沈壽嶢在方斯穀和安尼的協助下，隻用了一個下午的時間，就把一千水師全部分配在了三百多艘船上，每隻船的人員、火器配置全都造冊存檔，袁方手裏也拿到了一份名冊。
袁方所率領的這支船隊一共有三百零八艘各類船隻。
其中有兩艘樓船，調撥給袁方使用的樓船不是那種巨型戰船，而一款中型二層樓船。
樓船上配置八門千斤佛郎機炮、三個碗口銃、十二門鳥嘴銃，另外有一百個噴筒、一百個煙罐、一千支弩箭、八百斤火藥、二百斤火銃藥、五百斤各類鉛彈、五百支鐵箭、三百支火箭、一百塊火磚。
另外還配備十二把鉤鐮槍、十二把大砍刀、二十根過船釘槍、標槍一百五十支、三十麵藤牌、一百個灰缸、火繩一百根、鐵蒺藜一千個。
在船上還有備用的大小風帆，櫓、舵、椗和纜繩也都有備用的。
作為一船之長的捕盜，還備下了鐵釘、油、麻、灰等維修船所用之料。
船上還給每個作戰的兵士配備了竹盔一頂、腰刀一把、釘槍一根。
比樓船小一點的是福船，福船有五艘，其火力配置也是很強大的，隻是跟樓船比起來稍微遜色了一點。
袁方現在擁有海滄船十二艘，有六艘是李邦華後來調撥的。
蒼山船有三十六艘，這種船隻能配置二門佛郎機炮，船體比海滄船小，但是操控靈活，度快。
以上五十五艘船是可以進行海上戰鬥的，其餘的都是補給船和運輸船，這些船隻主要是運載二千多人所必須的食物、水和武器。
因為袁方這次出海所走的路線都是沿著近海航行，所以蒼山船也編入他的船隊。
在出前，袁方訂做了一批信號旗，袁方是個穿越者，當然對信號旗是熟悉的，他自己設計圖樣送去裁縫店，通過巡撫李邦華的關係，包下了天津衛所有的裁縫師傅趕製這批信號旗。
好在信號旗做工簡單，加上又是專業的裁縫師傅來承做，這批信號旗三天的時間就全部做完了。
這批信號旗有三種樣式，分別是三角旗，方形旗、和燕尾旗，每種旗的顏色有四種，分別是黑色、白色、紅色、綠色。
有了信號旗，袁方還要對水師進行信號旗識別訓練，由於時間倉促，他隻能集中水師中的識字進行訓練，起碼識字們都認識字，他傳授起來也輕鬆很多。
三樣四色就可以有十二種不同樣的信號旗，這樣就可以代表十二種指令，這是最初級的信號旗使用方法；如果將不同的信號旗進行各種組合，就可以表達出更多的指令，這是中級信號旗的使用方法；如果在把信號旗的數量進行組合，就可以表達宏量的指令，這是高級信號旗的使用方法。
現在袁方隻能夠製定十二種指令，也就是初級信號旗的使用方法來向識字進行傳授，這樣他們比較容易理解和接受，在實際的應用中也不容易出錯。
先，袁方讓他們有一個感官識別，他把每一種旗所對應的指令寫下來，讓識字們去背，然後把信號旗插在空地上讓他們辨認，這樣經過反複的練習