加強學生實驗。自然科學課程實驗的目標包括：激發學生學習的興趣；幫助學生形成概念，理解和鞏固學科基礎知識；訓練實驗技能，包括使用儀器、藥品等實驗基本操作技能和選用器材進行裝置的能力，繪製儀器裝置簡圖和生物圖形的技能等等；理解並掌握一定的實驗方法，如驗證、探索、模擬等；實驗研究能力，包括觀察能力，思維能力，獲取信息的能力，報告實驗結果的能力等等；知道科學實驗的特點是人為地控製研究對象，在特定條件下對自然現象進行觀察研究，學會簡單的實驗原理分析和實驗過程設計；學會在實驗中運用比較、歸納、分析、綜合、演繹、假說以及數學方法等科學方法；行為規範教育，科學態度培養。
2.課程實施的困難及應對措施
綜合科學課程與我國傳統的分科科學課程有著本質性的區別，習慣於分科課程的教師一下子難以適應，而且綜合課程對教學條件、教學組織、教師安排、教學評價等也有不同的要求。
改革的主要困難可以歸結為五個“不”：教師不適應。初中科學教師單科畢業的，在相關的知識和技能等教學最基本的要求上存在嚴重的不足，日常教學有困難，觀念上難以接受。校長不支持。許多初中校長擔心教育質量下降，影響到學校的升學率，而高中校長則擔心綜合科學課程將降低學生對知識的掌握程度，會影響學生高中階段的學習。設備不配套。綜合科學課程需要較多的課程資源的支持，但當時配套一時跟不上。家長不放心。
許多家長擔心孩子初中學了綜合科學課程，在知識和技能方麵難以打下良好的基礎，會影響高中階段的學習，高考考不好。社會不理解。社會各界人士對綜合科學課程缺乏足夠的了解，持批評意見者居多，特別是一些科學技術專家。
麵對這種局麵，1991年《自然科學》第一版問世後，曾經做過兩次大的調整。
一次是1993年，把生物的內容適當集中在初一年級，物理、化學內容適當集中在初二年級。另一次是1995年的調整，再次使物理、化學相對集中，利於分合。既適合一個教師三年從頭教到底，也利於一個教師教一年或一學期。這樣一來，教科書的綜合程度越來越低。
的直接過問下，經過浙江省教委反複研究決定，除鼓勵和支持大部分市、縣（市、區）繼續使用綜合科學教科書外，允許少部分市、縣退出綜合科學課程試驗。分科教科書和綜合教科書的並用給改革造成了消極的影響。綜合科學課程的改革在克服各種阻力中艱難前進。
隨著我國新一輪基礎教育課程改革的實施，浙江省科學綜合科學課程的改革得到了極大的發展，為全國科學教育改革作出了不可磨滅的貢獻。
3.課程改革的反思
浙江省《自然科學》的課程改革雖然取得了一定的成績，但還是存在諸多問題的。許多人進行過多項調查和研究，調查結果表明，綜合科學課程改革中的問題主要集中在教師和教科書上。
對浙江省實施綜合科學課程中教師情況的調查發現，有67%的人認為教師的素質是目前推行綜合科學課程的主要障礙。也有人在1995-1996年，對舟山市15所中學86名教師進行調研，結果有83%的教師感到難以適應綜合科學教學的工作。1998年10月至1999年4月間，采用問卷調查和實地訪談的形式，調查了113名初中科學教師和4個市級教研或培訓機構，81%的被訪者認為，影響綜合科學課程開設的最大障礙是教師素質。由此，大多數學校采用“綜合課程分科教”的方式。
分科科學教師從事綜合科學教學工作在素質方麵有哪些欠缺呢？首先是缺乏其他的科學學科知識和有關的實驗技能，其次有教學方法和教學觀念的不適應，可能更為嚴重的是知識結構的缺陷，缺乏對自然科學的整體把握，思維方式仍然是單一學科式的，缺乏把已有的知識整合起來的意識和能力。教師對綜合科學課程改革的不接受，在思想上沒有認同綜合科學課程是最嚴重的問題。
就教科書來講，歸納起來，有關的問題主要有七個：脫離不了我國傳統的知識本位科學課程的影響，綜合科學教科書保留物理、化學所有的或絕大部分知識點，刪減了部分生物和地球科學的知識點以及少量的重複內容，再加上需要增加能源、生態、環境和STS相關內容，結果使知識點有增無減；知識本位的綜合科學課程難以對物理、化學、生物和地理的內容做到融合，導致“拚盤”現象；生物、地理的知識點增刪幅度較大，內容組織變化也較大，而理、化的知識點未減少，基本上套用人教社教科書模式，整套教科書的風格不統一；由於教科書向現實“妥協”，各學科內容相對集中，造成了知識模塊安排和難點分布的不合理；教科書編寫者基本上是原來的學科專家或教師，不但對各學科不能兼通，而且對本學科的進展、STS、科學方法和科學思想缺乏充分了解，結果使本來應該聯係起來的內容未能聯係在一起，科學方法教育、能力培養未能與知識傳授相結合起來進行；教科書采用降低理論的嚴密性和學生使用學科語言表述的要求、降低計算的要求以及對有些較難的概念、原理和計算采用分步達成的方法來降低難度，但這些方法並未被教師所接受；缺乏科學的課程評價，未能對綜合科學教科書進行有說服力的評價，無法消除改革中的爭議。