超新星基地很快淪陷，病毒感染人數從十幾億迅速上升到了幾十億，遍布兩個星球和一個太空基地。為了防止病毒的擴散，超新星基地管理下的星係開始封閉並且實時嚴格的監管程序。病毒的死亡人數已經無法控製，病毒的感染和傳播也達到了讓人絕望的地步，不過超新星基地的技術還是在病毒擴散的幾個小時內了解到了病毒的傳播途徑。雖然暫時還沒有有效的疫苗來預防這種死神一樣的病毒的肆虐，但是他們已經有了一個還算有效的延緩病毒擴散速度的程序，在強製性實施管理程序下，感染死亡人數從每小時幾百萬迅速下降到了每小時幾萬，病毒的控製成效顯而易見。隻是對於已經感染了病毒的人隻能夠等待死亡，或者是被軍隊親手殺死。
屠殺，是超新星艦隊控製病毒傳播的主要手段。一旦有人出現身體不適，不管是否感染病毒，都會被強製隔離出來，然後通過飛船把感染者扔到恒星上，被恒星的高溫燒成灰燼。
超新星艦隊對於病毒的出手還算及時，隻是在這個時候，整個星係中的幸存者也僅僅剩下了五十億，這是兩個星球加艦隊基地的所有人數。在那個藍色的星球上，綠真和伊娃親眼見到了地獄才有的景象。不管這些人是來自哪一個星球，不管他們外貌怎樣，他們全部成為了炮口的亡魂。
外星人的屍骸堆積成山，被一艘艘飛船運走，然後扔向恒星。綠真看到了上萬人整齊排列，然後被一艘戰艦的能量光束轟成粉末。她看到了士兵們穿著生化服手拿著槍械，進入城市，不由分說，將城市中的幸存者殺害，凡是活著的，無一例外全被超新星基地的士兵殺害。一座城市，幾十萬人口，在幾分鍾的時間內被屠戮一空，他們的鮮血將城市浸染，然後在一艘戰艦強大的炮口下消失。
超新星基地的血腥屠殺，讓看在眼中的綠真久久難以忘記那個場景，外星人們的呼喊和慘叫在她的耳邊經久不息。
超新星基地應對神秘病毒的侵害的時候，在藏有神王號的那顆流浪行星上。張青青和尤杜拉正在為如何進入這個星球內部而發愁的時候，卻想不到這個星球上竟然發生了猛烈的地震，好像要把這個星球給撕碎一樣，劇烈的震動連站都難以站穩。地麵隆起、破碎、開裂，一塊塊碎片岩石被拋入太空，幽深的裂縫閃電一樣在星球上迅速出現。向裂縫中望去，看到上百個燈籠一樣大的橘色燈光幽幽地亮了起來。
這個星球的異動，讓張青青和尤杜拉不得不逃回生物飛船中。隻見生物飛船一拍自己兩側魚鰭一樣的結構，騰地離開了這裏，向上一竄，便進入了宇宙，離開了這個星球。
生物飛船在距離流浪星球十萬公裏的地方才停下來。她們看到那顆流浪星球的地殼正大塊大塊地向宇宙中脫離。橘色的燈光從脫落的部分中亮起，好像是眼睛一樣，直勾勾的看著這邊。
“怎麼回事？”張青青緊繃著神經，萬一有什麼異動，生物飛船會立即逃離這裏。
“該不會是他們要和我們開戰吧？”尤杜拉雙手搓來搓去，顯得十分慌亂。
兩人談話之間，流浪星球的地殼完全脫離，展現在他們麵前的是一艘黑色的飛船。飛船上布滿了橘色的燈籠一樣大的光點。
這艘飛船輻射出一道能量波，震碎了還留在上麵的石頭和塵土，然後向著宇宙的深處便飛了過去，消失在宇宙黑色的幕布之中。
“我們怎麼辦？”尤杜拉問張青青。
“跟上去！”張青青沒有猶豫，駕駛著生物飛船便緊緊跟隨了過去。
在白矮星基地中，從外麵看起來，這裏平靜如常，白矮星基地的總部與幾個艦隊分基地和防禦平台圍繞著一顆白矮星運行。但是在白矮星基地總部的內部，卻已經陷入了一片混亂之中。
艦隊的強大之處就在於強大的飛船戰艦上，但是現在他們的戰鬥卻不得不拋棄戰艦，在艦隊總部的太空基地進行戰鬥，而他們戰鬥的對象，是艦隊基地的電腦。艦隊基地的防禦平台，以及各個飛船的檢修維護等等工作，不可能單純依靠人力完成，因此為了方便，這些工作便交給了電腦處理。基地百分之六十都需要通過電腦集中控製，這已經成為了三大基地，特別是白矮星基地的最大弱點。大概是因為自恃力量強大，沒有任何人能夠通過白矮星基地的防禦，也沒有異族人能夠接觸到基地的核心，因此對於這個擺在明麵上的弱點，聯盟總沒有進行處理和更正。直到現在，這個弱點終於被敵對勢力利用了起來。
這大概是對於聯盟所有人來說是最意想不到的事情了，因為管理嚴密的白矮星基地主電腦竟然成為了充滿敵意的機器人，幾乎將基地完全控製，對所有的艦隊士兵展開了攻擊。當電腦控製著太空基地對他們發動襲擊的時候，那個時間正是他們的用餐時間，結果有一隊士兵剛剛進入餐廳，還沒有填飽肚子，便成為了十幾具屍體。這隻是一個開始，很快的，在基地的各個地方，在分基地的各個地方，相繼爆發了機器人的“反抗運動”。