飛機維修能力影響航母艦載機的可出動率（起飛架次）。由於飛機自身的技術複雜性，以及引擎、係統和武器等緣故使得對飛機的維修變得越來越重要。飛機維修廣義上分為兩種：有計劃維修和無計劃維修。11945年，有計劃維修由“飛行前維護”、“飛行後維護”以及根據飛行小時所製定的5個“等級維護”（1～5級）組成。5級維護是最高等級的維護，需要拆除飛機，即卸掉引擎、武器和傳感器來尋找隱藏在零部件內部的腐蝕、裂縫和損傷。所以5級維護通常在岸上的機庫進行。為了避免出現維護工作未完成與飛行需要著艦的矛盾，飛機技師需要平均分配主要的維護項目。由於大多數的發動機和零部件的壽命是由飛行時間（小時）決定的，所以在開展維護工作時，那些達到壽命時間的部件必須用新的或翻新過的部件替換。當然，為了節約接下來的時間和人力，技師們還要判斷是否替換那些尚未達到使用壽命，但已被從機身拆除並用做其他用處的內部部件。由此可以推斷，充足的備品備件可以彌補維修帶來的時間損耗。上述情況在1945年很少見，尤其是英國的太平洋艦隊。
無計劃維修包括：故障或戰損零部件和飛機結構的修理/更換。在連續飛行任務前，飛機技師會盡可能多地完成計劃維修任務，以保證可用的最大飛機數量，同時設法擁有足夠多的資源以保證無計劃維修需要。飛行計劃類型對飛機維護的可行性有著一定的影響。起初，航母甲板上隻有一個擁有36架飛機的飛行聯隊。這些飛機大多是“戰術攻擊/偵查”（TSR）型飛機，這種飛機一般全天隻起飛很少的架次，主要用於搜索和跟蹤敵人艦隊、用魚雷攻擊敵艦隊（延緩敵艦隊前進速度）以及觀測本方艦炮攻擊敵方時的彈著點。由於當時飛機數量較少，為了彌補戰損，“獨角獸”號航母曾一度寄希望於能在即將到來的維修中直接更換飛機。實際上，到1945年時，這種情況已經有所不同。相對同級別的早期艦船而言，飛行聯隊的規模已經達到54架，甚至在後來的兩艘航母上達到80架。大約1/3的飛機停放在飛行甲板上，所以這些飛機免不了遭受鹽沫和來自煙囪的煤灰的侵蝕。如果在機庫中不能為這些飛機找到空間的話，那麼部分飛機將不得不在甲板上做零部件的更換。雖然對經常起飛的空中作戰巡邏機和反潛巡邏機的需求仍然存在，但核心的需求是甲板上裝載的戰鬥機。因為這些兵力能夠以最大的飛機出動量來攻擊海上和岸上的敵人。按照慣例，基於工時的維修在早期還是可行的，但在後期就困難了。由於飛機數量逐漸增加，即使需要準備第二天的行動，它們也難以在夜裏得到及時檢修。維修評級中隊一整天都在忙於給飛機加油和重新裝備武器，結果由“工時已滿”導致不斷增加的飛機數量形成了一種“空間的浪費”。最壞的情況是：它們被卸載掉有用的部件後，直接被推到一邊。在21世紀，這可能看起來是很奢侈的，但是美國海軍卻有一套十分相似的“體係”，並且沒有像英國皇家海軍那樣嚐試著將這些“廢物”回收到維修車間（為了更長時間地服役，在那裏它們能夠被重新整修）。如果太平洋戰爭繼續，皇家海軍將計劃使用近似艦隊航母的護航航母，因為在護航航母上，擴展性維修任務可以由業務中隊維修人員來完成。除對維護的需求之外，修理工作也是一個連續不斷的煩惱，這是由於螺旋槳式飛機從直通甲板航母起飛是很危險的，並且機械損壞是很常見的，有些飛機甚至還沒有和敵人發生交戰就出現了故障。在作戰期間，英國和美國的航母因甲板上的事故而損失的飛機估計達到20%。
英國航母上的“飛行甲板行動”反映了一個擁擠的現實局麵，該局麵是由不斷增加的戰時航空聯隊規模與對技術支援和維修不斷增長的需求所造成的。“光輝”號艦員從1940年的1400人增長到了1945年的2000人，但是混亂的甲板空間卻沒有得到質量和數量上的提高。每一架飛機不得不由工作人員從飛機庫推到升降機上，然後再推到艦艉。從1945年開始，牽引機開始在甲板上協助轉移飛機：飛機由一個連接到尾輪的“機械臂”牽引，移動過程中製動人員在主輪旁邊，以免艦船運動導致飛機滑動。停機坪調度員則通過標準的指令指揮艙麵操作人員行動，例如“機尾在艦中部，朝艦艉走”、“機尾到右舷”、“正舵”。一旦飛機就位，下達了“停止，用導纜器和係固設備固定”的指令，艙麵操作人員將轉移到需要移動的下一架飛機。將一架飛機熟練而巧妙地引導到一個狹小的區域需要艙麵操作人員具有很高的訓練水平和技巧，尤其在他們長時間連續奮戰在甲板上和夜晚甲板沒有燈光時，隻能靠最低限度的使用有色手電，在這種情況下尤為明顯。美國海軍的飛機具有自動折疊翼功能（如“海盜”戰鬥機），而英國建造的飛機沒有自動折疊翼功能（如“海火”戰鬥機），所以對英國航母上的艦員來說：每一架飛機都不得不用手來展開和折疊機翼，這是另一種人力密集的，需耗時耗力的活動。由於飛機起飛或著艦後向前滑行過分界線時才會使用自身的動力，所以在其他情況下，這些飛機都要被推動。當飛機在艦上排列完畢後，“分級維修中隊”會在一定區域內將各架飛機啟動、預熱、檢測和修理，當然如果需要還會加油。2任何一架被發現不能正常工作的飛機都必須在該“區域”外進行人工處理，必要時其他飛機會被挪到一邊，清出一條通道，然後將這架飛機進行拆卸維修。如果有後備飛機的話，後備飛機將會填補那些無法正常工作的飛機的空缺。為了選出一架後備飛機，3會啟動一個包含六架飛機的篩選程序，篩選出替代機後，其他飛機將重新“歸攏”在一起。這時候，空間和時間就是一個需要考慮的重要因素。
飛行簡報、飛機起飛架數和彈射與回收次數都包括在被稱為“飛行計劃（Flypro）”的航母飛行計劃中。當然該計劃還包括諸如日落和日出時間等其他有用的信息。各飛行中隊的計劃由中隊的高級飛行員製訂，然後交給各飛行員傳閱並補充到“飛行計劃（Flypro）”中。有“翅膀”之稱的航空指揮官負責製訂盡可能高效的飛行計劃，並向艦長彙報。航空指揮官有四個主要助手：行動指揮官，主要負責組織製訂“飛行計劃（Flypro）”；飛行少校，通常被稱為“Little f”，主要負責管理甲板上及附近的飛機；飛行甲板指揮官（FDO），負責在甲板上引導飛機（又稱跑甲板）；著艦控製官（DLCO），負責控製飛機在甲板著艦。由這四人組成的小組的工作能力十分關鍵，因為飛機的起飛間隔隨時可能改變。正在執行任務的反潛巡邏機平均每3個小時就要降落一次；如果需要保持一個由近程飛機“海火”組成的編隊在空中連續巡邏，那麼一次起飛和回收的平均時間就縮短到90分鍾了。不過這裏麵還是有值得人們挖掘的空間的：1945年“怨仇”號的航空指揮官，皇家海軍優異服務勳章獲得者，C.L.G.Evans中校，成功地用幾箱威士忌“換來了”柯蒂斯P-40戰鬥機當初想要的89加侖副油箱。就是這些“副油箱”將“海火”戰鬥機的航程從短短90分鍾提升到了超過4個小時，這不但顯著地提高了整個飛行聯隊的作戰潛力，而且延長了飛機起降之間的間隔。
飛機在預定的起飛時間並加速之前，航母要通過一係列操縱和機動使之進入逆風航行狀態。飛機返航時航母也必須逆風航行（雖然時間一秒秒地流逝，但這些返航飛機還需要按照一定的模式環繞航母飛行並等待隨時著艦）。在艦長允許起飛後，航空指揮官給飛行甲板指揮官發出“確認”的信號，即飛行甲板指揮官挪開木楔並升起綠旗。這麵信號旗被升到與船旗降旗致敬位置差不多高的地方時，它開始隨風飄揚。起飛序列中的領航機飛行員在刹車狀態下啟動引擎至全功率，然後向飛行甲板指揮官舉起他的右手以表示準備就緒。飛行甲板指揮官降下他剛才升起的綠旗，飛機就開始向前滑行，飛行員鬆開刹車並向前加速。在飛機離開甲板之前，停機坪調度員已經將下一架飛機引導到甲板中線，並做好起飛準備，然後飛行甲板指揮官重複同樣的步驟直到所有飛機都已起飛。離開甲板後，飛機以最大轉角向左舷或右舷飛行，這樣它們螺旋槳的尾流就不會影響到後麵的飛機。攻擊是在一個事先明確的區域進行的，該區域通常在艦艏一側幾英裏外的地方；根據事先的安排，飛機在空中編組完畢後徑直朝交戰陣位飛去。在滑行起飛前數秒，因故障無法快速拉起的飛機將被快速推到艦橋前方的“墳場”，以便使其他飛機能夠順利通過跑道。因為在一個忙碌狀態下的航母上，飛機起飛的間隔時間隻有20到30秒。
當最後一架飛機起飛完畢時，回收飛機的工作就已經開始了。當飛行甲板指揮官引導最後一架飛機起飛時，著艦信號員已經從他的戰位跑到了舷側突出的部位，為第一架返程的飛機做準備了。當降落的飛機穿過攔阻索時，著艦信號員會發出“關閉引擎”的信號，飛機會發出一聲鉤子撞擊金屬甲板的“叮當”聲。在下麵的機庫中，每次著艦聽起來就像一堆廢鐵砸到了上麵的甲板上，同時還伴有鋼纜滾過滑輪的“吱吱”聲。真正的墜機聲音聽起來完全不一樣，當飛機從甲板滑過時，會伴有一種拉長的劃擦聲。當飛機停止移動時，身著綠色衣服的“操鉤人員”會從鄰近的舷梯裏跑出來解開鉤子。當攔阻索解掉時，飛行員將加大油門使飛機向前滑去。飛機一旦通過安全降落區，“應答器”就會告訴著艦信號員他可以轉入引導下一架飛機降落了。大多數艦隊航母的著艦間隔時間不會超過30秒。當安全進入了飛行模式“1”的時候，每架飛機會以緩慢的速度向停機地點集結，並且在引擎關閉之前，各飛機用木楔和繩索進一步固定。由於艙麵空間緊張，飛機輪子要正好停在甲板邊緣，而這時候飛行員根本看不到輪子邊上的甲板，因此停靠時要完全依靠艦上的停機坪調度員。如果甲板因為任一原因沒有做好準備，甲板著艦控製官會拒絕下一架飛機及後續飛機的著艦請求，直到把甲板清理完畢為止。甲板上的事故，即眾所周知的“墜機”，它很少發生但卻不可避免。戰時，“墜機”的陰影使航母作戰壓力很大並且節奏很快。美國海軍的飛機，例如“黑寡婦”戰鬥機，已經被證明是一種比脆弱的“海火”戰鬥機更為強大的艦載機，雖然這種飛機的起落架著艦笨拙，但卻直接影響到是笨拙但“安全”的著落還是直接墜機。
如果在甲板上發生了飛行事故，甲板人員要能夠快速反應，采取措施盡可能減少所有因航空汽油引起的火災，同時要盡可能地援救飛行員，並盡快清理甲板為後續飛機著艦做好準備。當艦橋後麵龐大的吊車緩慢地轉過來的時候，消防管就可以噴射泡沫滅火了，同時CO2消防罐已經做好了使用準備。一組頭戴紅色頭盔的“消防員”身著石棉防護服和手套，配備船用消防設備，不管飛行何時進行，他們都會在甲板上時刻待命，他們的任務是使機組人員快速離開失事飛機（現場）。“艦隊製定的標準”要求5分鍾內完成失事飛機的清理。通常修理要求會超出艦員的能力，因此失事飛機會被直接推到一邊（等待處理）。當甲板上正在處理事故時，在空中的飛行員會駕機環繞航母飛行，同時觀察汽油餘量並采取相應對策。