李時珍是位很有個性的人。他在窮人麵前從不趾高氣揚，在權貴麵前也不卑躬屈膝。其中受封於武昌的楚王朱英火僉捷足先登，派人帶著重禮來蘄州招聘李時珍前去楚王府任職。李時珍起初還心有疑慮。但轉念一想，他很快打消了這一顧慮，認為這是天賜良機。楚王府權勢顯赫，獨霸江南，一旦得到重用或受其保舉，很可能在政治上露露臉麵，以彌補過去科舉落第的遺憾。可以官方名義組織編修新的本草醫書，實現內心的夙願。可以借機搜集資料，為日後著述打好基礎。有機會結識包括名醫在內的各類人才，以便取人之長，補己之短。李時珍很爽快地接受了楚王的邀請，第二天便隨使者奔赴武昌。
李時珍雖然也曾出入過鄉紳家門，略知一點官宦人家的內情，但卻沒想到會是這般昏暗！楚王朱英燴除了跟王妃小妾們廝混以外，就是與方士們煉“長生不老丹”。李時珍對此持反對意見，自然找不到可以切磋醫術的“知音”。好在他並沒有遭到冷落，因為他的醫術是別人所無法比擬的。
楚王的長子患了一種“暴厥症”，類似於我們今天所說的抽風病，多少名醫對此都無能為力。楚王非常焦慮，按照傳統的封建嫡長子繼承製，大公子將來要繼襲王位，可是重病在身怎麼能行呢？
沒過多久，楚王府就傳出一條爆炸性新聞：王子的病徹底痊愈！楚王府歡呼雀躍，一片沸騰，盛讚李時珍是名不虛傳的神醫，並以豐厚的禮金禮品答謝李時珍。李時珍婉言謝絕了王府的厚禮，借機請求楚王幫助自己向朝廷提出重修《本草》的主張。可是楚王對此並不感興趣，勸說李時珍留在府上，許諾將來有機會把李時珍推薦到太醫院去，然後再爭取官修《本草》之事。
李時珍在楚王府，被任命為正式官員，官銜是正八品的奉祠正，主管祭祀禮節，同時兼領王府的良醫所。
李時珍最喜愛的是楚王府中的大量藏書。自宋、元以來，貴族們附庸風雅，出資編纂刊刻了不少古書，主要是醫藥和方術方麵的，其中絕大部分在民間已經絕跡，隻有在皇族和達官顯貴的書房裏才能見到。李時珍在楚王府三年多的時間，他還被特許抽空兒外出走訪、治病，每年都能夠回家探親翻閱了眾多書籍，抄錄了有價值的資料，潛心研究。
李時珍還閱覽了《泊宅編》、《兩山墨談》之類的上百部筆記小說，讀劉貢父的《芍藥譜》、範成大的《菊譜》、沈立的《海棠譜》、戴凱之的《竹譜》、葉廷掛的《香譜》和蘇易簡的《紙譜》等一些增錄學著作，閱讀了《桂海虞衡誌》、《南方草木狀》、《涼州異物誌》有關邊遠地方藥產的書籍。
嘉靖三十七年（1558年），明政府為補充太醫院缺額，下令讓全國各地舉薦名醫進京任職。
太醫院是國家最高醫政管理機構，同時兼管宮廷醫療之事，保存著大量的醫藥書籍，籠絡了許多醫學名人，是普通醫生難得一進的場所。李時珍很榮幸地被楚王朱英償保送到了太醫院。他沒過幾天感到失望，太醫院裏的歪風邪氣，上上下下一片渾噩，絕大多數職員為迎合嘉靖皇帝整天忙碌著煉製所謂長生不老的“仙丹”，把正常的醫療之事置之腦後。李時珍起初曾試探提出異議，申請由官方出麵重修《本草》，卻遭到拒絕和嘲諷。大醫院的主管官員罵他是“擅動古人經典，狂妄已極”。李時珍忍氣吞聲心裏另有一番打算。
在太醫院可以名正言順地閱覽皇家醫書，特別是那些絕版的珍本書，他把大部分精力用於讀書和搜集資料上，做了數十萬字的筆記。他的見識了更多來自四麵八方的貢品藥材。太醫院下屬的壽藥房和禦藥庫都是他經常出人的地方。李時珍大開眼界，發現了不同地區所產的同一藥物的細微區別，如人參、當歸和白術等，他都做了解釋。他以前曾經看過《銅人針灸經》和《銅人腧穴針灸圖經》兩部書，但卻從未見過鋼人模型，當他聽說這個標示人身各穴位的銅人模型正供在太醫院藥王廟裏時，便多次前去觀摩辨認，從而掌握了人體的每一個腧穴和脈絡。
李時珍在大醫院任職一年左右，覺得再沒有什麼值得留戀的地方，便毅然托病辭職還鄉，集中精力從事自己的事業。李時珍回到斯州，鄉親們熱情地歡迎他，稱他為太醫。
人們不必再為求醫治病四處奔波，因為李時珍能治百病。荊穆王的妃子胡氏，因吃養麥麵後惹氣胃疼，醫生采用催吐化滯療法反而使病情加劇，疼痛難忍，於是請李時珍醫治。李時珍啟用《雷公炮炙論》中“心痛欲死，速覓延胡”的藥方，立即稱出延胡末三錢，用溫酒調服，很快止住了疼痛，大便通暢，胃病好了。富順王朱厚混的嫡長子經受不住兄弟之間爭奪繼承權的鬥爭，鬱悶致病。李時珍給病人開了一服“附子和氣湯”，順氣補身，一語雙關。富順王頓有感觸，重申嫡長子的王位繼承權不可動搖，釋去了嫡長子的心理負荷，使其健康如初，王府平靜祥和。
李時珍盡心竭力為病人治病，重修《本草》的計劃，更難以實施。他再次應邀去楚王府，又當了兩年奉祠正，巡訪了武昌的山川河流、名勝僧閣，掌握了大量的第一手資料，成竹在胸，覺得應該脫離官場，過隱居生活，專心從事著述。李時珍在嘉靖四十年（1561年）前後，返回蘄州，把家搬到了雨湖北岸的紅花園。李時珍為表示內心的喜悅，他特意給自己取了個“瀕湖”的別號，並在自己的門首親筆題了“進所館”三個大字，立誌不忘人間困苦，專心著述，造福子孫！