反抗同盟軍上百萬的戰艦組成了一直龐大的艦隊，浩浩蕩蕩向聯盟總部前進。這數百萬分的飛船模樣各異，奇形怪狀，有的像是地球經常出現的碟形UFO，有的像一隻巨大的水母，“水母”的機械觸手上安裝著能量武器。這是進攻紅巨星基地的艦隊，在攻下紅巨星基地後，反抗同盟軍立即控製起聯盟剩餘戰艦，編入同盟軍中。然後向白矮星基地支援過去。本來打算兵分兩路，前去趁著紅巨星基地病毒肆虐之時拿下紅巨星基地，但是沒有想到剛拿下紅巨星基地不久就傳來信息，超新星基地因為病毒肆虐引發叛亂，超新星基地艦隊全軍覆沒，戰艦全部毀滅，僅有幾百萬人在戰爭和疾病中幸存。如此一來，超新星基地便沒有了進攻的必要，不隻是超新星基地艦隊全毀，更是因為那一場內戰將基地破壞殆盡，已經沒有了占領的必要。
因此，反抗同盟軍便前去支援在白矮星基地苦苦支撐的卡丘。
由於構造者碎片寄生的主電腦能源耗盡，構造者碎片又恢複了一塊普通的金屬碎片的模樣。陷入混亂的白矮星基地終於恢複了平靜。
構造者碎片引發的混亂並沒有傷及白矮星基地的根本，但是這場混亂加上卡丘在一旁添油加醋，令白矮星基地的戰鬥下降了一半之多。這場混亂平息之後，隻要不遇到戰爭，白矮星基地用不了多長的時間便能夠恢複過來。但是當白矮星基地的所有士兵以為事情就這樣結束的時候，他們在基地中收拾殘局，隻有寥寥幾艘飛船追擊卡丘的飛船。他們沒有想到，他們的噩夢剛剛蘇醒，他們卻又陷入了無法扭轉的絕望中。
在與紅巨星基地的一戰中，幾十萬飛船減少了三分之二，憑借這這樣的兵力的確無法戰勝戰鬥力雖然下降了一半的白矮星基地。但是可悲的地方就在反抗同盟軍用來牽製聯盟總部援軍的那三支艦隊。
副議長，哦，現在應該是議長，他下令讓援軍撤回總部，這個決定讓本來已經陷入絕望的三支同盟軍艦隊長長舒了一口氣。雖然他們的數量是三大主力戰艦的幾十萬倍，盡管失去了忒彌斯號飛船，但是單憑這三大主力戰艦的力量便能夠與三大艦隊基地抗衡，而他們這看似強大的幾十萬戰艦，實際上隻是一堆雜牌戰艦，質量參差不齊，有達到了泰坦級的飛船，同樣也隻有比一艘普通飛船還要弱小的飛船，這樣的一隻雜牌軍，能夠牽製三大主力戰艦這麼長的時間，已經算是一個奇跡。
其實從數量上算來，那三支用以牽製援軍的艦隊才是真正的主力，議長命令三大主力戰艦撤退，恰好讓同盟軍的主力得以保存，填補了在紅巨星基地一戰時的兵力空缺。
由於紅巨星基地成功占領，三大主力戰艦撤退，超新星基地因為病毒和叛亂而毀滅，在同盟軍高層的商議下，四支艦隊會師白矮星基地，然後凝聚兵力，向聯盟總部發起總攻。因此，便有了白矮星基地麵對百萬計的戰艦的戰鬥。
因為構造者碎片引起的混亂令白矮星基地元氣大傷，雖未傷及根本，雖然是聯盟三大艦隊之一，但是麵對數量如此龐大的敵人也隻能是連連潰敗。同盟軍剛剛突破第二層防禦圈，白矮星基地便宣布投降。如此，白矮星基地剩餘戰艦全部歸於同盟軍之手。
如此，同盟軍在星係中便有了立足的根本。
不過，在向聯盟發動總攻之前，同盟軍高層意料之中又出現了兩派建議。
一派讚同停戰休整。剛剛經曆了一場大戰的同盟軍已經顯露疲色，現在最重要的應當是進行休整，並借助白矮星基地和紅巨星基地擴大勢力。他們已經占領控製了兩大基地，可以說已經擁有了與聯盟抗衡的力量，但是這力量還不足以與聯盟發動正麵戰爭。因此借由兩大基地自然和科技的優勢快速發展戰艦和勢力，並且幫助星係各處的反抗勢力揭竿起義，與他們一起對抗聯盟。
而另一方則認為他們應當發動總攻。他們認為，雖然同盟軍經曆一場大戰，兵士疲憊，但是因為打贏了聯盟，他們的戰意空前高漲。雖然宇宙戰爭並不是靠著人數進行戰鬥，但是不論是什麼樣的戰鬥，都不會忽略士兵的士氣。現在艦隊中主戰士氣高漲，一旦進行休整，高漲的士氣就會因為暫時的平靜很快失去。這短暫的平靜時光甚至可能會讓士兵們產生驕傲的心理，會認為聯盟沒有進攻他們完全是因為聯盟在害怕他們。而且，憑借他們現在的艦隊實力，在短時間內很難有一個質的飛躍，即便擁有了兩大艦隊基地，但是根本實力還是無法和聯盟對抗。特別是在恢複時間上，實力強大的聯盟會比他們更快恢複過來，到時候更無法與之對抗。他們應當趁著現在高漲的士氣和聯盟元氣大傷，盡快發動總攻。