當金國盜寶之人再次回到大相國寺時，卻發現銅人已經不翼而飛。他們大驚失色，隻好與大相國寺的監院法定等協商，準備以重金購回。法定雖是僧人，也有愛國之心，他拒絕了金人的誘惑。
靖康元年閏十一月，東京城破，法定等人慘遭殺害。從此以後，相國寺的這尊銅人再也沒有了下落。
再說皇宮太醫署的那尊銅人。靖康元年十一月二十五日，金兵占領了東京外城，逼迫宋廷投降。次年正月，金兵又向宋廷索取文物、珍寶及各類禮、祭重器，其中就包括天聖銅人在內。據說，這些物品運到燕京者共二千五百車。但其中是否有天聖銅人，卻不得而知。
但是對於這尊銅人，還有另外一種說法。有人說，早在金兵攻城之初，便有大臣把它帶出了皇宮；然後，踏上了顛沛流離的逃難之路。
靖康二年（公元1127年），康王趙構即皇帝位後，有人在湖北襄陽發現了天聖銅人的蹤跡。後來，這尊銅人被章叔恭所得。再後來，銅人歸於襄陽知府趙方。
等到局勢穩定以後，趙方的兒子趙南仲便把它獻給了高宗。國寶終於又回到了宮中。
宋理宗紹定五年（公元1232年），蒙古國派使者到臨安，逼要天聖銅人。這樣，天聖銅人才歸於蒙古國。
公元1260年，忽必烈親自召見尼泊爾工匠阿尼哥。四年後，修複後的銅人被置於元大都的三皇廟內。在它的身後，是石刻的《銅人腧穴針灸圖經》。
明洪武元年（公元1368年），朱元璋攻入北京，銅人及石刻仍在原地未動。
到了明正統八年（公元1443年），櫛風沐雨的銅人已顯破舊，英宗決定重鑄。並重刻了《新鑄銅人腧穴針灸圖經》石碑。銅人鑄好後，置於太醫院的藥王廟，被人稱為“明正統銅人”。至於原來的銅人是否還在原處，史書無載。據說，在瓦剌人攻打北京時，原來的那通石碑卻被砸爛後砌入了城牆。
到了清朝，這尊“明正統銅人”還在宮廷裏。
1900年，八國聯軍攻入北京，這尊銅人被人搶去。從此以後，在中國，再也沒有了天聖銅人的蹤跡。
近現代世界各國及國內發現的針灸銅人
後來，一位老中醫在日本發現了一尊針灸銅人。據說，它來自中國。由於後來中日間的戰爭關係，這件事未能引起人們的注意。30年後，有人又在日本東京的博物館中看到了它。這件事在中國的中醫界引起轟動。
1979年，中國中醫針灸研究所派王雪苔先生等赴日進行考察。他們在上野博物館見到了這尊銅人。從外觀上看，高1.62米，身上用黑線畫出了經絡，在每個穴位處鑽有小孔，共有365個。銅人的體內還有木製的腑髒。他們初步確定，它就是天聖銅人。但是，它到底是兩尊天聖銅人中的哪一尊？它是怎麼來到日本的呢？有國內專家經過考證指出，這尊銅人是在1126年金兵攻入東京開封以後，被金人搶走的。後來，又輾轉到了朝鮮、日本。而在日本國內，也有類似的說法。他們說，1590年豐臣秀吉統一日本，兩年後，日本人攻占了朝鮮。隨後，他們搶走了這尊銅人，並把它帶到了日本。但是王雪苔先生在仔細回想以後，提出了可疑之處：這尊銅人的外部特征與宋代的造像不一樣。
對此，日本人也產生了懷疑。最後，人們從日本江戶時代的一位醫官山崎次善的墓誌銘中找到了答案：它就是山崎次善親手製作的。
1958年，有人在前蘇聯的列寧格勒發現了又一尊針灸銅人。從外形上看，這尊銅人和收藏在中國曆史博物館的“光緒銅人”極其相似。而據說，光緒銅人又是仿照明正統銅人鑄造的；那麼，這尊銅人很有可能就是天聖銅人。
“光緒銅人”又是怎麼一回事呢？
1900年，八國聯軍入侵北京，明正統銅人被從清太醫院搶走，下落不明，太醫院正是俄國軍隊的占領區。後來，清朝禦醫找俄國人要，沒有結果。於是，在光緒三十年（公元1904年）太醫院又重新鑄造了一尊針灸銅人。這尊銅人身高2.13米，頭上無發，有衣帶，穴位數是360個。所有這些，和史書上記載的天聖銅人不一樣。經查，這尊銅人是根據太醫院珍藏的一張銅人圖複製的。1958年，這尊銅人為中國曆史博物館所收藏。