占據並州，宋金剛攻陷滄州，王行本占據蒲州，而夏縣人呂崇茂殺縣令響應劉武周。李淵感到十分恐懼，於是便詔諸將棄河東以守關中。李世民認為不可這樣做，願得兵三萬可以破賊。李淵於是悉發關中兵增援李世民。一個月後，出龍門關，屯於柏壁。數月後，擊敗宋金剛於柏壁。宋金剛敗走介州，李世民緊追不舍，夜馳二百裏，宿於雀鼠穀之西原。軍士皆饑，李世民不食者二日，行至浩州乃得食，而這個時候宋金剛的將領尉遲敬德、尋相等皆來降。劉武周恐懼，奔於突厥，其將楊伏念舉並州降。李淵遣蕭瑀火速趕往軍中拜李世民為益州道行台尚書令。不久，討伐王世充，敗之於北邙。數月後，竇建德率兵十萬支援王世充，李世民擊敗竇建德於虎牢，執之，王世充於是也跟著投降了。又一月後，凱旋而歸，李世民身被金甲，陳鐵騎一萬、介士三萬，前後鼓吹，獻俘於太廟。李淵因為李世民功高，古官號不足以稱，乃加號天策上將，領司徒、陝東道大行台尚書令，位在王公之上，增邑戶至三萬，賜袞冕、金輅、雙璧、黃金六千斤，前後鼓吹九部之樂，班劍四十人。
又一年，討伐劉黑闥於洺州，敗之。劉黑闥既降，已而複反。李淵很憤怒，於是便命世子建成取山東男子十五以上悉坑之，驅其小弱婦女以實關中。李世民勸諫，以為不可，遂已。加拜左右十二衛大將軍。數月後，突厥寇邊，李世民率軍迎戰，從百騎與其可汗談判，乃盟而去。又一年，進位中書令。想當初，起兵太原，非其本意，而事出李世民。及取天下，破宋金剛、王世充、竇建德等，李世民戰功赫赫，而李淵多次私底下想立李世民為繼承人。身為世子的李建成害怕恐懼，與齊王元吉謀害李世民。可這個時候的李世民還是沒有拿定主意。在大唐的江山和骨肉親情這二者之間究竟應該怎麼取舍呢？當然了公私還是分明的，雖然於公而言就要大義滅親，但作為骨肉親情的李世民又根本下不去手。他究竟應該何去何從呢？他陷入了進退兩難舉步維艱的境地。
對於蕭美娘這個女人李淵還是有耐心的，但還是因為遲遲得不到這個女人的芳心而心急如焚心亂如麻。看來對付這樣的一個女人應該使用一些計謀是可以的。蕭美娘是一個性子剛烈的女人。她對皇帝楊廣還是比較忠貞的。當然了為了太子楊昭她是不惜一切的。所以說李淵想要完全得到這個女人就必須抓住她的弱點和軟肋。可這個弱點和軟肋究竟在哪裏呢？李淵翻來覆去的琢磨了一番。太子楊昭已經不知所蹤，應該是凶多吉少，而現在唯一的希望就是楊侑。而且蕭美娘對這個嫡傳孫子更是喜歡的很。可以說是頂在頭上怕嚇到含在嘴裏怕化了。本來人都有這個習慣。隔輩人是分外親近的。更何況眼下沒有太子楊昭的一點消息，這個楊侑就是蕭美娘的全部希望所在，當然了也是大隋的未來和明天。更何況這個李淵已經尊奉楊侑為隋恭帝。雖然李淵這個人有些跋扈張狂，但畢竟還沒有亂了君臣的禮儀和法度。再怎麼說這江山還是掌握在楊家的手裏。蕭皇後仿佛看到了一絲希望，但這種希望很快就蕩然不存了。因為李淵變本加厲愈演愈烈。蕭美娘通曉史書。她一下子就想到了三國的曹操。這個曹操雖然名為漢相實為漢賊。這個李淵竟然有過之而無不及。看來他的目的很明顯，那就是取而代之，改朝換代，隻是現在的時機還未成熟。想到這裏蕭美娘還是十分害怕恐懼。這個李淵不會效仿曹丕那樣強迫楊侑退位吧。這也是她最擔心的地方。
對於挽救大隋的天下她這個女人是責無旁貸的。因為她是皇帝楊廣的皇後，最重要的江山是在他們的手裏丟掉的。她必須承擔起這個責任來。蕭美娘在心裏是非常憎恨李淵的。俗話說的好，兔子還不吃窩邊草呢。可這個李淵竟敢冒天下之大不韙。論起輩分這楊廣和李淵還是兩姨的表兄弟，這個人也太厚道了。當初楊家對他相當不薄，可這個李淵卻恩將仇報。蕭美娘甚至想把這個人碎屍萬段方解心頭之恨。可現在卻無能為力無可奈何。