很快，瓊斯有了新的任務，這次他將指揮以“博霍姆·理查德”號為旗艦的一支小艦隊。“博霍姆·理查德”號原名為“拉·杜·杜拉斯”號，為了對本傑明·富蘭克林表示敬意才改為現名（富蘭克林在有些文章中曾以“貧困的理查德”作為筆名）。排水量900噸的“博霍姆·理查德”號比瓊斯指揮過的任何一艘船都要大，名義上裝有42門火炮，但實際上部分火炮根本不能用。這艘船早年是東印度公司的一艘商船，曾經多次駛往中國。它的380名船員中隻有60多人是美國人，其餘分屬包括英國在內的8個國家，而且“博霍姆·理查德”號雖然率領著一個有6艘船隻的小編隊，但其中2艘是私掠船，3艘是法國海軍的船隻，隻有1艘是美國海軍的艦艇，而且指揮這艘船的還是一個精神不太正常的法國人。
困難自然嚇不住瓊斯這樣的人。在航行開始時，瓊斯說出了他的名言：“我打算走一條危險的道路！”事實證明，他的估計一點沒錯。艦隊剛剛離開法國南部的洛裏昂港，瓊斯手下的船隻就作鳥獸散了。2艘私掠船為了奪取戰利品，自行去尋找目標了，兩艘法國軍艦一艘迷航，另一艘舵柄折斷，指揮那艘美國軍艦的法國人皮爾·蘭第伊斯則致信瓊斯，他將在“他認為恰當的地點和時間行動”，這意味著他將盡可能地遠離瓊斯。不久，舵柄折斷的法國快速帆船“巴拉斯”號趕了上來，與小型海防艦“複仇者”號一起，陪伴瓊斯的“博霍姆·理查德”號向北航行。
在蘇格蘭西北角的雷斯角，蘭第伊斯不受歡迎地露了一麵，隨即又消失在茫茫大海之中。瓊斯的小艦隊沿著蘇格蘭東海岸南下，經過英格蘭東海岸，一直航行到設得蘭群島頂端靠近富拉以南處。這時，蘭第伊斯再次露了麵，顯然他是由於沒有更好的任務而不得不與艦隊會合。1779年9月23日傍晚，瓊斯的小艦隊在斯卡巴勒附近的弗蘭伯勒角遇到了一支由41艘帆船組成的運輸船隊，在兩艘英國軍艦“斯卡巴勒女伯爵”號和“塞拉比斯”號護航，由波羅的海駛來。雖然兩艘英國軍艦都是新型的快速戰列艦，但瓊斯仍毫不猶豫地發動攻擊，一場十八世紀最艱苦的海戰由此拉開帷幕。
小型的“複仇者”號是一艘海防艦，因為太小，根本無法發揮作用，所以一直留在射程之外。戰鬥成為“博霍姆·理查德”號與“塞拉比斯”號、“巴拉斯”號與“斯卡巴勒女伯爵”號的單艦衝突。瓊斯最初的計劃是把英艦與運輸編隊分割開來，但指揮“塞拉比斯”號的英國上校理查德·皮爾遜挫敗了他的計謀。“巴拉斯”號的力量大大壓倒了隻裝有20門火炮的“斯卡巴勒女伯爵”號，很快把對手俘虜。於是勝負就由瓊斯和皮爾遜的較量來決定了。
戰鬥從太陽落山時開始，兩艦並列行駛，用舷側炮進行互射。“塞拉比斯”號有44門火炮，而且狀況良好，因而占了很大優勢。雙方都希望趕在對方前麵，或落在後麵，以便在對方無法射擊的情況下，猛轟其甲板。第一次齊射過後，“博霍姆·理查德”號就有兩門18磅炮炸裂，上甲板被炸開一個大洞，船身傾向一邊。瓊斯知道炮戰自己敵不過對手，於是企圖展開接舷戰。有一次，瓊斯為了要登上“塞拉比斯”號，曾駛至後者船尾，但在企圖接舷時被對方炮火逐退。由舊商船改裝的“博霍姆·理查德”號行動笨拙，在轉向時正好碰上“塞拉比斯”號越過“博霍姆·理查德”號的船首，兩艦的索具纏在一起。這個位置對瓊斯來說十分糟糕，他的所有大炮都無法瞄準，皮爾遜發現自己處於非常有利的位置，他得意地向瓊斯喊道：“你的船擱淺了嗎？”瓊斯則響亮地回答：“我還沒有開始戰鬥呢？”這句話後來成了美國人民永遠傳頌的名言。由此開始，戰鬥成了一場傳奇。