首都杜尚別市設有20多家綜合、專科醫院及醫療科研機構，市內有中亞規模最大的綜合醫院，中亞最大的診斷中心，4家杜尚別市屬綜合性臨床醫院（第一、二、三、五醫院）、市急救醫院、共和國眼科醫院、傳染病醫院、皮膚病醫院、兒童結核病醫院、過敏症中心、胃腸病研究所、內分泌防治所、性病防治所以及4家產科醫院和數家口腔醫院。該市的醫療服務水平高於其他地區，在全國平均水平之上。現階段每萬人病床占有量為88.9張，萬人擁有護理人員數量是70.5人，萬人醫生擁有量更是高達77人。全國將近5000名女醫生中有近一半人都在杜尚別各醫療機構中工作。杜尚別市第五醫院，1953年在杜尚別醫學城（醫科大學）內建立。1974年由塔吉克斯坦著名醫生、醫學院士、胸外科創始人卡米爾在此醫院內創辦了心血管外科中心，其規模為100張病床。卡米爾從1960年成功地做第一例心髒手術始，至1981年去世，一生共實施了300多例心髒手術，培養出了20多位醫學博士、副博士。該中心治療心血管疾病的水平在全國首屈一指，有醫務人員100多人，其中多數是醫生。塔吉克獨立10多年來該中心是全國唯一更新過醫療設備的醫院。1999年塔吉克斯坦政府從伊斯蘭開發銀行貸款600萬美元用於該中心的醫療設備更新改造，借此得以購進一批國外最新水平的醫療器械。
2001年該國用國際各種金融組織的貸款投入衛生保健事業的發展，合計95.77萬美元，2001年該國仍在營業的醫院有443家，床位有41362張，還有1040家門診部和專科診所、1676個醫務所、123個急救站。衛生保健人員的平均月工資為9.79索莫尼。
在科研方麵，塔吉克斯坦科學院成立於1951年，該院集中了一批優秀科技人才，共有780名科學工作者，其中院士30人，通訊院士58人，博士117人，副博士353人，外籍院士10人。科學院下設17個學科分類研究所，還有帕米爾分院（分院包括兩個研究所）、苦盞科學中心以及其他自然科學、技術科學、醫學和社會科學等科研機構。此外，高校裏還有一批科技人員、博士和副博士。科學院研究機構由三大類組成，物理、數學、化學、地質學研究機構；生物學和醫學研究機構；社會科學研究機構。科學院下設數學、技術物理、天體物理、化學、地質、抗震建築和地震（簡稱地震所）、材料學研究室、植物、動物和寄生生物學、植物生理和遺傳學、胃腸病、生物、語言文學、東方學和文字遺產所。科學院主席團設人口研究中心、科研工作協調委員會、術語委員會、幹部培訓處、出版社、圖書館。在社會科學領域，出版發行了六卷本《塔吉克人民曆史》叢書。非科學院係統的科研所有塔吉克農科所，附設4個試驗站、果樹葡萄和蔬菜研究所、土壤研究所、畜牧和獸醫科研所、塔吉克養羊業科研所、流行病學和衛生學研究所、塔吉克水利技術和土壤改良研究所、科學技術和技術經濟情報科研所、計劃經濟和數學方法研究所、塔吉克自動化係統研究所、建築基礎和地下建築研究所、塔吉克農業經濟和體製研究所、塔吉克馬鈴薯研究所等。另外，還有建築藝術研究院、建築研究院、工程研究院、成人教育研究院、醫學研究院、音樂研究院、教育科學研究院及自然科學研究院等。
在對外科技交流方麵，科學院積極開展與遠、近鄰國家的廣泛合作，與許多國家科研機構簽訂了合作交流協議。與俄羅斯簽有科學院合作框架協定，根據協定，與俄羅斯開展科技合作，主要是選派年輕幹部去俄羅斯聖彼得堡等地重要科研機構參加培訓。此外，依靠有關國家提供的資金讚助，派員去德國、巴基斯坦、伊朗、土耳其、美國、印度、瑞士、日本、中國等國家參加各種學術交流和專業培訓。接受聯合國教科文組織的援助，與美國科學家開展植物生理學方麵的研究合作，與德國科學家開展化學領域的研究合作。在自然科學領域，加強對傳統優勢基礎學科的研究，如數學、天體物理學、物理、化學、生物等學科的研究，同時加強對能源再生、淨水問題、生物和基因工程問題、環境問題等新學科和新問題的研究。在社會科學領域，側重研究本民族語言、文學史、塔吉克族曆史、經濟改革等。1925年創建的出版社曾是1964年前塔吉克斯坦國家出版社的前身。