③孫真人：唐代醫學家、道士孫思邈。著有《千金要方》、《千金翼方》。他主張補腎不若補脾。李時珍認為補脾不若補腎。
④熏蒸脾胃：李時珍從中醫學整體觀出發，把脾胃比喻為鼎釜，腎氣比喻為火力。腎氣虛弱，則火力不強，故不能熏蒸脾胃。
⑤濟生二神丸：方劑名。見《本事方》。由破故紙半斤，炒；肉豆蔻四兩，生用，為末；肥棗肉研膏，和丸梧子大，每服六七十粒，空心米飲。加木香二兩，名三神丸。
⑥肉豆蔻：又名肉果。《本草綱目》草部芳草類。藥用其種子，去殼隻用肉。性溫、味辛。有溫中止瀉的功能。
⑦斡（wò）旋：調和矛盾。
⑧倉廩（lǐn）：倉庫。
香附子乃氣病之總司①
〔時珍曰〕香附之氣平而不寒，香而能竄。其味多辛能散，微苦能降，微甘能和。乃足厥陰肝、手少陽三焦氣分主藥，而兼通十二經氣分。生則上行胸膈，外達皮膚；熟則下走肝腎，外徹腰足。炒黑則止血，得童溲浸炒則入血分而補虛，鹽水浸炒則入血分而潤燥，青鹽炒則補腎氣，酒浸炒則行經絡，醋浸炒則消積聚，薑汁炒則化痰飲。得參、術則補氣，得歸、芐則補血，得木香則疏滯和中，得檀香則理氣醒脾，得沉香則升降諸氣，得芎、蒼術則總解諸鬱，得子、黃連則能降火熱，得茯神則交濟心腎，得茴香、破故紙則引氣歸元，得厚樸、半夏則決壅消脹，得紫蘇、蔥白則解散邪氣，得三棱、莪荗則消磨積塊，得艾葉則治血氣暖子宮，乃氣病之總司，②女科之主帥也。飛霞子韓雲：③香附能推陳致新，故諸書皆雲益氣。而俗有耗氣之說，宜於女人不宜於男子者，非矣。蓋婦人以血用事，氣行則無疾。老人精枯血閉，惟氣是資。小兒氣日充，則形乃日固。大凡病則氣滯而餒，故香附於氣分為君藥，世所罕知。臣以參、芪，佐以甘草，治虛怯甚速也。遊方外時，④懸壺輕賚，治百病黃鶴丹，⑤治婦人青囊丸，⑥隨宜用引，輒有小效。人索不已，用者當思法外意可也。黃鶴丹乃銖衣翁在黃鶴樓所授之方，故名。其方用香附一斤，黃連半斤，洗曬為末，水糊丸梧子大。假如外感，蔥薑湯下；內傷，米湯下；氣病，木香湯下；血病，酒下；痰病，薑湯下；火病，白湯下。餘可類推。青囊丸乃邵應節真人禱母病，⑦感方士所授者。方用香附略炒一斤，烏藥略炮五兩三錢，為末，水醋煮麵糊為丸。隨證引用，如頭痛，茶下；痰氣，薑湯下；多用酒下為妙。（《莎草、香附子·發明》校點本第二冊，第890頁）
【注釋】
①香附子：《本草綱目》草部芳草類。莎草科植物莎草的塊根。味辛、甘、微苦、性平。能疏肝理氣，調經止痛。時珍分析香附兼通十二經氣分，肯定其為氣病之總司，關鍵在於有不同佐使，則有不同的功效。總結了香附“隨佐使而見功”的經驗。
②氣病之總司：氣分諸病的君藥。
③韓：明代醫學家，號飛霞子，撰《韓氏醫通》、《方外奇方》。
④遊方外：方外，指世俗之外。遊方外，指道士漫遊於諸宮觀之間。
⑤黃鶴丹：相傳仙人在黃鶴樓傳授的仙方。
⑥青囊丸：傳為方士所授妙方。
⑦邵應節：道士。
菊能除風熱，益肝補陰①
〔時珍曰〕菊春生夏茂，秋花冬實，備受四氣，飽經露霜，葉枯不落，花槁不零，②味兼甘苦，性稟平和。昔人謂其能除風熱，益肝補陰，蓋不知其得金水之精英尤多，能益金水二髒也。③補水所以製火，益金所以平木，④木平則風息，火降則熱除，用治諸風頭目，其旨深微。黃者入金水陰分，白者入金水陽分，紅者行婦人血分，皆可入藥，神而明之，存乎其人。其苗可蔬，葉可啜，花可餌，根實可藥，囊之可枕，釀之可飲，自本至末，⑤罔不有功。宜乎前賢比之君子，神農列之上品，⑥隱士采入酒斝，騷人餐其落英。費長房言九日飲菊酒，⑦可以辟不祥。神仙傳言康風子、朱孺子皆以服菊花成仙。荊州記言胡廣久病風羸，飲菊潭水多壽。菊之貴重如此，是豈群芳可伍哉？（《菊·發明》校點本第二冊，第931頁）
【注釋】
①菊：《綱目》草部草類。菊科多年生草本。入藥主要用花，根和葉亦有藥效。菊花，味甘苦，性涼。入肺、肝經。功能疏風，清熱，明目、解毒。李時珍著重闡發了菊花能除風熱，益肝補陰的原理。指出它得金水之精英多，補水所以製火，益精所以平木。
②不零：不凋落。
③益金水二髒：即補肺髒和腎髒。中醫五行學說，肺屬金，腎屬水。
④補水所以製火，益金所以平木：中醫五行學說：水克火，金克木。菊能補腎水，故可伏心火；益肺金，故能平肝木。