從10月6日起，第18軍以大約5個團的兵力，按預定計劃，強行渡過湍急的金沙江，迅速從南、北兩麵包圍昌都藏軍。北線解放軍又分三路，右路154團自鄧柯渡江，與從玉樹出發的青海騎兵支隊經囊謙、類烏齊直插恩達，切斷昌都藏軍西逃的退路：中路52師指揮部和155團、156團、炮兵營自鄧柯渡江後南下，經生達直取昌都；左路偵察營、工兵營由崗托渡江西進，從正麵向昌都實行佯攻。南線175團自巴塘渡江，直指寧靜，從南麵堵住昌都藏軍的退路。雲南軍區126團和125團一部從迪慶出發攻占碧土、鹽井，又向左貢方向前進。在解放軍前進途中，藏軍代本牟霞、普隆巴·紮巴次仁等部憑借險要地形和工事進行頑抗，解放軍同他們戰鬥二十餘次，擊潰了藏軍的抵抗。12日，第九代本德格色，格桑旺堆在寧靜宣告率部起義。18日解放軍逼近昌都時，昌都城中一片混亂，原來就反對同解放軍打仗、竭力主張和談的阿沛，阿旺晉美率總管府40餘名僧俗官員以及衛隊100多人，撤離昌都城，噶倫拉魯招募來的地方民兵則在城中乘機搶劫。阿沛在發現退路已被解放軍截斷後，移住昌都西南之竹閣寺，並立即派出人員與解放軍聯係。19日，解放軍和平進人昌都城，受到昌都寺僧人和城內居民的歡迎，該城宣告解放。21日，已同解放軍取得了聯係的阿沛·阿旺晉美命令藏軍第三、八、十代本2700多人停止抵抗，放下武器，昌都地區獲得解放。被達紮等人部署在該地區的藏軍，除第九代本起義後被編入解放軍序列，已成為解放軍的一支隊伍外，其餘5700人大部被俘，由英美等國援助他們的大批槍、炮、彈藥以及電台等軍用物資，全被解放軍繳獲。混入藏軍的4名英、印籍人都成了解放軍的俘虜。對放下武器人員，人民解放軍按照特別優待辦法一一作了妥善處理。對被俘的藏軍連以下人員發給路費、馬匹、口糧，遣返回家，屬西藏的官員、頭人，仍可照舊擔任原來職務，並發還其私人自衛槍支。
至此，昌都地區遂又恢複了和平的社會秩序。
王其梅率18軍前方指揮所於24日抵昌都，在舉行祝捷勝利大會時，他帶頭列隊迎接阿沛，阿旺晉美等人返回昌都，並讓他們仍住在原昌都總管府，以禮相待。此後雙方間的關係，逐漸親密，黨的關於和平解放西藏的方針和政策，亦逐漸得到了阿沛等人的更深理解和熱情擁護。11月5日，由阿沛等40餘名僧俗官員簽名的寫給達賴喇嘛和達紮等人的信，由專人日夜兼程送往拉薩。信中以他們的見聞和親身感受，懇切陳詞，再次力勸拉薩當局速派代表與中央和談。11月10日。經中央批準的關於和平解放西藏的“十大政策”，以西南軍政委員會和西南軍區司令部所頒《布告》的形式，由新華社向全世界全文播發，《人民日報》全文發表。在解放軍開始橫渡金沙江時，黨中央還作出了再從西北組建一支隊伍大體沿今青藏公路一線配合18軍向拉薩、日喀則挺進，並協同班禪堪布會議廳返藏的部署。12月2日，中共中央西北局吸收範明列席，就此作了專門研究。此後，經過一段時間的醞釀、籌備，即於次年4月和7月先後成立了由範明領導的中共西北西藏工委和第18軍獨立支隊。
12月27日，兼任中共昌都工委書記的王其梅和副書記惠毅然、平措旺階等，在昌都召集該地區上層人士百餘人開會，討論成立解放委員會問題。經過五天的醞釀、協商，昌都解放委員會成立，一致選舉王其梅為主任，在進軍和解放昌都時作出貢獻或在當地有較大影響的昌都寺大活佛帕巴拉，格列朗傑、阿沛，阿旺晉美、察雅寺大活佛羅登協饒、德格土司降央伯姆（女）、德格色，格桑旺堆、平措旺階、幫達多吉、惠毅然等人被選為副主任。該委員會是在中共領導下聯合當地上層人士建立的、帶有政權性質的協商辦事機構，直接接受西南軍政委員會和政務院的領導。