這場簡單的軍事會議並沒有商量出什麼結果，在敵強我弱，兵力懸殊的情況下，楊複生隻能先選擇守勢，尋找陰世師的破綻再進攻反攻，就目前人言，楊複生還需要等待。
會議在半個時辰後結束，眾人各自散去，楊複生這才回去安歇，在屋子裏，擺放著一個沙盤，上麵標明了武功縣城與陰世師駐地的所在，楊複生默默看了好一會，這才回去休息。
官軍方麵，陰世師回到大營之後，立刻做出了下一步的部署，三軍士兵四處搜尋，找到了附近尚未逃走的百姓，陰世師征用了其中身強力壯的男丁，令他們帶上農具、工具，在附近挖掘著泥土、灰石等物。
陰世師打算畢其功於一役，次日依舊沒有進攻，而是繼續挖掘，征集起來的民夫足有千人，他們在官軍的看管下，隻得賣命挖掘泥土，用了五日的功夫，挖掘出來的泥土堆積如山，全部放在手推車上，陰世師是打算一下子就把護城河給填平。
第六日，陰世師在色不亮之前，就讓三軍起來，準備再度攻打武功縣。
楊複生這幾日也沒有閑著，他早就知道陰世師在準備著計劃，不過楊複生並不擔憂，陰世師想要填平護城河，不是自己能夠阻擋的，事實上，由於弓箭的射程，楊複生也無法攻擊到護城河外側。
當陰世師再度準備妥當殺來，楊複生率領著眾人登上城頭，觀看著陰世師的行動。果然，經過了幾日準備後的陰世師，一副信心滿滿的樣子，大軍在城外停下，士兵們驅趕著民夫，把一框框的爛泥、灰石倒入河中。
武功縣的護城河雖又寬又深，但如果按照這樣的趨勢下去，早晚都會被填平。
寬達一百多步護城河，需要用幾日來填平？或許三日，或許五日。然而楊複生不可能眼睜睜地看著官軍填平護城河，直到弓箭的射程內。弓箭射程不足，楊複生卻還有其他辦法。他很快下達了命令。
楊複生在占據武功縣之後，除了修葺城池，就是操練著水師，盡管這個水師不是那麼正規，無論是船隻還是水師士兵的數量都很，但用在武功縣，卻是足夠了。
接到楊複生的命令之後，水師的士兵頭準備好了，等待著時機。隋軍正在忙碌著傾倒泥土，渾然沒有注意到，在西邊城門處，楊複生已經準備好了一切，隻是在等待著機會。
民夫賣力地幹了一早上，南門外的護城河被填平了大約十幾步的地方，勉強進入了弓箭的射程，不過這還不夠，弓箭過去，必然沒有什麼力道，對敵人沒有威脅。就算是放置投石車，也沒有什麼用，畢竟這一塊地方剛剛填平，泥土還十分鬆軟，如果放置了投石車，在拋射圓石的的時候，投石車很容易陷入淤泥中。所以陰世師決定繼續填平護城河，直到距離城牆五十步左右，才可停下。
看見隋軍很是賣力地填平護城河，楊複生沒有焦急，他早就知道陰世師會這樣做。他靜靜地等待著。隋軍忙碌到了響午時分，不少士兵、民夫回去吃飯，陰世師又派了另一批的士兵、民夫過來繼續做活。響午時分的太陽，越來越毒辣，不僅民夫們汗如雨下，就連監工的一部分士兵，都熱得汗流浹背，不少士兵甚至脫掉了鎧甲，露出了強壯的臂膀。