在艾歐尼亞的村莊裏，有一個孤獨的瘦小身影在風中流浪。
他那張小小的臉上滿是孤獨、傷疤與悲傷。
但是來來往往的人都不曾注意到他，他就像一個透明人……一個站在這陽光之下的影子一般。
這時候有一隻手掌搭上了他的肩膀，這個孩子的頭轉過去，他看到一個中年人站在他的麵前，那人揉了揉他的腦袋，“你願意跟我走嗎？”
這個小小的身影臉上有著茫然，直到老人將他抱起之後，他那已經幹涸很久的眼中流出淚水，重重的點了點頭。
每天跟著老人不斷習練著刀法，更是不斷淬煉著他的實力。這個孩子也是異常努力，因為這是他第一次感受到了別人的關懷，他總是希望，帶他回來的人，也就是他的導師，目光能在他身上多停留一點。
但是導師的目光，永遠停留在一個人身上，那就是暮光之眼、慎的身上。
慎是導師的兒子，得到這一份特殊待遇理所應當。但是這個逐漸長大的孩子，從小的被忽視讓他的性格變得偏激，在他被帶回到這裏的那一刻起，我已經將這個老人看做成自己的父親……他覺得，如果自己能再努力一點，擊敗這個對手。那麼導師的目光，就會在他的身上多停留一點吧……
但是不論他如何努力，都是在平局之下與慎結束對練。長久以往之下，這個孩子在挫敗感和嫉妒心的驅使之下，他的內心開始發生了一種畸形的異變。他開始不擇手段的尋找取勝之道。
這個年輕的忍者冒險進入了宗族寺廟裏的禁地，在那禁地之中，到處都散發著一種神秘的光芒，他折轉著按照路線最終找到了一個裝飾華美的不祥之盒。在感覺到盒子裏的暗黑奧義後，他的內心動搖了一瞬，導師的勸誡中，是不應該打開它的，但是他此時的內心已經充滿了嫉妒與恨意。
他的目光穿過那箱子的縫隙看去，頃刻間，一道黑色影子觸碰到了他的意念，並展示了被長期隱藏的禁忌忍術。這強大的忍術，讓他瞬時間成為一個遠超以往的人。
也就在那一刻起，以往那個可憐的孩子不見了，他的內心中充滿了對於力量與傳頌影子這偉大力量的念頭。憑借著這個秘密武器，他再一次與慎決戰，這一次他贏了。在這勝利時刻，他的目光看向一旁的導師，他期待著讚許與認同。
但是導師怒喝著要將他驅逐出門戶。
他屈辱地走出山門，在外徘徊了數年。最終的他將一切苦難轉化為決心，並開始用影子流派來訓練其他人。他的力量日益增長，他的追隨者們也是如此，但他知道，少了那個不祥之盒，他的忍術將永不完美。某天，他審視了他的跟隨者們，並注意到，他的徒弟們現在已經是一支可怕的部隊了。
於是他帶領他們返回寺廟，去索要那個盒子。在大門口，他驚奇的發現蒼老的導師正在等候，並且猶如迎接貴客一般接待著他和他的弟子們。這個老人將他的劍放在的腳邊，並聲稱他是一個失敗的導師。
因為作為導師，沒有能夠將曾經的徒弟帶回均衡之路，反而將他放逐，迫使他遁入了影子。蒼老的導師懇求劫能夠進入寺廟毀掉盒子，並帶領他的追隨者們重歸均衡。於是這名暗黑忍者與導師一同走進寺廟。片刻後，已經集結的忍者們聽到了他們的主人發出了痛苦的大喊。