2006年，全省規模以上醫藥製造企業53家，完成總產值32．97億元，比上年增長了16．14%，完成工業增加值17．91億元，比上年翻了一番。2006~全行業實現利潤總額和利稅總額分別為2．12億元和3．68億元，比上年增長19．24%和13．83%。醫藥製造業全部從業人員年平均人數從2005年的1．1萬人上升到2006年的1．24萬人。
近年來，在國家高技術產業化示範工程項目的帶動下，甘肅生物醫藥技術不斷提高。先後實施了蘭州生物製品所凍幹口服痢疾雙價活疫苗、口服輪狀病毒疫苗，蘭州獸醫研究所豬傳染性胸膜肺炎和豬衣原體病疫苗等國家高技術產業化示範工程項目，提升了甘肅生物製藥的技術水平。立足中藥和藏藥優勢，推動了甘肅特色藥品的快速發展。預測顯示，2007年甘肅醫藥製造業繼續穩步快速增長，預計完成總產值37．29億元，比上年增長13．09%；完成工業增加值19．19億元，較上年增長7．2%。
三、推進自主創新存在的問題分析
1．高新技術產業對全省工業發展的先導作用有待增強。
高新技術產業占製造業的產值比重仍較低。甘肅高新技術產業產值在製造業中的比重逐年下降，2003年為11．83%，之後持續降低，2005年和2006年分別為8．82%和7．59%。與全國平均水平相比，高新技術產業在製造業中的比
高新技術產業實力弱，發展速度相對低。近年來，甘肅高新技術產業增長波動較大，尤其是高新技術產業增長率自2003年起卻呈現持續下降態勢，2004年為10．94%，2005年僅為2．86%，2006年同比增長8．92%，改變了自2003年以來增幅下滑的局麵，增長速度大幅度的回升，但自2003年以來甘肅工業總產值一直保持14%以上的增長速度。與甘肅工業總體發展速度相比，高新技術產業發展相對緩慢。
2．科技資源的分布不平衡，導致地區問自主創新能力不平衡。
甘肅省的科技資源地區分布極不平衡，主要集中在蘭州市。截至2006年，蘭州市的獨立科研機構最多，有86個，占全省總數的60%以上，而其餘地(州、市)合計不到全省總數的40%；獨立科研機構的從業人員，蘭州市占全省總數的68%，其餘地、市的總和隻占32%；全省四分之三的科學家與工程師集中在蘭州市；開展科技活動的高等院校，蘭州市有14所；天水市、張掖、慶陽、甘南藏族自治州各有一所；而剩餘的其他地(州、市)則沒有開展科技活動的高等院校。由於科技資源的地區分布很不平衡，從而造成了科技創新活動與科技創新成果水平的地區差異。2005年蘭州市專利申請占全省申請量的77%。
3．高新技術自主開發水平低，企業創新能力有待增強。
目前甘肅省產業自主開發水平還較低，2006年甘肅省高新技術產業化項目70%以上采用的技術引進。在市場經濟條件下，企業是最大的技術輸出和技術吸納方。企業專利申請量占甘肅省全部專利申請量的35．3%。但2006年甘肅省科技成果統計報告顯示，大專院校和科研機構在全省科研力量中仍占據主導地位(66%)，而企業所占科技資源比例不足20%。2006年，在甘肅省登記的704項科技成果中，由獨立科研機構和大專院校完成的成果348項，加上醫療機構完成的133項，三者所占比例接近70%，而由企業完成的成果為136項，在成果總數中占據的比例僅為19．31%。因此甘肅企業創新能力仍需進一步加強。
4．科研體製改革需繼續深化。
首先，條塊分割突出，體製壁壘嚴重。一方麵，由於受到條塊分割和隸屬關係的製約，甘肅省研發機構各自為政，低水平重複立項屢有發生；另一方麵，甘肅的科研單位和大中型企業是”國字”號為主體，多年來習慣於麵向政府和依賴政府，加上部門之間、地方之間的條塊分割，使企業和科研單位相互分離。不利於資源共享，不利於單位之間進行合作研究和技術開發，不利於產學研合作創新，不利於科技成果轉化。
其次，科技成果”有效需求”不足，導致創新動力不足。由於體製和政策導向等方麵的原因，長期以來科技成果重”學術價值”，輕”市場價值”。科技成果評價體係僅體現了科技成果的”學術價值”，如論文的數量與級別、課題的研究經費、鑒定級別、獲獎成果的數量與級別等指標，這些成為科技管理部門評價單位和個人科研成績的依據。在這種導向作用下，高校和科研機構能夠向企業提供的通常僅是單向的技術和產品，不能有效滿足企業大規模生產對成套技術和裝備的需求，導致了企業對研發機構的科技成果”有效需求”不足，阻礙了科技成果轉化。
5．科技資源共享仍需繼續推進。