城內袁紹等眾公卿不見了皇帝焦慮極了，於是外出尋找。而宮外顯陽苑駐紮的董卓遠遠看到宮中火起，人聲鼎沸，知道發生變故。此時董卓哪甘落後，於是便統軍急速前進，正好與眾位大臣相遇在北芒山（今北邙山）下。
宦官死亡殆盡後，閔貢扶著少帝與陳留王劉協，在夜裏追著螢火蟲的微光徒步向南走，想回到宮中。走了幾裏地，得到百姓家一輛板車，大家一齊上車，到達洛舍歇息。次日，找到馬匹，少帝獨自騎一匹，陳留王劉協和閔貢合騎一匹，從洛舍向南走，正遇眾公卿趕來和董卓軍到。連日奔波，夜不能寐，神經緊繃的少帝見董卓突然率大軍前來，再也承受不住，嚇得哭泣。大臣們對董卓說：“皇帝下詔，要軍隊後撤。”董卓不以文臣為然，說：“你們這些人身為國家大臣，不能輔佐王室，致使皇帝在外流亡，為什麼要軍隊後撤！”董卓上前參見少帝，少帝說起話來語無倫次。於是董卓又與陳留王劉協交談問起事變經過，劉協一一回答，從始至終，毫無遺漏。董卓十分高興，覺得劉協賢能，而且又是由董太後養大的，他認為自己與董太後同族，於是心裏有了廢黜少帝，改立劉協為皇帝的念頭。
董卓進京後迅速挾持了少帝、太後，掌控了朝廷中樞，眼看滿朝文武無人敢於反抗，董卓行事越發跋扈。董卓嫌自己兵力單薄，擔心不能使遠近懾服。於是，每隔四五天，就派軍隊夜裏悄悄出發到軍營附近處，第二天早上，再嚴整軍容，大張旗鼓地返回，讓人以為西方涼州又派來了援軍，而洛陽城中沒有人知道他的底細。有了“強大”的軍事後盾，董卓便有了底氣，於是他迫使朝廷以下雨不停止為理由，讓皇帝頒策罷免司空劉弘（字子高，南陽安眾人）的職務，由自己接任。
何進、何苗被誅殺後，其部下無所從屬，皆歸董卓。洛陽城內勢力成為一片散沙，率領西涼雄騎而來的董卓一家獨大，但是手下西涼兵隻有步、騎兵三千人。剛剛歸附的洛陽軍隊畢竟不是董卓的嫡係，由於地緣政治的影響，董卓並不相信他們，於是想拉攏丁原。丁原認為董卓野心太大，不會為漢室謀福祉，不願跟董卓合作，於是董卓便有了除掉丁原這個眼中釘的念頭。
與何苗一同被殺的有長史樂隱，牽招（字子經，安平觀津人）十餘歲時為同縣樂隱的學生。樂隱被害後，牽招與樂隱門生史路等人，冒著危險收斂樂隱屍體，載其還鄉。道遇山賊，史路等皆四散逃走，牽招垂淚懇求，山賊覺得他是個有義之人，放他離去，由此牽招聲名鵲起。
董卓聲勢日益浩大，騎都尉鮑信到泰山郡募兵，恰到這時歸來，對朝廷現狀感到深深的擔憂，於是他勸說袁紹：“董卓統率強兵，將有不軌的打算。現在不早作打算，必然會被他控製。應該乘他剛到，兵馬都很疲憊，發動襲擊，可以生擒董卓！”袁紹畏懼董卓，不敢發動進攻。鮑信長歎：豎子不足與謀！無奈下率領部隊返回泰山郡。又征召了士兵兩萬人，騎兵七百人，運載糧草物資的車輛五千多輛，準備隨時支援洛陽。
董卓的野心越來越大，為了廢掉少帝，彰顯自己的權利，他迫不及待的想要除掉執金吾丁原。此時，董卓手下虎賁中郎將李肅進言：“丁原威猛剛烈，帳下猛將極多，但是其威並不足以降服部眾。我有一個老鄉，叫作呂布，在我們五原當地聲明卓著，然而在丁原帳下隻是一個區區主簿，想必會心生不滿，現在您何不以假借漢室的名義讓呂布秘密誅殺丁原？”董卓以為此計可行，於是上書丁原欲反，脅迫少帝擬寫密詔殺之。
時人地緣觀念極重，李肅連夜攜帶密詔趕赴丁原營中，以老鄉的身份找到呂布，拿出密詔，誘使呂布殺死丁原。然後又以密詔令呂布掌管並州兵馬，歸屬涼州董卓。張遼、張楊、高順等將領信服，從此董卓兵力大增。
董卓又想利用袁紹來支持他，可是遭到袁紹的極力反對。董卓對袁紹說：“天下的君主，應該由賢明的人來擔任。每當想起靈帝，就使人憤恨。‘董侯’看似不錯，現在我打算改立他為皇帝，不知他是否能勝過‘史侯’？有的人小事聰明，大事糊塗，誰知道他又會怎樣？如果他也不行，劉氏就不值得再留種了！”
袁紹說：“漢朝統治天下約四百年，恩德深厚，萬民擁戴。如今皇上年齡尚幼，沒有什麼過失傳布天下。您想廢嫡立庶，恐怕眾人不會讚同您的提議！”董卓手按劍柄，嗬叱袁紹說：“小子，你膽敢這樣放肆！天下大事，難道不由我決定！我要想這樣做，誰敢不服從？你以為董卓的刀不鋒利嗎！”袁紹勃然大怒，說：“天下的英雄豪傑，難道隻有你董公一個人！”袁紹把佩刀橫過來，向眾人作了一個揖，徑直而出。董卓因新到洛陽，見袁紹是累代高官的大家，所以沒敢害他。袁紹把司隸校尉的符節懸掛在上東門，離開洛陽逃奔汝南老家避難。