蜥蜴類和蛇類
蜥蜴和蛇類是數量最多、種類最多樣化的現代爬行類。可能有3800種蜥蜴和3000種蛇，而喙頭類僅有一個現生種，現代的鱷約有25種，龜鱉類有400餘種。有鱗目在爬行類中的這種巨大的優勢很可能從恐龍時代結束以來一直保持著。
有鱷目的起始可以追溯到三疊紀，即南非早三疊紀的原蜥蜴及其親屬，不列顛三疊紀晚期的孔耐蜥和北美三疊紀的依卡洛蜥。根據原蜥蜴的解剖特征，可將其歸屬在始鱷類中（因其方骨上端不是可動的與鱷骨的關節），同時，它也發展了似蜥蜴的各種特征。因此，原蜥蜴是占據在祖先的始鱷類與其後裔的有鱗目之間的位置上。特別有意義的是原蜥蜴的側顳孔之下有一個完全的方軛骨弓。孔耐蜥和依卡洛蜥則都進化到方骨與鱗骨可動的階段，因此屬於蜥蜴類。
蜥蜴類的眶後鱗骨弓之上有一個上顳孔，弓下頰部是開放的，無其他的爬行類那種在軛骨與方骨之間的方軛骨弓。因此，蜥蜴類有些像改變了的雙弓類，實際上是下雙弓；方骨的下端是遊離的，使頭骨和下頜間的關節具有更大的活動性。頭骨的另外一些骨頭在蜥蜴類中消失了，特別是淚骨、後頂骨，可能還有板骨。蜥蜴類還常保留有鬆果孔，這是四足類中的一種原始構造。蜥蜴類的牙齒不生在齒槽內，而是愈合在頜骨的邊緣或內側。蜥蜴類是四足式的爬行類，通常其後足的第四趾加長。這些爬行類在快跑時，常顯示出用其長腳的外側麵向外用勁，這是推動身體前進的主要動力。這一些蜥蜴類，如北美洲西部的領蜥蜴，快跑時能用後腳站立，因此它們在運動方式上和許多已滅絕的兩足初龍類的運動方式是相似的。有鱗目在地質記錄中首次出現的兩個屬——孔耐蜥屬和依卡洛蜥屬的頭骨仍然保留著一些原始的特征，例如，仍然還有淚骨，齶骨上還有許多牙齒（後期的蜥蜴類，齶骨上沒有牙齒）。但是它們有一些方麵高度特化，胸廓部分的肋骨極度地引長了。對於這種明顯的特征唯一合理的解釋是，可能在動物生活時這些肋骨支撐著皮膜，使它能夠在樹間滑翔。這一點說明有鱗目在進化的初期階段表現出非常特殊和出人意料之外的適應性。這類適應性，標誌著脊椎動物對空中運動（滑翔）的初步嚐試。
蜥蜴類在侏羅紀沿著多種多樣的適應路線發展，並且在中生代中期和晚期直到新生代的曆史中仍然保持著這一特色。現代的蜥蜴類及其親屬——蛇類，都是現代最成功的爬行動物，它們廣泛的適應性，多種多樣的種屬和地理分布以及龐大的個體數量都可說明這一點。蜥蜴類在古生物學上最有意義的是在白堊紀時某些巨蜥類適應於在海中生活，並且發展了巨大的體形，體長可以達到10米以上，我們在前麵介紹中生代海洋爬行類時已簡略敘述過的滄龍就屬此類。
蛇類是所有爬行類中最後進化形成的，實際上是一種高度特化了的蜥蜴類。蛇類已經失去了四肢，行動要依靠身體各種方式的運動來完成，例如左右方向的彎曲運動，用肌肉作有節奏的波動向前曳行運動，螺旋式回旋的運動，以及美洲西部的響尾蛇的所謂側旋運動。蛇類的身體和尾部由於脊椎和肋骨數目的增加變得很長，內部器官的排列方麵也引起了許多適應性的進化。和體形上適應同樣引人注意的是頭骨的變化，這一部分成了一種高度活動的構造，具有長得可以活動的方骨，與下頜骨背麵有兩個關節。前頜骨並不愈合，而是鬆動地用韌帶相連接，因此蛇口能張得很大。當蛇類咬住一個動物之後，先把它整個吞入口內，再把頜部張開，因此蛇類常能吞咽比其本身直徑大得多的動物。
專題講述
鳥類與恐龍的關係
有些古生物學家將鳥類看做恐龍的後裔，甚至有些科學家認為鳥類本身就是恐龍，是恐龍這個古老家族中唯一殘存下來的成員。
鳥類的祖先是始祖鳥，大小如烏鴉。1861年，它的化石在德國巴伐利亞索倫霍芬侏羅紀晚期（1.45億年前）的地層中被發現。至今已在該地找到了6具大致完整的骨架。
1993年，科學家又在索倫霍芬發現了第7塊完整的始祖鳥化石，隨後在朝鮮和中國也相繼發現了始祖鳥的化石。始祖鳥披有一身鳥類的羽毛，猛一看，外觀與現代的鳥似乎沒有多大的區別；但仔細觀察就大不相同了。