自去高盧任職後，9年沒回過首都的愷撒，在元老院議員麵前先進行了一番自我辯解。他首先解釋了自己不得不跨越盧比孔河的理由，接著闡明自己在渡河後為與龐培進行會談所進行的努力。最後他申辯，自己的行為並不是為了追求個人特權，而是作為一個為國盡忠的羅馬市民，拿回自己應得的權益。辯解後，他提出要求，即參與羅馬共和國的國政。不過，他是這麼說的：“如果你們拒絕這個要求，我也不會推卸這個重任的，那麼國家就由我一個人來治理。”愷撒說完之後，就要求議員們進行當場表決，並以尋求和平的名義派使節向龐培通報表決結果。對於愷撒參與國政的表決，元老院全票通過，但接下來，在派出使節的問題上議員們出現了很大分歧。在鹿死誰手尚未可知的當下，成為使節，也就意味著要被龐培派當成敵人。沒有跟龐培撤離的元老們，也並不是就願意支持愷撒。這些元老們既不願被龐培當成愷撒派，也不願意跟隨龐培逃離首都，對於這些人，我是挺同情的。這樣的人，現在也有很多。
而且元老們的精神支柱——西塞羅——都沒有出席會議，這樣要作出一個決定就更加艱難。最終這次元老院會議成了一場馬拉鬆式的、議而不決的會議，愷撒為此付出了三天時間。
會議期間，海上傳來捷報。愷撒的部隊又兵不血刃地趕走了龐培派守將，占領了撒丁島；接著，西西裏島又傳來了守將小加圖未待開戰就逃往希臘的消息。這樣，愷撒手中就控製了撒丁島和西西裏島這兩大小麥產地，不用再擔心本國的糧食問題了。現在糧食輸入地隻剩下北非行省了。愷撒命令成功拿下西西裏島的庫裏奧，整頓軍隊後即刻率軍前往北非。
現在隻剩下安全問題了。前麵說過，由於兩位執政官和龐培都逃走了，羅馬乃至整個意大利半島的安全和秩序的維持都麵臨很大的問題。像糧食問題上有庫裏奧這個幫手一樣，在安全問題上，愷撒也找到了得力助手，那就是為效忠愷撒不惜與父為敵的議員世子們。得不到元老院幫助的愷撒，開始實行他“一個人治國”的策略。
不過，愷撒還是啟用了一個人擔任國家大法務官這個國內最重要的職務。這個負責管理國家內政的年輕人就是雷必達。這個雷必達就是公元前78年的執政官雷必達之子，一直以來都是愷撒的忠實支持者。雷必達的父親曾在蘇拉死後，拉起平民派大旗起義，最後失敗。而雷必達自己則是後來與屋大維、安東尼齊名的“後三頭”政治家之一。
愷撒認為，依靠軍事威懾力對羅馬市民進行統治是行不通的，所以他決定不在國內設置軍隊。也正因為此，他給雷必達的任務就是既不依靠軍事力量又維持好國內的秩序。
負責對外防禦的是護民官安東尼，此人也是“後三頭”中的一位。和安東尼負責本土防禦對應，愷撒任命了兩人負責奪取亞得裏亞海的製海權，一個是安東尼的弟弟，另一個則是名門之後，西塞羅的女婿多拉貝拉。連女婿都願意為愷撒效力，這也是上文中西塞羅感慨無限的原因之一。
愷撒給二人少量的船隊和20個大隊。他們的任務是奪取亞得裏亞海的製海權，同時確保愷撒前往希臘時的海上安全，以及阻止龐培從海上奪回意大利半島。雖然愷撒運籌帷幄、力求麵麵俱到，但難免會有不如意之處。龐培雖然放棄了意大利本土，但憑借地中海各clientes 給予的海軍支援，在本土之外的地方擁有絕對的優勢。另一方麵，代表現行體製的龐培，身邊聚集的是一批和他同齡的保守派，這些經驗豐富、正當壯年的將領構成了龐培軍隊的中堅力量。而以改革派自居的愷撒，麾下將領幾乎都是年輕人。安東尼、庫裏奧、多拉貝拉都是30多歲的軍官，跟龐培軍相比，雖在體力和精力上有優勢，但畢竟臨陣經驗不足。於是愷撒不得不事事親臨，彼時他對高盧戰役中的“左右手”拉比埃努斯投敵，感到頭疼不已，正是出於這個原因。但是，世上的事總是福禍相依的。雖然愷撒在戰事上不得不事必躬親，但這也有一個好處，那就是他和他的士兵們總是一起共同接受戰爭的考驗。而龐培和他手下，除拉比埃努斯外，仗著自己有著豐富的戰場經驗，反而已經有15年沒有親臨戰場了。