無汗用麻黃，有汗用桂枝：張仲景《傷寒論》的重要主張。李時珍認為對這一觀點，以往醫家未得確解。下麵一段話，是他的獨到心得。“寒傷營”，則無汗；“風傷衛”，則有汗。風寒均由皮毛而入，受邪氣者實是肺。麻黃、桂枝的功效皆在泄肺利氣。
朱肱：字翼中，浙江吳興人，北宋醫學家，編著《傷寒百問》，後改名《南陽活人書》，對張仲景《傷寒論》作了分類論述。
重劑：中醫對藥物和方劑按其性能，分十種類型，稱為十劑。“重劑”為十劑之一，謂“重可去怯”。即用重劑可鎮驚悸。（詳《十劑》）
桂枝本屬輕濟，用於解肌發汗，時珍論述它實際上是理脾救肺妙藥。這是對十劑思想的發展，故為“千古未發之秘旨”。
趙嗣真：古代醫家，著有《傷寒論》。
錦衣：明代皇宮禁衛軍錦衣衛，其官兵簡稱錦衣。李時珍論述他治愈一錦衣病症的醫案。
《素問》：即《黃帝內經·素問》，祖國醫學重要文獻。著重論述中醫學基礎理論。所闡述的陰陽五行、藏象、經絡、病因、病機、診法、治則等中醫學原理，至今仍指導臨床實踐。
小續命湯：中藥方劑。見《千金要方》。麻黃、防己、人參、黃芩、桂心、甘草、白芍等組成，治中風。
泄利：瀉痢。
神而明之：掌握精神實質，靈活運用。
舊五、新七：謂舊本草隻載五方，《本草綱目》新增七方。下同。舊本草指《本草綱目》依據的底本《證類本草》，新增者多從各種方劑書上收集而來，少數采自民間。
黃連 本經上品①
【釋名】王連本經支連藥性。〔時珍曰〕其根連珠而色黃，故名。
【集解】〔別錄曰〕黃連生巫陽川穀及蜀郡太山之陽，二月、八月采根。〔弘景曰〕巫陽在建平。今西間者色淺麵虛，不及東陽，新安諸縣最勝。臨海諸縣者不佳。用之當布裹挼去毛，令如連珠。〔保昇曰〕苗似茶，叢生，②一莖生三葉，高尺許，淩冬不凋，花黃色。江左者，節高若連珠。蜀都者，節下不連珠。今秦地及杭州、柳州者佳。〔頌曰〕今江、湖、荊，夔州郡亦有，而以宣城九節堅重相擊有聲者為勝，施、黔者次之，東陽、歙州、處州者之次之。苗高一尺以來，葉似甘菊，四月開花黃色，六月結實似芹子，色亦黃。江左者根若連珠，其苗經冬不凋，葉如小雉尾草，正月開花作細穗，淡白微黃色。六七月根緊，始堪采。〔恭曰〕蜀道者粗大，味極濃苦，療渴為最。江東者節如連珠，療痢大善。澧州者更勝。〔時珍曰〕黃連，漢末李當之本草，惟取蜀郡黃肥而堅者為善。唐時以澧州者為勝。今雖吳、蜀皆有，惟以雅州、眉州者為良。藥物之興廢不同如此。③大抵有二種：一種根粗無毛有珠，如鷹雞爪形而堅實，色深黃；一種無珠多毛而中虛，黃色稍淡。各有所宜。
根【修治】〔曰〕凡使以布試去肉毛，④用漿水浸二伏時，出，於柳木火上焙幹用。〔時珍曰〕五髒六腑皆有火，平則治，動則病，故有君火相火之說，⑤其實一氣而已。黃連入手少陰心經，為治火之主藥；⑥治本髒之火，則生用之；治肝膽之實火，則以豬膽汁浸炒；治肝膽之虛火，則以醋浸炒；治上焦之火，則以酒炒；治中焦之火；則以薑汁炒；治下焦之火，則以鹽水和樸消研細調水和炒；治氣分溫熱之火，則以茱萸湯浸炒；治血分塊中伏火，則以幹漆末調水炒；治食積之火，則以黃土研細調水和炒。諸法不獨為之引導，蓋辛熱能製其苦寒，鹹寒能製其燥性，在用者詳酌之。
【氣味】苦、寒，無毒。〔別錄曰〕微寒。〔普曰〕神農、岐伯、黃帝、雷公：⑦苦，無毒。李當之：小寒。〔之才曰〕黃芩、龍骨、理石為之使，惡菊花、玄參、白鮮皮、芫花、白僵蠶，畏款冬、牛膝，⑧勝烏頭，解巴豆毒。〔權曰〕忌豬肉，惡冷水。〔曰〕服此藥至十兩，不得食豬肉；若服至三年，一生不得食也。〔時珍曰〕道書言服黃連犯豬肉令人泄瀉，⑨而方家有豬肚黃連丸、豬髒黃連丸，豈隻忌肉而不忌髒腑乎？
【主治】熱氣，目痛眥傷泣出，明目，腸澼腹痛下痢，婦人陰中腫痛。久服令人不忘。本經主五髒冷熱，久下泄澼膿血，止消渴大驚，除水利骨，調胃厚腸益膽，療口瘡。別錄治五勞七傷，益氣，止心腹痛，驚悸煩躁，潤心肺，長肉止血，天行熱疾，止盜汗並瘡疥。豬肚蒸為丸，治小兒疳氣，殺蟲。大明羸瘦氣急。藏器⑩治鬱熱在中，煩躁惡心，兀兀欲吐，心下痞滿。元素主心病逆而盛，必積伏梁。好古去心竅惡血，解服藥過劑煩悶及巴豆、輕粉毒。時珍。