三年多以前，在災變發生的幾個月之前，幾個大國政權早就在準備相關措施，原本極為絕密的黑色物質事件也被更多的專家和組織得知，各方暗流湧動，事態還在控製之中，隻是誰也想不到，幾個月後，一向神秘的黑色物質再次出現，人類遭受了史無前例的災變！
R病毒幾乎一夜之間席卷了全球，第一天就有數億人直接死亡，不到三天就有幾十億人死亡或者被感染，人類快要被未知的病毒消滅殆盡！災變後發生的頭兩天裏，通訊衛星和信號傳輸還能用，很快就搜不到任何消息了，根本不知道哪個地方的傷亡救援情況怎麼樣。
在這之前，各國政府已經在做預案了，在災變爆發的前幾天，中國政府派出無數精英和重要人士飛赴太平洋的小島上，甚至還有一部分人躲進潛艇裏，如此迅速的反應確實救下來了一批人，隻是後來又發生了一些事情。幾乎就是在同時，陳博義將最高級絕密拷貝出來，而且還派心腹給陳言送去了一瓶藥水，也是那天他在藥店時接到的東西，沒想到災變來地那麼快，他的屬下再也沒有返回。
陳博義所在的星光火炬項目組和部分國安局的特工部隊留下來堅守陣地，大約剩下兩萬人執行任務，最開始還有不少幸存者投靠他們，後來軍事基地裏也爆發了疫情，一大半人在睡夢中被戰友咬死。
僅餘下兩千人的項目組轉戰到了上海市區，發現市區裏和其他地方一樣都是行屍，最後遇見了飛悅大廈的胡國民，陳博義隻能以此為新的科研基地，再次堅持下來。
幾天後，陳博義派出直升機飛赴湖北方向，要去尋找陳言，沒想到半路上遇到兩波末世後的流寇，直升機和戰士都墜毀了。又過了一月，他們收到消息說海南和四川一帶還有部隊存在，分別從海陸兩地派出幾百人去聯絡，後來再也沒有消息。
漸漸地他們再也收不到消息，隻接納過少數的幸存者，所有的救援都沒了消息，仿佛他們的基地成了人間最繁華的地方。外麵全是行屍，他們大多數時候都被困在飛躍大廈裏，一邊對抗著行屍一邊繼續研究。
半年過去了，陳博義還是沒有等到大侄子，這時連他自己也忍不住了，可是誰也沒想到陳博義竟然做出了離開的決定，他帶著三百人坐船離開了上海，要去尋找集結了眾多希望的阿爾法島……
陳博義把基地裏的事和剩下的幾百士兵交給了並不是很熟悉的張亞坤，同時讓張亞坤留意他侄子的消息，隻是後來基地裏遭受了一次又一次打擊，不少士兵逃亡了，或者崩潰了。
離開了基地後，陳博義很快就到了公海，想不到的是他們在大海裏尋尋覓覓數日都找不到阿爾法島，而且還遇到地震海嘯，所有人都墜落海中，他和副手尚曉東在海裏不知漂流了多久才找到了一艘船，然後他錄下了那一段視頻，發送給了基站。
兩三百士兵不知所蹤，阿爾法島也不知所蹤，本以為必死的陳博義誤打誤撞飄到了一座島上，苦苦尋覓的阿爾法島，隻是島上滿目瘡痍快要被淹沒了。
在這島上，他見到了幸存下來的兩百士兵，也見到了一個神秘的人，賈不歸。
賈不歸像是在島上等他很久一樣，不但給他們找到了船，還打探到了新阿爾法島的下落。
陳博義隻能選擇相信賈不歸，果然找到了新的阿爾法島，而且越發覺得這個人神秘了。進了阿爾法島後，陳博義給中國區增添了力量，同時也知道了疫苗研製的最新進展，很是失望，他帶著星光火炬項目組親自上陣，並且被推舉為副主席。
之後的半年陳博義一直都在醫療組沒日沒夜地工作，隻是一次次的失敗讓他們心灰意冷，然後他很意外地放棄了醫療組的工作，突然轉入航天中心，讓不少人都很意外。
……
陳言很少開口，等陳博義說完，他心中還有疑惑，不過看二叔打著眼色，他沒有追問。
聽完陳博義敘述完這些，已經是大半夜了，眾人感慨不已，在於慧的催促下才散去。
之後幾天，陳博義一直在航天中心忙著原料的事情，據高貝貝和吉米傳回來的消息來看，三位聯盟會的主席當日吵鬧不休，現在都在悶頭做事，不知道被刺激著了哪根神經。
用吉米的話來說，島上的人隻是想活下去，原本對於疫苗的研究時時刻刻都在關注著，後來一次次的失望後，很多人都死心了，至於說飛天移民的事，他們並不在意，先不說火星外太空什麼的能不能住人，聽說太空飛船上也發生了災變，誰還敢往上去。
因此現在阿爾法島的居民更加關注的是食物和防備行屍，航天中心和醫療中心的事情他們不是很在意，甚至還覺得在浪費島上乃至人類所剩不多的資源。