［檢查診斷］
根據各種類型的菌痢特點。檢查診斷也有一定差異。
普通型茵痢。
腹部體檢可有左下腹壓痛。糞便檢查、大便培養、用間接熒光免疫法檢測痢疾杆菌抗原可協助診斷。
中毒型菌痢。
可分為迅速發生休克的休克型；以顱內壓增高、腦疝、呼吸衰竭為主的腦水腫型：以及二者兼有的最為凶險的混合型。采集糞便鏡檢有助於早期診斷。
慢性型茵痢。
其中慢性遷延型大便常常帶有黏液。左下腹壓痛，乙狀結腸可有增厚。大便培養可助診斷。
慢性急性發作型，在症狀時好時壞的漫長過程出現急性症狀，大便培養得到與過去相同的菌型。而慢性隱匿型菌痢通常有痢疾史。長期無症狀，但大便培養可發現痢疾杆菌。結腸鏡檢查有腸黏膜充血、水腫、潰瘍，常有瘢痕、息肉等。
為進一步確診，化驗檢查是必不可少的手段，通常有以下內容。
大便鏡檢：成堆膿細胞或紅、白細胞及吞噬細胞。白細胞每高倍視野在15個以上時，須綜合病史、臨床考慮診斷。臨床懷疑中毒性菌痢而無腹瀉者宜用冷鹽水或肥皂水灌腸獲取標本。
大便培養：床邊采標本，陽性率約50％—60％。
血白細胞計數及中性粒細胞增高。
快速病原學診斷：免疫染色法、熒光菌球法、熒光抗體測定，有助於早期診斷。
［西醫藥治療］
西醫藥治療通常有退熱、止痙、抗菌素、抗休克等。但根據不同類型，在治療中也各有側重。
普通型菌痢。
應根據糞便細菌培養和藥物敏感試驗選用抗菌藥物。無發熱、中毒表現者可予氟派酸，每次0.2—0.3克，每曰3—4次；或氧氟沙星、環丙沙星；或複方新諾明每次1克，每目2次。腹痛、裏急後重者給予普魯苯辛，每次15毫克，每日3次。高熱者應及時降溫。
中毒型茵痢。
多采用兩種抗生素聯合治療，如環丙沙星0.2—0.4克，靜滴，每日1—2次；或用氧氟沙星靜滴。
降溫可用安痛定、柴胡注射液每次2毫升，肌注。過高熱伴驚厥者應使用亞冬眠療法，氯丙嗪、異丙嗪各50毫克，肌注或靜滴，配合物理降溫。高熱、休克、中毒表現明顯者可短期應用氫化可的鬆靜滴。
如有休克症狀時，可參照以下三種治療方法：
擴容、糾正酸中毒治療：可予低分子右旋糖酐10毫克/千克/次，靜滴；5％碳酸氫鈉3～5毫升/千克/次，稀釋至1.4％，靜推或靜滴，1/2—1小時內輸入，繼續再給等量含鈉溶液，第一小時總量給予15—20毫升/千克，第二、八小時給8—10毫升/千克，以後兒童60—80毫升/千克/日.嬰兒80—100毫升/千克/日。
改善微循環：可予654-2，1—3毫升/千克/次靜注，每隔1五分鍾1次，至麵色轉紅，循環好轉，血壓回升後，延長至30—60分鍾1次，血壓穩定後改為2—4小時1次，並逐漸減少藥量，24小時內停用。
強心治療。
慢性型茵痢。
堅持按療程、聯合用藥原則，盡可能根據大便培養、藥物敏感試驗或既往用藥療效選用抗菌藥物。可用氟派酸每次0.2克，每日4次I力口慶大黴素8萬u，肌注，每日2次；加麗珠腸樂每次1克，每日2次。
大便常帶血或乙狀結腸鏡檢黏膜潰瘍經久不愈者可保留灌腸治療。
［中醫藥治療］
中醫治療時，根據症狀及脈象將本病分為幾種類型，然後進行辨證論治。
按照中醫的理論，急性菌痢相當於“濕熱痢”；中毒性菌痢相當於“疫毒痢”；慢性菌痢相當於“虛寒痢”。
急性茵痢。
☆症見下痢赤白，腹部陣痛，裏急重重，惡心嘔吐，渴不思飲，小便短赤，且苔黃膩，脈濡數時為濕熱痢。適宜用清熱利濕，理氣和血之法治療。
可用香連丸、木香檳榔丸、抗菌痢片等。
☆症見發病急驟，或起病不下痢，唯高熱口幹，頭痛煩躁，甚至昏迷抽搐，腹痛，裏急後重明顯，且舌質紅絳，苔黃，脈滑數；嚴重者，四肢厥冷，脈微欲絕時為疫毒型。適宜用清熱解毒，涼血醒神之法治療。
可用穿心蓮片、紫金錠、玉樞丹、紫雪丹、牛黃安宮丸等，病情嚴重者不得不及時搶救治療。
慢性菌痢。
症見下痢時發時止，或輕或重，發時便下膿血，腹痛喜溫喜按，裏急後重；平素大便或秘或溏，手足不溫，倦怠畏寒，且舌質淡，苔白或膩，脈沉弱無力時為虛寒痢。適宜用溫中祛寒，健脾化濕之法治療。
可用瀉痢固腸丸、痢疾奇效丹等。
［飲食療法］
大蒜3—4瓣去皮搗成泥。加醋適量。一日二次，連服3—4天，可治急性痢疾。