一年後，宮市——
這是一個在空間震災害中建起的城市。 ．．
吵雜的街道，喧嘩的市區，各種各樣的噪音夾雜在一起，充滿了整個宮市主要街道區的每一個角落，給人一種意外的生機勃勃之感，看起來很是平和。
然而，下一個瞬間——
“嗚嗚嗚嗚嗚嗚嗚嗚嗚嗚嗚嗚嗚…………”一陣極其刺耳的警報聲沒有絲毫前兆的響徹在宮市之內。
人們中止了一切的活動，都好像看到了史前巨獸一樣，亡命的逃進了離他們最近的避難所裏，被厚重的鋼門護在了裏麵。街道上，一棟棟建築物開始陷入了地麵中。
不久後，街道的一角處，一陣耀眼黑光包圍了這裏！
地間，隻剩下震耳欲聾的爆炸聲與猛烈的衝擊波襲向了四麵八方，摧毀著這裏所有的一切！
等到衝擊波與爆炸聲停下時，留在原地的，隻有被生生削出了一個大坑的地麵。
“剛才這裏好像生了有趣的事情，啊？”拿著相機的穿著女子高中製服的灰色短少女道。
“哪裏有趣了？搞不好這是我們來到這裏造成的啊！”穿著山伏裝，有著獸耳和大尾巴的白色“犬”娘有些驚慌的樣子。
引空間震的，是穿越了位麵，來到這個世界的幻想鄉新聞組——射命丸文和犬走椛。
“遠處有人類飛過來了哦，還是快點閃人比較好一些吧？”椛擁有“千裏眼”的能力，as的人還未到，就馬上現了。
“嗯，也是呢，笨狗你給我把耳朵和尾巴收起來啊。”文文著，隱去了自己黑色的翅膀，同時借用“千裏眼”能力給as拍了一張特寫供以後參考。
“啊……我知道的啦。”
兩人邊走邊吵吵鬧鬧著，不過，在往這邊來的，可並不隻有as，一道青色的光芒忽然籠罩了兩人。
“不好，是強製空間傳……”
然後兩人就消失了。
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時間稍作倒退，空中艦艇佛拉克西納斯（Frainus）——
這是一艘名字取自世界之樹之樹種，隸屬於拉塔托斯克（Raaskr）的空中艦艇。拉塔托斯克則是與de社捕捉殺死精靈相對的，為了與精靈對話、企求以和平的手段解決空間震所產生的災害而集結成的神秘組織。
艦橋中，幾個工作人員在盡職地操作著，坐在司令官位置上的，很奇怪的是個怎麼看都是初中生的，用黑色帶紮著雙馬尾的紅少女，嘴中還含著棒棒糖。
但這確實就是司令官本人，五河琴裏。
“分析結果出來了。”下麵的工作人員之一，綽號是≈ap;ap;1;保護監視處分≈ap;ap;g;的箕輪梢道，順便一下由於某些需要，這裏的員工都是些綽號相當不靠譜的家夥。
“和識別名〈水神（suijin）〉那時候一樣，沒有過去‘現界’記錄，沒有靈波反應，可以確認是新的…………”
“又是這樣啊，不是人類又不是精靈，還長著翅膀和獸耳獸尾什麼的，妖怪嗎？還這個世界到底又生了什麼異變啊？”琴裏抱怨著。
“那，要，怎麼做？”一邊站著的一個高中生模樣的藍男生問道，順帶一提，是看起來非常草食係的那種。
這是琴裏的哥哥，五河士道。他在該組織中有著重要的使命——封印精靈，讓精靈過上正常人的生活。目前已經成功封印了〈公主（priness）〉夜刀神十香和〈隱居者（heri）〉四糸乃兩位精靈。