在很久很久以前，有個星球叫做R2，那裏山清水秀，鳥語花香。似乎這裏應該是生物們最完美的棲息地，但是實際上，這裏的生物種類稀少，隻有少量的蕨類，灌木植物。少量的矽基生命，還有各種奇形怪狀的魚類。當陽光灑在R2的陸地上，石頭人忙碌的一天開始了，他們從大地之中鑽出來，采摘著果子，捕捉魚兒，這美麗幸福的畫麵被遠古石頭人記錄在山洞之中。他們用原始的器材雕刻著最簡單的畫麵，文明從這一刻開始誕生。
這些簡單美麗的畫麵一次次的重複著，石頭人手中的工具也由天地之中可以找尋到的簡單物品變成自己加工，打磨之後更加多樣化的工具。有一天，當他們從大地之中鑽出來後，發現地上躺著一個奇怪的石頭人。這個石頭人的個頭很矮小，比大多數的石頭人矮小。但是他身上散發著和石頭人同樣的光，腦殼上也有著石頭人標誌性的天線。和這個矮小的家夥交流之後，他們才知道他不是R2的石頭人，他來自遙遠的星球。
矮小的外星石頭人在R2紮根，逐漸被R2的土著們接受了，這個看似瘦弱的家夥逐漸展現出他強大的一麵。在追逐獵物的過程中，他善於發現，捕捉獵物。更神奇的是他可以掌握獵物的路線，無論是飛禽走獸，還是海裏的奇怪魚類他都可以輕鬆找出獵物的蹤跡。R2的石頭人逐漸將這個外星石頭人奉為神靈，稱他為光明使者！
光明使者不僅僅帶領著石頭人從地下走出來，還帶領著石頭人向新的方向進化，他發現了石頭人進化的規則。光明使者成為了史上唯一的一個十階石頭人，強大的力量，不可戰勝的實力，他將這些秘密記錄在一部石碑之中。他希望石頭人能按照這個規則不斷挑戰自己的極限，從而不斷的進化。
光明使者在一次下海捕魚的過程中發現了一個奇怪的通道，走了進去，看到了一台龐大的未知物體。他好奇的摸了摸，突然這個大家夥開口說話了！他差點嚇得趴下了，大家夥向他問好，他站了起來，看著這個古怪的東西，一番交談之後，他激動的發現這才是真正的神靈！於是他帶領著石頭人來朝拜這個新的神靈，他向石頭人宣布，新的光明使者就是眼前這個大家夥。
故事本來到這裏應該走向完美，但是世界上哪有完美的事情。吳克將軍講到這裏不停的歎氣搖頭，因為故事的的另一麵是如此的黑暗，血腥和暴力。
前任光明使者在一個漆黑的夜晚消失了，就如同他突然出現在R2一樣悄無聲息。石頭人為這位偉大的先驅者立了個碑，上麵沒有寫其他的文字，隻留下了他在自己小屋裏的古怪符號。
當石頭人按照前任光明使者留下的法則不斷進化之時，一切都改變了。有部分石頭人產生了暴力傾向，為了瑣碎的事情和同胞發生爭執，甚至大打出手。這些石頭人的生活習慣也發生了改變，他們甚至可以在夜晚之中活動。逐漸這群石頭人遠離了原來的族群，成了新的群體。他們自稱自己是黑暗石頭人，不在崇拜光明，更不信奉這台機器人。光明使者在他們的眼中不過是堆破銅爛鐵。
隨著文明的發展，兩種石頭人相互之間的摩擦日益嚴重，雙方各自占領了兩塊大陸。光明使者一直試圖勸解兩方，想讓和平再次降臨。可是黑暗石頭人的墮落日益嚴重，他們為了達到進化的目標，不惜殘害同胞，讓人不齒的是，他們以和平談判為誘餌扣留了光明石頭人的領袖賈巴爾。
這次行動徹底激怒了光明石頭人，原本信奉和平和友好的光明石頭人，再也不願意忍讓。他們在無盡之海發動了對黑暗石頭人的第一次戰役，戰爭持續了很久，雙方幾乎動用了當時所有的力量。戰爭永遠沒有真正的勝利者，雙方都付出了慘痛的代價，吳克的父親在那次戰役中葬身於火海。黑暗石頭人最終丟掉了一塊大陸，退居於最後一塊大陸。