楊儀、薑維遵照諸葛亮的遺囑，秘不發喪，隻將屍骸載在馬車上，慢慢退兵。有人將此事報告司馬懿，司馬懿聽說諸葛亮已死，放膽出來追擊。快趕上蜀兵時，忽然看見蜀兵調頭作戰，並齊聲喊道：“司馬懿別逃！你中計了，快來領死！”司馬懿聽了，騎馬返回，魏兵都丟盔兵棄甲，倉皇逃命，跑了好幾十裏，見後麵沒有什麼動靜，才停住腳步。司馬懿派人打探，才知蜀兵已全部退到斜穀，舉著白旗為諸葛亮發喪。司馬懿又轉身去追，到了赤岸，什麼也沒有，料知蜀兵已經走遠，隻得退回。途中有人唱道：“死諸葛嚇走生仲達。”司馬懿聽了也不惱怒。後來，他巡視蜀兵的營壘，見處處布置巧妙，不禁讚歎道：“孔明真是天下奇才！”隨後又回頭對眾將說：“國家有福，敵國喪失頂梁柱，我們從此可以高枕無憂了。”於是領兵回到長安。
蜀兵退入斜穀以後，全體改穿喪服，將丞相的遺骸妥善棺殮，然後帶著靈柩南回。走了沒多久，遙見前麵火光衝天，喊聲四起，楊儀、薑維不知發生了何事，急忙派人詢問。原來是魏延攔住去路，不放楊長史過去。魏延自恃勇猛，藐視楊儀，隻因楊儀是丞相的長史，才稍稍忍耐。楊儀想令魏延斷後，便讓司馬費禕前去探問魏延的意思。魏延勃然大怒：“丞相逝世，難道就不去攻打敵兵了嗎？楊儀等人是丞相的手下，可以回去辦理喪事，我仍要留在此地討伐敵兵。況且楊儀是什麼人啊，敢命令我斷後？”費禕勸道：“這是丞相的遺命，不應違背。”魏延生氣地說：“丞相如果依從我的計策，早已到達長安。我如今身為前軍征西大將軍，被封為南鄭侯，理應繼任為丞相。楊儀不必借丞相之名，派你來哄騙我，快將兵符交出來。”費禕知道無法說服他，就回去稟報。楊儀與薑維商議，薑維想出一個辦法，從槎山小路進發，日夜兼程，繞到魏延背後。魏延聽說楊儀等人已到南穀，急忙到穀口攻打，並上奏說楊儀造反。楊儀也彈劾魏延叛亂。
兩道奏折先後進了成都。後主剛得知諸葛亮壽終，正在悲痛，忽然又接到魏延、楊儀二人的奏章，心中大驚，急忙召侍中董允、留府長史蔣琬過來商議。董允與蔣琬齊聲說：“我們相信楊儀，不信魏延。”後主說：“丞相剛剛去世，二人便反目成仇，豈不是國家大患？”蔣琬回答說：“丞相並非不知道魏延驕橫，隻因他勇猛過人，所以妥善駕馭。臣料想丞相必將製服他的辦法告訴了楊儀，請陛下不必擔憂。”後主這才稍稍放心，專等魏延、楊儀的消息。
楊儀到南穀後，令王平為先鋒。王平到了穀口，恰與魏延相遇，王平指責魏延：“你為何造反？”魏延也嗬斥王平為叛黨，領兵攻打王平。王平指著魏延的部下說：“丞相對待你們何等仁厚，如今丞相屍骨未寒，你們卻造反，於心何忍？況且你們都是蜀人，不乘機回家團聚，等候賞賜，反而幫助魏延叛亂，自取滅亡，你們想想該不該呢？”話剛說完，魏延的部下齊聲響應，紛紛散去。魏延十分惱怒，拚命作戰。剛打了幾個回合，又有馬岱前來援助王平，魏延雖然勇猛，因部下全部逃散，也不敢戀戰，騎馬返回。馬岱從後麵追趕，王平則去稟報楊儀。楊儀聽說魏延戰敗逃跑，就帶著王平西去。不久，馬岱就將魏延的人頭獻上，楊儀用腳踩著魏延的頭顱說：“看你還敢不敢作惡！”隨後上疏請求誅滅魏延三族。魏延生前曾夢見自己頭上長角，便去詢問善於解夢的趙直，趙直說是吉兆。趙直退出之後，卻對好友說：“角字上麵是刀，下麵是用。頭上用刀，十分危險啊。”其實魏延並非想造反，隻因與楊儀不和，想除掉楊儀，然後自己代替諸葛亮，卻最終落得個身首異處，這也是自作孽不可活。
長史蔣琬為後主分憂，特地出都巡視各營。大約走了幾十裏，接到楊儀的報告，說魏延已經被殺，蔣琬於是退回成都。過了兩天，楊儀等人帶著靈柩回到都門，後主帶領百官親自迎喪。因諸葛亮的兒子諸葛瞻年紀幼小，一切喪葬都由蔣琬等人代理。楊儀呈上諸葛亮的遺書，後主打開一看，不禁潸然淚下，隨即傳出旨意，厚葬諸葛亮。楊儀上奏說：“丞相已有遺言，要求把他葬在漢中定軍山。”後主點頭同意，並選擇日期將諸葛亮下葬。
後來，蜀地的百姓追念諸葛亮的恩德，多次請求為他立廟。後主於是下令在淝陽為諸葛亮修築祠堂。諸葛瞻十五歲時，就被封為騎都尉，娶公主為妻。後主遵照諸葛亮的提議，令蔣琬為尚書令，管理國家大事，吳懿為車騎將軍，屯兵漢中。後來聽說吳國屯兵巴丘，約有一萬人，後主十分驚慌，急忙詢問蔣琬。蔣琬一麵請求增添永安的兵馬，以防不測；一麵薦舉中郎將宗預，讓他出使東吳，打探消息。後主一律聽從，立即派宗預東行。宗預到達吳都，孫權責問他在永安增添兵馬有何用意，宗預答道：“江東在巴丘增兵，西蜀在白帝城增兵，無非是被形勢所逼，有什麼可懷疑的呢？”孫權說：“你的才幹的確不亞於鄧芝。我聽說諸葛亮病死，擔心魏人乘蜀國辦喪事時入侵，所以在巴丘增兵。這樣做是為了支援蜀國，並沒有其他意思。”宗預又說：“吳、蜀已經和好很長時間了，當然應該彼此關照。陛下能增兵支援蜀國，難道蜀國就不可以增兵援助吳國嗎？”孫權折服，熱情款待宗預，並讓宗預轉告後主，自己決不負約。宗預回去將此事稟報後主，後主當然歡喜。