元代的賦稅製度和徭役製度同國家的經濟、政治製度一樣，是我國封建社會賦役製度的承繼，同時也有許多特異之處，對元朝的興衰有著重要的影響。
元朝的田賦和其它賦稅呈現南北異製，就是同一地區的賦稅，製度有很大差別。原因在於：統治者征服各地的時間不同，隻能因時立製，不可能強求統一。
元代的商稅和鹽稅較之以前有所發展，並規定賦稅征鈔；元代建立賦役冊籍，強化裏社製度，保障了徭役征發。
元朝賦稅製度南北異製，就是同一地區的賦稅，製度也有很大差別。同時，元代由於商業的繁盛，使商稅無論是品類還是數額都有明顯增加，成為元朝財政的主要收入之一。
此外，因為元代貨幣經濟發達，政府以鈔為法定通貨，因此在賦稅中采取征鈔的辦法。這些有別於前代的賦稅特點，體現在元代各個方麵的賦稅法規中。
元太宗即位之初，接受耶律楚材建議，初定地稅之法，地稅的稅率“上田畝稅3.5升，中田3升，下田2升，水田5升。”元世祖時，除江東、浙西外，其他地區隻征收秋稅。
1282年，江南稅糧按宋舊製折納綿絹雜物。1296年，才開始確定在江南征收夏稅，以木棉、布、絹、絲等物交納。
元世祖之初，曾多次進行括田，履畝征稅。這種括田，雖有增加田賦的意義，但以均平田賦為主。
1314年，元世祖采用大臣奏議，實行經理法，旨在括隱田，增賦稅。首先張榜，曉諭百姓，限40天內，將其家所有田產田賦，自己向官府呈報，如有作弊，告發得實，或杖或流，所隱田產沒官。
元代初年，繼續實行鹽專賣，鹽利是元財政收入的主要支柱。元朝對其所屬鹽場實行不同的稅率製度，因地而異。政府對鹽實行定額稅，以白銀交納。
元代的茶稅也是國家的一項大宗收入。元代茶稅製度基本上是因襲了南宋舊製，實行茶專賣，間或在某一時期或地區征稅，或兩者並行。
1288年，元朝頒布《榷茶條畫》，其主要內容有：茶園不得縱頭匹損壞；差官巡綽出差劄者，不得夾帶私茶；蒙古萬戶、千戶頭目人等，無得非理婪索榷茶酒食撒花等物等。
除上述鹽茶專賣外，元對酒醋等也實行專賣並課稅。元代對酒醋征稅始於1230年正月。
當時的規定是酒醋同稅，稅率為十取其一。由於征收困難，特別是為了保證糧食的基本用途，所以實行官製官賣，設立了酒醋務坊場官，專管酒醋製造和買賣事宜。至元代後期，實行榷征的辦法，並大興造酒場所。
元代的酒醋稅大都以銀鈔繳納，這就是“賦稅征鈔”的特點。但偶爾也征收實物，如糧食。酒醋稅一直是元代重要的財政來源，減免情況甚少，加上大多實行專管，收入比較穩定。
元代時期的牲畜稅在當時稱之為“羊馬抽分”，是元代建立以前就有的蒙古最古老的稅種。有資料記載的元代牲畜稅始於1229年8月，當時由於戰爭的需要，規定凡蒙古人有馬百匹者及有牛、羊百頭者，各納其一。這種辦法一直持續至元代建立以後，前後近70年沒有大的變化。
元代還實行市舶課稅法。元承宋製，對國內與海外諸國往還貿易的商舶及海外諸國來華貿易的船隻，統稱市舶。對中外船舶所載貨物的抽分與課稅，叫市舶課。
元代市舶課製度，初期沿襲宋朝舊製，實行抽分法，即對進出口貨物抽取定量實物。抽分之後，隨客商買賣，在販賣時另征商稅。為鼓勵土貨出口，曾實行雙抽、單抽之法，對土貨實行單抽，對蕃貨實行雙抽，即加倍征收。
元代商稅是一種交易稅，收入主要來自全國三四十處大中城市，但在財政收入的錢鈔部分中占有重要地位，其重要性僅次於鹽課。1270年正月，忽必烈立尚書省，以回族人阿合馬平章尚書省事。
阿合馬長於理財，采取多種措施，增加國庫收入。阿合馬規定了應征商稅的總額，這成為有元一代通行的製度。