織田信長將天皇換掉了，緊接著上台的，是織田信長非常親近的誠仁親王，誠仁親王作為正親町天皇的第五子，也是唯一的嫡長子，擁有即位的權利，但是也得等到正親町天皇死了之後才能繼位。信長的這一舉動讓他擺脫了日本室町末期的定律，所以他將國家的軍事大權交給了織田信長。
此刻織田信長的部隊已經擴大到了十萬多人，可是總有違反信長意願的家夥，現在東西國家之中，隻有小田原城屬於獨立之中，剩下的無論是立花家、島津家，還是伊達家、毛利家，都表示了一定意義上的臣服，隻不過有一點，就是讓信長保留他們的領地。
信長同意了他們，因為他覺得安土重遷的日本還是需要一點民主的，如果沒有民主，日本可就真的打回到了兩千多年前的洪荒時代。信長將這些家族的領地保留，並且派長宗我部元親和長宗我部盛親父子向小田原城實行保衛戰爭，北條氏政覺得長宗我部一個歸化的姓氏（長宗我部是秦朝的後裔，是徐福帶的那些童男童女的後代），一定不堪一擊。
戰鬥伊始，信長馬上便派了這麼一支祖先是中國人的衛隊去突襲北條氏的大本陣，這純屬是一項冒險運動。結果長宗我部陷入了混亂之中。秀吉在自己的治下頒布了惣無事令，可是他是一位無產階級革命家，這個時候還真的有人公然反叛。
後北條氏家臣豬俁邦憲違反秀吉頒發的惣無事令，攻擊真田氏的名胡桃城。其實早在1585年11月，應北條家的要求，秀吉給信濃國的真田昌幸下手諭，令他將沼田城讓出來，而此城為真田家先祖之墓所在。昌幸猶豫之際，北條悄然以卑鄙手段將其奪來。盡管如此，秀吉仍然沒有向北條家問罪，還是一再催促氏政進京。得了不少好處的北條家仍然不肯臣服，並特別聲稱北條與德川官位不同，待遇各異，不可同日而語。這激怒了家康，上書秀吉要求討伐北條。正逢北條家部將豬俁邦憲強奪名胡桃城。名胡桃城代鈴木重則自刃。在得到眾多大名的相同意見後，秀吉同意對北條家開戰。
北條氏政在看到挑戰後，卻自鳴得意。自認為關東與駿河之間山巒重疊，交通不便，敵人糧食運輸上有困難，因此戰爭越持久越有利。更何況自家的小田原城宛如烏龜殼般難堅固，因此並不擔心。但是氏政不知家康早已從伊勢大湊的商人處購買了三百隻運糧船，另外秀吉也命部下九鬼嘉隆、加藤嘉明率糧船從水路運糧。秀吉還在東海與京都之間架設驛站，以傳遞關東地圖、城郭一覽表、軍事配備等消息。
萬事俱備後，家康率數萬騎兵為先鋒，宇喜多秀家率水軍，一起出征北條家。其他眾多大名也紛紛出兵響應。北條軍在節節退守之後終於生變。北條家老臣鬆田憲秀首先內應，其它將領也紛紛投誠。氏政則龜縮在小田原城內堅守，秀吉采取了圍城的戰略。經過長期的圍城，小田原城內群疑蜂起、兄弟相疑、父子不睦。7月5日，小田原城落，北條氏政、氏照被要求切腹，氏直被放逐到高野山。“天下第一堅城”小田原終於落入豐臣秀吉之手。
秀吉的攻城戰術上實屬無敵，但是信長沒有忌憚的意思，因為他相信秀吉的忠心可嘉。所以他命令秀吉將小田原城收入囊中，而德川家康這個時候憤憤不平，因為自己的發小兒竟然如此偏心，將這麼好的土地交給了豐臣秀吉，但是他還沒來得及抱怨，信長的嘉獎令又來了，信長將關東六國（小田原城和江戶除外）交給了德川家康。