太陽黑子產生的一個最大的特征就是對地球磁場的破壞，它所產生的帶電離子，通過破壞地球高空的電離層令大氣發生異常，從而幹擾到地球磁場，使電信中斷。
所以說，太陽黑子的出現並不是一件好事。一個發展完全的黑子由2部分組成：較暗的核和周圍較亮的部分，中間凹陷大約500千米。黑子出來活動時經常成對或成群出現，其中由2個主要的黑子組成的居多。位於兩麵的叫做“前導黑子”，位於東麵的叫做“後隨黑子”。一個小黑子大約有方圓1000千米，而一個大黑子則可達方圓20萬千米。然而太陽黑子到底是怎麼形成的呢？
關於這個問題天文學界一直眾說紛紜。有的說黑子可能是太陽的核廢料，約11年出現一次。他們推測大概是黑子在太陽表裏活動時上下翻動所造成的。另外，黑子溫度較低可以算是廢料的一個證明，就像煤爐燒過的炭灰一般情況不會再產生高溫。
經過天文學家的科學研究表明，太陽黑子的形成應該與太陽磁場有密切的關係。但是它到底是如何形成的，仍然還沒有找到確切的答案。科學家推測，很有可能是哪片區域的物質結構被某種強烈的磁場改變，從而使太陽內部的光和熱不能有效地傳送到達表麵，就形成了這樣的“低溫區”。還有一種說法認為黑子附近的溫度應該比太陽的正常溫度高一些，由於太陽密度小和自轉的原因，黑子朝著低緯度的方向運動，黑子所在的地方是凹下去的，可能就是因為溫度低無法膨脹的原因。
此外，科學家們得到一個有趣的發現，黑子越多可能說明太陽越老，這個發現可以作為所有恒星壽命長短的衡量。