故事的起因最初是以一個叫煢拓的人的死亡展開。然後連帶出故事中的兩個重要人物，Lee和夏夕。在他們兩人共同調查的行程中，Lee發現了《灰之預言》。並意識到了這本預言的真實性，往後Lee在預言書顯示的描述中又不可否認地坦白自己愛上了夏夕。預言顯示出夏夕在台風到來後跳海自殺的消息，為了挽救夏夕的生命他卻也明白這將是無法改變自己命運的最後的戰役。於是，他把《灰之預言》有意地交給了一位名叫克南的少年。
在克南陷入迷茫之際，他迎來了一個樣貌舉止十分玩世不恭的Kits的出其不意的登場。他們通過每一條可能性的線索，各自尋找著自己需要得到的答案以及希求解除的萌生在內心當中的種種疑惑。令人驚訝的是，故事中天才少年Kits推斷出了關於L的寓意。
然而，最後改變厄運的那張王牌又將是誰？諸多的伏筆和懸念終究會隨著作者嫻熟的筆觸下那一個個飽含戲劇性的人物，逐一地為你揭開暗藏於預言背後險象環生的遊戲法則