擬定清除計劃，表決通過，桑齊核準執行清除行動。監控影像多畫麵環繞會議廳，全息顯示試驗場各處的執行情況，安德森等人專注觀看每一個實驗室的行動，警衛監查，研究組有步驟地進行清除各物種的活體樣本。
物種數龐大的基因庫開啟。實驗人員分門別類逐一清查，查無遺漏，取出各種生物活體進行處理。
古生物培育區首先執行清除。
這些人工繁殖培育出來的古生物近兩萬種：有多種核酸和蛋白質分子，原核生物，單細胞和多細胞微生物，古細菌、病毒、真菌、浮遊生物……乳酸菌、光合細菌、藍藻、萊尼蕨、線蟲、眼蟲、草履蟲、三葉蟲、南極蟲……緩步動物、海綿動物、腔腸動物、舌形動物、扁形動物、線形動物、鰓曳動物……實驗室設置一個清理區。實驗人員把這些上萬種古生物運送到這個隔離的清理區，投入一個大熔池。
顧天雲茫然看著全息影像畫麵，見一批批的生物活體傳送到清理區，一批批地被傾瀉進熔池。
不到一秒鍾，這些被投進熔池的生物融化，各種肉眼看不見的微生物、可見的原始古生物、低等生物瞬間溶解消失。水熊蟲、水螅、水母、吸血蟲、蚯蚓、螞蟥、沙蠶、蠕蟲、螞蟻……它們無聲無息地融化湮滅，沒產生氣泡和煙霧，十分平靜。肉眼可辨的一點動靜僅是熔液在微微上漲，隨著大量的生物投入熔池，液體逐漸增多，水平線沿著熔池壁上的容量刻度尺上升。
這些古生物在一瞬間失去了生命。
大約36億年前，地球上第一個有生命的細胞產生，而更早的源頭，可以追溯到140億年前宇宙的誕生。奇點爆炸暴漲之時產生了碳、氫、氧、氮、磷、硫等構成生命的主要元素。然後，約在時間軸的66億年前，銀河係內發生一次大爆炸，無數碎片和散漫物質經過長時間的凝集，大約在46億年前形成了太陽係，地球就在這一時期形成。
接著，冰冷的星雲物質釋放出大量的引力勢能，再轉化為動能、熱能，致使溫度升高，加上地球內部元素的放射性熱能也發生增溫作用，初期的地球呈熔融狀態。高溫地球在旋轉過程中其中的物質發生分異，重的元素下沉到中心凝聚為地核，較輕的物質構成地幔和地殼，逐漸出現圈層結構。再經過漫長的時間，大約在38億年前，地球最終生成原始地殼。
往後2億年，大陸板塊穩定，地球原始海洋中孕育的生命隨之誕生。從一個個厭氧的原核生物，經過漫長的演變，至今進化為一個個的人。生命從起源，最終發展到人類，成為地球上智慧頂端的自然進化生物。
“它們在生物係統進化樹的根源，它們是我們的祖先。”伯恩教授盯著熔池吞下一口酒，咀嚼說：“酒裏有無數的發酵菌，我在品嚐我們的祖先。”
實驗人員徹底清理熔池，操控各區域自動設備對培養皿、培育罐、培育區等進行消毒殺菌處理，使用探測儀反複掃描核查，細致入微不遺漏任何一個微生物，全部清除幹淨纖毫不剩。
挑選一些切片樣本，核對生物序號後進行封存，固化處理儲藏。
清除基因倉庫的上層，處理培育區內的各種魚類、鳥類，爬行、兩棲和哺乳動物。實驗人員啟動儀器對大型水族培育區、淡水和海洋生物館的水中注入毒液。絢麗的橘黃色毒液迅速彌漫，擴散到水世界每一處地方。一群群各種魚類，色彩繽紛千姿百態的珍稀水生物，遇到這種橘黃色毒液很快死亡。遊弋的大小魚群沉落或漂浮，生命逝去。
一條條漂亮如水中精靈的小醜魚驀然僵硬，在水中如雨點墜落。
顧天雲看到小醜魚的眼珠凸出，身上的白色條紋微微發藍，落在已死亡的海葵觸手上。
大型動物飼養培育區使用全自動化維生設備線進行清理，注入強力麻醉氣體，一格格大小籠子、玻璃隔間的動物被麻醉紛紛倒地。
自動機械臂抓住昏迷的猩猩、金絲猴、長臂猿、狒狒，運送到一條傳送帶上，集中在一堆，再轉送至清理區。清理區待處理的動物越積越多，橫七豎八堆在一起，高高堆成一座小山。
清理區啟用一座焚化爐，在係統調試設定好後開始運行。
焚化爐的門滑開，傳送帶運轉將待處理的動物送進焚化爐。
爐容量六百立方米，產生約五千攝氏度的高溫度，接近太陽表麵的灼熱溫度，每次焚化用時極短，動物一瞬間氣化不剩半點骨渣。水生物的屍體和大型動物被自動回收機器收集放置在傳送帶上，一批批運送到清理區，依次送進焚化爐。傳送帶循環運送，一批動物處理結束，隨即處理下一批動物。