承明元年八月，高祖在永守寺設大法會供奉，剃度良家男女僧尼一百多人，皇帝為他們剃發，施賞他們和尚衣服，讓他們修道守戒，為顯祖求福。這個月，又下詔建建明寺。太和元年二月，到永寧寺設齋，大赦死犯的罪。三月，又到永寧寺設法會，布道聽講，命令中、秘二省和僧徒一起討論佛義，施給僧衣服、寶器。又在方山太祖建墳的地方，建造思遠寺，從興光到這所佛寺，京城內佛寺新舊有將近一百所，僧及比丘尼二千多人。全國寺廟共六千四百七十八，僧及比丘尼七萬七千二百五十八人。四年春，下詔在鷹師故裏建立報德寺。九年秋，執事上奏，上穀郡比丘尼惠香，在北山鬆樹下死去，屍體不壞，已經三年，士女觀看者成千上百。當時的人都驚歎奇異這件事。十年冬天，執事者又向上報告：“從前接受皇帝敕封強迫人籍的愚民開始懷著僥幸，假借號稱人道，用來躲避輸役征課，那些沒有憑藉的僧徒比丘尼都讓他們還俗，重新授受皇帝的詔令，所檢核的僧徒、比丘尼、寺主、維那等應當在寺中暗暗審核，其中修道品行精嚴勤奮的，聽從他在佛道中；行為粗鄙庸俗的，無倫有憑籍無憑籍，都罷免為民。現在按照聖旨選擇送遣，各個州中那些還俗的，僧徒比丘尼共一千三百二十七人。”奏書被批準。十六年下詔書說：“四月八日，七月十五日，聽從大的州剃度一百人為僧尼，中等州郡五十人，小州二十人，作為正常的準則。頒布在市中。”十七年，下詔確立《僧製》四十七條，十九年四月，皇帝到徐州白塔寺，對眾王及侍從官說：“這座佛寺最近有位名僧嵩法師，從鳩摩羅什處接受《成實論》，在這裏流通。後傳授淵法師，淵法師傳授登、紀二法師。我每次玩味《成實論》，可以去掉人心上的俗情，所以來到這座寺中。”當時沙門道登，很有學問法術，為高祖所賞識，經常帶在一起講說討論。曾經在宮中和皇帝晚上談話。一塊看見一鬼。二十多歲死的，高祖十分哀痛婉惜他，下詔施給絲帛一千匹。又設一切僧齋，並且命令京城七天行道。又下詔說：“我的老師登法師突然逝世，痛苦傷心，不能停止，近來吃藥治療，要注意喪事，不能夠赴喪，隻好準備老師之義，在門外興吊。”僧徒及百姓均感到很榮幸，又有西方的沙門叫跋跎，有道業，很為高祖所敬仰信賴，下詔在少室山的南麵，建少林寺住下來，公家供給衣食。二十一年五月，下詔說：“鳩摩羅什法師可以稱得上神化超出智、勇、仁、信、忠五才，誌節進入仁、義、禮、智四行的人，現在經常住在寺中，仍然還有空餘之地。敬順地修道、誌向情感很深很遠，可以在舊的堂所，為他建造三級浮圖。又被昏虐所逼，為佛道而亡身，既然暫時和俗體相同，應該有子孫後代，可以推求訪問報告上來，可以加以接續。”
以前，立監福曹，又改為昭玄，配有官職，用來處理佛僧的事情，高祖時，沙門道順、惠覺、僧意、惠紀、僧範、道弁、惠度、智誕、僧顯、僧義、僧利，都因為德義道行而被推重。
世祖即位，永平元年秋天，下詔說：“佛徒與百姓雖然不同，法律也應該相異，所道德與教義在互相顯明中更為明白，禁令與勸助各有各的適宜。從今以後，僧人犯了殺人以上的罪，仍然按照普通的斷法，其餘的犯罪都交給昭玄，按內部法律製斷治理他們。二年冬天，沙門統惠深上奏說：“僧徒以丘尼眾多、清濁混雜，有的不遵守禁律典則，好的和壞的沒法分辨，於是和經律法師一起商議建立製度：每個州、鎮、郡維那、上坐、寺主，都讓他們自己修持戒律，都要按照內部禁令，假若有不懂律條的，退至本次。又說：出家的人，不應該犯法，積累八種不淨物。但是經律所規定的，通達與否各有差別。按律條：車牛及寺院仆役，是不淨的東西，不應該為自己所私養，隻有年老多病滿六十歲以上的人，限製乘坐一輛。又：近來僧尼，有的因為佛、法、僧三寶，出借財產，化緣州外，又：出家人舍開家庭，本來沒有凶儀之事，不應該廢棄佛道而隨從習俗。父母或三師之喪，遠遠聽說凶訊，任他哭三天，假若在眼前看到見到，限定在七日。有的不安於在寺舍中，遊在民眾中，違亂佛道製造過失，都是因為這些事情。假若有犯的，脫掉僧服還民。那些建造佛寺的限製收僧五十人以上，報告訴聽他們建造。假若有隨便建造營製的，按違犯敕製之罪論處，該寺中的僧徒都被趕出外州，僧尼的法規，不應該為普通人所使用。假若有違犯法規的，返還原籍。那些外國僧尼來歸化的，尋求那些有高德的高僧符合三藏的昕他居住，假若沒什麼德行，遣送回本國，假若他不離去，按這種僧律治罪。”下詔聽從。