為防治病蟲害、雜草，直接向土壤施入農藥，或是農作物噴灑劑的多餘部分直接撒落在地麵，以及漂浮在大氣中的農藥經降雨而落於地麵，均可導致農藥汙染土壤。由於土壤的汙染必然導致對農作物的汙染，土壤中的農藥通過農作物根部吸收，再經過植物體內的遷移、轉化等作用分配到整個作物。有的作物食用部分在土壤下麵，如花生、土豆、山芋、芋頭等，被殘留農藥汙染的可能性更大。因此，人們長期食用農藥殘留量較高的食物，微量農藥可在體內逐步蓄積，使人體生理功能逐步發生變化，從而引起慢性中毒。這種中毒來勢緩慢，病症很不明顯，常常被人們忽視，然而其潛在危險性很大，如DDT和六六六慢性中毒主要表現為肝大，肝細胞變性、壞死，並伴不同程度貧血、白細胞增多和中樞神經性病變。
家庭中要重視對農藥汙染或有可能汙染食物的處理，適合的烹調方法對食物去農藥殘留有一定作用，如用高壓鍋煮米飯可以提高農藥的去汙，用電飯鍋做飯可以消除50%以上的六六六殘留。
對於施灑在瓜果、蔬菜上的農藥，大部分是在葉子表麵和果皮上，一般來說比較容易清洗，蔬菜可以先在清水中浸泡一些時間，然後再仔細清洗；瓜果可以先用洗潔精一類洗滌劑清洗，然後用清水漂洗幹淨，再削皮去殼食用。例如，西紅柿上的DDT，用上述方法仔細清洗後，農藥殘留的去除率可達90%以上。有些家庭愛吃生、涼拌菜，蔬菜的清洗更要嚴格，切忌草率馬虎。