此番劉君韜借著總兵府全麵改革的機會，將大軍裝備更換、兵力擴充、兵員補充等一係列事宜同時做了，可謂是一箭數雕，大大節省了時間。
當然，幾件大事同時進行，也讓總兵府耗費了大量的人力、物力，不但胡德興率領軍部上下熱日夜忙碌著，劉君韜也是幾乎連軸轉的處理公務，商部調撥的錢糧也是如同泄洪一般花了出去。
在此期間，軍部不但要對全山東的適齡青壯進行登記，而且還要在各州府、縣建立訓練營，並且采購海量的軍服、被褥等用品。
按照劉君韜製定但是計劃，在山東各州府設立訓練營，在各縣設立訓練點，在玉山鎮設立訓練總營。
日後，各縣征募的預備役人馬先在各地縣內的訓練點進行基礎的訓練，例如：體能、隊立條例、作息習慣、讀書識字等等，操練時間為期一個月；
而後，在各縣訓練合格的青壯便會集中到各府的訓練營中進行深度操練，這些青壯將會在各府中進行進一步的操練，例如：陣型、拳腳、熟悉火器、分別兵種、學習地理和曆史等知識等等，操練時間為期一個月；
最後，在各府訓練合格的青壯便會由軍部組織起來，全部分批拉到玉山鎮的訓練總營，這些青壯會在這裏進行嚴苛的操練。
在玉山鎮訓練總營，所有的青壯都將進行火器實射、戰陣演練、實戰模擬、生存訓練等等科目，操練的時間為期十五。
按照劉君韜的這個最新訓練大綱，山東鎮完全可以在兩、三年內，擁有十幾萬、甚至幾十萬的精銳預備役兵源，隻要劉君韜願意、總兵府錢糧足夠，便可以拉起一支支源源不斷的精銳大軍來！
景泰二年九月，經過將近一個月的整頓，軍部的改革終於走上了正軌，各軍也在劉君韜的命令下，全部開往了指定的駐紮地址。
此時各軍前往各處駐紮，兵力上還沒有完全補充完畢，所以劉君韜便以山東鎮總兵官的名義下令，山東各地的營兵全部向就近的駐紮地點集結，總兵府將對各地營兵進行整編。
各地營兵中，符合總兵府要求的兵員將會進行征訓，征訓合格之後便編入各軍之中作為補充兵員，不合格者便由總兵府發放遣散費，全部遣散回家。
各地營兵中的將官也是如此，全都需要進邪回爐重造”，要到玉山鎮進行集訓，合格者才可以根據其才能授予官職，否則也要被遣散回家。
劉君韜的這道命令發出之後，整個山東都是為之一震，各地的武將都是人心浮動，劉子安也是收集了不少消息，警告劉君韜各地有些暗流湧動。
而各地的文官也是等著看好戲，幾乎所有文官都是期盼著劉君韜和麾下將領鬧翻。
不過劉君韜卻不為所動，堅持己見，各軍也是迅速開拔到位。
與此同時，劉君韜也開始主持總兵府其餘各部的改革事宜。
首先便是對商部的改革，商部可是總兵府的“錢袋子”，隻要商部穩如泰山，劉君韜就有大把的錢糧推行自己的計劃，而不必被朝廷發下的錢糧拴住手腳。
劉君韜決定：
將工坊司整合為將作司，司丞為馬立軍，負責各類新式生產工具的研發、對現有生產工具進行改進，並且根據實際生產的需要進行專項的研發，白了這個將作司就是劉君韜設立的一個研發機構！
這個研發機構承載了劉君韜極大的期許，從今以後山東鎮除了軍事以外所有的技術積累都要由將作司完成，甚至劉君韜心中期盼已久的蒸汽機也是如此，需要在劉君韜的指點下，由將作司打造出來！
將貿易司整合為工商司，司丞為崔寧，負責商部所有工坊和商貿的籌建、管理、生產、各類專利的販賣，對山東境內以及徐州、江南等地的商事進行幹預，並且負責向已經購買了玉山鎮各類專利的商賈、士紳收取費用。