撒麻耳幹，今天的烏茲別克斯坦撒馬爾罕，是河中首府，花刺子模算端摩訶末占領河中後，將首都從玉龍傑赤遷到這裏。撤麻耳幹的幅員是諸州中最大的一個，土地又是諸部中最肥沃的一個，那裏是人世間最美的天堂，這個國家，石頭是珍珠，泥土是麝香，雨水是烈酒。這裏的風景也很秀麗，環城數十裏都是園林、家必有園，園必成趣，到處都是飛泉池水，繁茂的樹木緊密相連。作為首都，撤麻耳幹的防守十分堅固，城牆不斷地加高，護城的壕塹深掘至地下水層並灌滿了水，有十一萬軍隊駐防在這裏，其中六萬人是精選的突厥勇士，五萬人是波斯的精銳部隊。另外還準備下二十頭身披鐵甲的戰象，在戰鬥中可用來帶頭衝擊敵陣，並當作馬步兵的防護。成吉思汗在剛抵達花刺子模時，就聽脫撤麻耳幹是一座堅不可拔的城市，不要說攻克它的內堡，即使打下它的外城也要花費好多年的時間，所以他在進入花剌子模後，並沒有立即直趨撤麻耳幹，而是先攻取其他地方以掃清外圍。現在撒麻耳幹的周圍地區已經基本被他占領，他便驅軍前來進攻這座固苦金湯的都城。然而算端摩訶末並沒有依靠堅固的防守來抵禦蒙古人進攻的信心。當他聽到蒙古軍節節勝利，已經開進河中地區的消息，便心灰意冷，撒麻耳幹的深溝高壘也不能振奮起他的精神。有一天他從城壕走過，竟認為壕溝沒有用處，說：“前來進攻代們妁軍隊，隻要每個人扔下自己的鞭子，這條壕溝一下子就被填平了。”百姓和軍隊聽了大為淚喪。隨後摩問末逃離撤麻耳千，退往阿姆河以南，一路上還到處散布：“你們自謀活命之計吧，蒙古軍是無法抵抗的！”他不論走到何處，都要向每一個大臣詢問，有什麼辦法能免除災難。大臣門都拿不出好辦法，他自己當然更是一籌莫展。因此在撒麻耳幹的戰爭開始之前，就注定了這座城市的抵抗不可能持久，也注定了摩訶末即將很快敗亡的命運。1220年陰曆三月，成吉思汗進抵撒麻耳幹，已經攻克訛答剌的察合台、窩闊台也率軍前來會合，此外還有大批的從各地驅趕而來的“哈沙兒”隊，其人數超過沙粒和雨滴。成吉思汗繞城紮營，最初的兩天，他讓士兵充分地休息，自己親自巡視城池，觀察地形。第三天早上，他揮師發起了猛攻。城內守軍衝出城外，與蒙古軍廝殺．互相對射，他們殺死和俘虜了一些蒙占兵，自己有一千多土兵戰死。這一天雙方多次衝殺，直到太陽落山時才各自收兵。第四天一早，更激烈的戰鬥開始了。成吉思汗親自披掛上馬，指揮軍隊將城池團團圍住；城內的守軍也全部集合起來，緊束戰袍，準備迎戰。作戰令一下，攻守雙方立即射石機和弓弩齊發，矢石橫飛．戰鬥的呐喊聲驚天震地。蒙古軍搶先占據了城門前的位置，阻擋守軍，使他們無法衝出城外進行野戰，於是守軍把大象投入戰。軀幹巨大，貌似凶神，破著鐵甲的戰象衝出城門，步兵緊隨其後，來勢猛烈。但是己有準備的蒙古軍並不後退，他們一齊向戰象射擊，打傷戰象，打亂緊隨戰象身後的步兵的陣形，戰象負傷後往回逃跑，又踏傷踏死不少自己的士兵，天黑下來，撤麻耳幹人關閉了城門。這天的戰鬥使撤麻耳幹人肝膽俱裂，他們憂慮重重，是繼續打下去，述是屈膝投降，意見發生了分歧。次日清晨，當蒙古軍正要向猶豫不決的城民重新展開戰鬥時，撤麻耳幹人終於取得了一致意意見：停止抵抗。城內的法官和教士為代表，前來晉見成吉思汗。成吉思汗安撫他們，保證投降不殺。於是他門返回城裏打開大門，放蒙古軍入城。蒙古軍立刻動手拆毀城增，直到城牆夷為平地，馬步軍可以到處自由往來為止。當蒙古軍毀掉城牆後，便將居民每百人結成一群，由蒙古軍監視，趕於城外。但允許獻城的法官、教士及其與他們有關係的人們留在城內，不受侵害。那時有五萬人因此受到保護、蒙古人又下令，凡是藏匿不出者格殺勿論，結果有不少躲在地窖、地洞裏的人被搜索出來，遭到了殺害。管埋大象的象夫去見成吉思汗，要求發給大象食物，成吉思汗他，大象養馴前靠什麼為生。他們回答說：“原野上的草。”成吉思汗下令放掉大象，讓它們自己去尋食，獲釋的大象流浪到荒野上，後來都餓死了。撤麻耳幹城的內堡中還有一批守軍在拒戰，守軍的一名將領阿勒卜汗勇敢地率領一千名決死之士衝出內堡，從蒙古軍中殺出血路．突圍而走，到算端摩訶末那裏去會合了。隨後蒙古軍把內堡圍得水泄不通，雙方矢石齊發，激戰至薄暮，城牆破摧毀，蒙古軍攻入了內堡。一千多名乎民和戰士退守大清真寺，他們用箭和火油簡作戰，力抗不降，蒙古軍也噴射石油，將清真寺及寺內所有的人焚毀，然後內堡中的人全部被趕到城外、在城外，蒙古軍將投降的突厥人和其他人分開，編為十人隊和百人隊，讓他們把前額剃成蒙古樣式，以使他們安定，消除恐懼，但是到了夜裏，這些突厥人在毫無防備中全部被殺死．共計有三萬多人。次日晨清點餘下的人們，三萬名工匠被分配紿成吉思汗的諸子、親屬，又挑選出三萬青壯年加入“哈沙兒”隊，其餘的人則在交納贖金後許其回城。契丹人耶律阿海被任命為鎮守撒麻耳幹的長官。前後八天的戰禍，使撤麻耳幹這座名城遭受了空前的劫難。曾到這裏謁見成吉恩汗的丘處機記載他的見聞說：“方算端氏之末敗也，城中常十餘萬戶，國破以來，存者四之一。”隨成吉思汗西征的耶律楚材，以詩歌形式發出了對撤嘛耳幹敗落的歎惜：“寂寞河中府，聲名昔日聞。城隍連畎畝，市井半丘墳。”