蘇東坡處處為小人陷害的同時，還在盡心盡力地為國分憂，兢兢業業地為朝廷與國家工作，並不因為陷入黨爭而頹廢下去。這期間，他借助皇太後對他的信任，以坦誠的態度，向皇太後提出了很多建設性的建議，為國家的政治注入了一股強勁的生命力。
蘇東坡向皇太後提的第一個建議是廣開言路。
他指出，朝廷有道，皇帝一定是想辦法接近每一個人。比如說，唐太宗在位時，允許每一個人到宮廷進言，甚至無官無職的老百姓也在內。若有人說有事要見皇帝，宮門的守衛人員不許阻攔。蘇東坡提醒皇太後，在本朝初年，皇帝允許低級官吏謁見，甚至平民亦蒙接待。而今可得見到太後的隻不過十幾個人，那十數人豈能盡知天下所發生的事？倘若那十數人是庸碌之輩，或不敢把真實情形奏聞，隻報喜不報憂，必然導致皇太後相信天下百姓安樂無事，天下情形豈不糟糕！蘇東坡還說，很多官員的上表進言，表章進了皇宮，也就石沉大海了，皇太後根本無從知道。這樣天下的大事皇太後就很難了解了。皇太後若不親自召見，又怎麼了解所討論的問題？再者，還有好多事是不能寫在紙上見諸文字的。有的事情有時萬分複雜，一次討論未必弄得清楚，何況隻憑一道表章！
在另一道奏章裏他說，馬生病，不能以言語表達，人雖能言，上下隔絕，不能自訴，無異於馬。
這一個廣開言路的建議，無疑是很及時的。當時皇太後深居內宮，而年輕皇帝尚不諳政事，言路阻塞，正是需要疏通言路的時候。
在哲宗元祐元年，蘇東坡的另一個建議是廢止青苗貸款法。
元祐元年年初，皇帝下了一道聖旨，對於這種政治措施勉強改革了一些，常平倉穩定糧價的辦法予以恢複，而青苗貸款仍然貸於人民，隻是款額則以倉穀價值的半數為限。朝廷的如此改革，原出好意。這樣，禁止了官吏像以前那樣進入農村，召集開會，把官款分配給農民，也禁止小吏按家去催逼捐獻。但在蘇東坡看來，此種不徹底的措施還難以令人滿意，其流弊也不減於過去。於是，他給皇帝上表，第一，請求將青苗法完全廢止，第二，請求將赤貧百姓之欠債，包括本金利息在內，一律寬免。
蘇東坡在表文裏說：右臣伏見熙寧以來，行青苗、免役二法，至今二十餘年。法日益弊，民日益貧，刑日益煩，盜日益熾……又官吏無狀，於給散之際，必令酒務設鼓樂倡優，或關撲賣酒牌子。農民至有徒手而歸者。但每散青苗，即酒課暴增，此臣所親見而為流涕者也。二十年間，因欠青苗，至賣田宅，售妻女、投水自縊者不可勝數，朝廷忍複行之歟。
蘇東坡以自己的親身所見，對農民所欠青苗款的悲慘情狀一一述說，他建議朝廷下令所有欠官債者分十期歸還，以半年為一期，甚至盼望皇帝念及債務人已付過不少利息，慈悲為懷，凡四等以下貧民的債務，全予豁免。
過了一個月，青苗貸款法才全予廢除。但赤貧者之債務寬免之議，直到六年後，經蘇東坡力請，朝廷方予接受。蘇東坡關於廢除農民所欠青苗債務的建議，終於得到了很好的貫徹實施。
蘇東坡還單槍匹馬，從朝廷選拔人才這一關上入手，嚴格官吏的選拔製度。他提議廢除禮部免試辦法，嚴格限製高官巨卿之子女親戚，以及皇家所推薦之人。這是他想從根本上改革國家的吏治。
朝廷官吏皆來自科舉，但是科舉製度業已廢弛。蘇東坡有四五次身為主考官，都特別留心為國家選拔真才，有時把別的考官所棄而不取的考卷又找回重閱、錄取。有一次，考生在禦林軍例行監視之下進行考試，禦林軍的傲慢粗野，真使他吃驚。軍士對考生呼喊，如對一群新兵。有幾個考生被發現挾帶作弊而驅出大殿，警衛軍士大聲喊叫，聲勢逼人。當時混亂不堪，軍士之恢複秩序，猶如平定暴亂，其蠻橫無禮，是對士子斯文的侮辱。蘇東坡立刻連上二表，將兩個軍士斥退。
在蘇東坡時代，任人唯親之風特別盛行。有好多外省來京的考生，由朋友親戚的推薦，不用在京參加考試，便可以獲得官職。每次考試若選三四百人，總有八九百人不經過考試的。禮部每次就可以推薦免試生二三百人，其他還有由兵部和皇家關係推薦的。在春季祭天大典之時，很多讀書人由皇上特恩免考。這樣免除考試而得官的人就很多，許多平庸無能之徒混進了官場。蘇東坡說：“一官之閾，率四五人守之。爭奪紛壇，廉恥喪盡。中才小官，閾遠食貧，到官之後，求取魚利！靡所不為，而民病矣。”他又說：“臣等或見恩榜得官之人，布在州縣，例皆垂老，別無進望，惟務黯貨以為歸計。貪冒不職，十人而九。朝廷所放恩榜，幾千人矣，何曾見一人能自奮勵，有聞於時。而殘民敗官者，不可勝數。所至州縣，舉罹其害。乃即位之初，有此過舉，謂之恩澤，非臣所識也。”