1月：
7日，奉軍（清史稿原稱謂）剿“馬賊”失敗，清將濟木薩、恒頤陣亡。
12日，清廷命劉長佑駐邊地，督剿“馬賊”。
14日，川軍平鬆番之亂；“黔匪”犯敘、永、綦江。
17日，清廷允明緒派榮全入俄借兵、貸糧。
19日，命周達武為貴州提督。
26日，允戶部奏請，撥鹽稅諸款，增加內廷用費三十萬兩。
28日，命伯彥、訥謨祜回旗，會同各盟長檄集蒙兵協助圍攻“馬賊”；以文祺為哈密辦事大臣。
30日，瞻對反叛頭領工布朗結等被處決。清廷下令，三瞻（三個地方）均歸達賴管理。次日，命文祥辦奉天防務。
本月：安集延酋長攻陷伊犁等九城。
2月：
6日，以長久未雪朝廷不安，下詔清理監獄，收取遺骸屍骨。
10日，清廷調都興阿為盛京將軍；命穆圖善督辦甘肅軍務，接統都興阿所部各軍。
14日，同治至保和殿，賜外番（少數民族權貴）等宴，自是每歲皆如之。
19日，奉天“馬賊”入踞伯都訥，旋至雙城堡，吉林危急。清廷命文祥、寶善，招黑龍江兵及馬隊前往“剿辦”。
3月：
7日，清廷命富明為吉林將軍。
11日，朝廷召郭嵩燾來京。以蔣益澧代理廣東巡撫。
14日，湖南清軍擊退貴州苗民。
17日，曾國藩移軍濟寧，督攻撚軍張宗禹部。
24日，奉天清軍大敗南北路“馬賊”。清廷免奉天（遼寧）、吉林被擾諸地銀米。
5月：
12日，清廷命李鴻藻為軍機大臣，胡家玉在軍機學習。李鴻藻（1820～1897），字蘭孫，河北省高陽人。進士出身。曆任兵部、禮部尚書、軍機大臣。是同治老師，為西太後信任。思想保守，反對洋務派。中法戰爭、甲午戰爭中主戰。
本年春，免河南積欠錢糧及直隸安州、奉天新民等州縣水災、被擾地區賦額。
22日，清廷命馬如龍代理雲南提督。
25日，清廷召文祥、福興回京，命都興阿接辦奉天軍務，節製各軍。
29日，回眾攻占靖遠。
6月：
3日，朝廷諭奉天、吉林會剿山內山外“賊匪”。
8日，勞崇光進駐昆明，雲南回民起義領袖杜文秀攻克江、鶴慶、劍川。
12日，西北回眾進攻蘭州，清軍將其擊退。
16日，貴州義眾攻克興義、貞豐、永寧；俄國公使堅請於黑龍江省內地通商。
19日，大考翰、詹，擢孫毓文等四人為一等，其餘升黜不等。
28日，回眾攻破塔爾巴哈台，清將領武隆阿戰死，清廷派德興阿為參讚大臣，奎昌代理科布多參讚，嚴諭成祿迅速出關“助剿”。
29日，回眾又攻破伊犁，清將明緒陣亡。清廷命榮全代理：伊犁將軍，庫克吉泰督辦新疆軍務。
31日，朝廷下詔清理監獄。
自上月至本月，北方太平軍餘部分路返回淮北，一路入懷遠，一路由永城向亳州，欲南北夾攻清軍，奪回雉河集根據地。此時，曾國藩實行“查辦民圩政策”，從鄉村進行清查，以前歸附太平軍之民圩，已不敢相從，太平軍與民眾不能聯結，於懷遠徘徊近月，不能回歸蒙城、亳州根據地。
曾國藩采取劃河圈地兜圍戰略，圍攻太平軍遵王賴文光部。他首先於直隸、山東、江蘇境內之千餘裏運河沿線，築牆樹柵劃地分防，扼守運河東岸，以阻止太平軍東入齊蘇膏腴之地。6月太平軍西馳河南（多是騎兵），並渡沙河。曾國藩又沿沙河、魯河兩岸修建長牆，蜿蜒七百餘裏，與運河防線相接連，使太平軍無法通過沙魯二河。太平軍便放棄進入湖北計劃，東向突破魯河開封未完工地段，自中牟突破防線，東進山東。