建德回顧左右，約有二百餘人，自於馬上問曰：“此地何名？”旁有識者，答曰：“此名牛口穀也。”建德聞言大驚，仰天歎曰：“吾命休矣！近聞軍中謠言雲：‘豆入牛口，勢不得久’，斯言正應吾姓竇，敗走入牛口穀，實上天亡我之兆，似此奈何？”左右曰：“此等皆山僻小路，可以入樂壽。”建德曰：
“後麵唐兵大至，難出穀口，可急走此路。”遂躍馬前進。約走二十裏，山奄內喊聲大震，一彪軍出，當先一員大將，乃李靖也。策馬持槍大叫：“建德早降，免汝一死！”建德大怒，身雖無甲，亦持刀戰之。李靖便走，建德乘勢追殺，四下精兵皆起。建德急走，背後孫義掩殺，行動已將五十餘人。
又行三四裏，前麵鼓聲震地，一軍擺開，當先唐上將白士讓驟馬橫刀來戰建德。建德大怒，縱馬迎之，戰不三合，建德敗回小路而走。兩旁樹木紛雜，蘆葦亂草。時及黃昏左側，正走之間，喊聲舉處，兩下伏兵皆持長鉤套竿，一齊並出，先把建德坐下馬絆倒，建德身離雕鞍，已被楊武威所獲。背後史嶽、王常、敬德、叔寶、劉德威、陶武欽精兵皆至，四下圍住，孤身獨戰力盡，建德被執。
秦王自引諸將直到穀內，聞已擒建德，秦王乃大喜，聚眾將於帳中。少時，楊武威擁建德至前，秦王曰：“久仰盛德，與汝瓜分天下，本自無仇，吾討世充，幹汝何事？公平昔自以天下無敵，今日被吾所擒，有何理說？”建德曰：“吾不自至，汝亦必來相請，今日誤中奸計，但有一死而已。”秦王曰：“此言有理，吾若肯容，諸將因汝損了許多氣力，亦不肯容耳。”
秦王交推過曹旦來，秦王問曰：“你有何言？”旦終不答，秦王怒，推出斬之。秦王回顧世勣曰：“建德欲何如？”勣答曰：
“此子誌勇，非屈人下者，大王可解送入長安，請旨發落。”
秦王從之。時鄭將王琬、長孫安世因求救建德入不得城，雜在夏兵陣內，二人亦被擒，秦王令監在軍中，隻將建德陷在檻車，遣人押赴京師。唐主罵曰：“朕待汝不薄，何生異心，替別人出力也？”建德曰：“吾與王世充有同契之義，故患難相救。汝亦奪隋城池，反說我有異心，何也？”唐主大怒，喝令武士擁出斬於長安市上。建德不言，引頸受刀，年四十九歲，時武德四年夏五月也。史官有詩讚建德雲：
貝州竇建德，飄然迥出群。
假仁安百姓，全義動三軍。
創業心尤重，求賢禮亦勤。
雖然起自盜，河朔號明君。
後建德妻曹氏，與其左仆射齊善行以騎數百走還名州。餘黨欲立其養子為主，善行曰：“夏主奄定河朔，號為盛強，今一出不複，非天命有歸哉！不如委心請命，無為塗炭生民也。”遂分府庫金銀，散給將士，令各歸鄉井。善行乃與右仆射裴矩率官屬及建德妻曹氏奉山東地、並傳國王璽來降。建德起兵才六年而亡。史官讚建德曰：