軒轅黃帝帥兵遠征雲南，終於大敗蚩尤。他用軒轅弓玄天箭一箭射殺蚩尤，將其神魂困於懸龍陰界實體真身確道葬於西雲海玉龍山後為青海，身葬於二龍山的冀中，此後天女神魃接混沌精魂重歸三十三重雲天之外，玉帝封其為混元龍闡流光幻異玄仙神魔大帝，仍然化陰陽玄體遊觀太虛奇麗流光幻景，此後他雖留置魔性在陰幽神珠之內，其本元再無複回世間。就如此蚩尤被身首異處分葬兩地。後來軒轅升天化仙之後他被葬鳳凰山北百裏之遙的軒轅丘，意在鎮伏蚩尤此為後話。
再說軒轅兵勝而歸，說這一日五王三帝會盟與東嶽泰山，軒轅黃帝祭祀已畢與諸路主候長老共議治理天下之事，此時昊帝道：“現今陰魔盡除天下太平，我們也應共舉天下共主一統八荒號命群雄。如此才好統一用命興世濟世有何不可？”
眾諸候一聽無不雀樂。他們商議數日都道：“軒轅黃帝帥兵東征西討南攻北戰橫掃天下一統八荒，他滅巨濟萬生功蓋日月皆推軒轅為天下共主決無有疑義。眾人此言一出確怒腦一人，哪就是炎帝。他原為天下共主一統天下濟治萬民，此時聽各部諸候盡推軒轅黃帝為主遠高於他怎甘臣服，他此時見眾人共推軒轅黃帝主盟不便多言，隻得強自忍住。哪昊帝與幾位長老聽得眾議大喜，於是就在東嶽之顛主盟推舉軒轅黃帝登座九五之尊號命天下一統群雄。
他將天下分封功臣歸還舊主，於是炎帝仍統嶺南，昊帝依舊為東海之主，羌長老功高封為西王總鎮甘寧西地，而苗長老被封為南王總鎮雲南之地。此時風後力牧也各歸北疆此就明明一點就是而因他們增深得軒轅真傳可說於用兵之道有所創建故後世也增尊此二人為兵家始祖。其他諸候也各按功德有所分封，就是哪玉虛玄仙雖無心世事但因功太大也將這三山五嶽奇景仙地封增其為修身之地脫離王化治下不在法約之中。而黃帝在黃河兩岸興邦建都坐鎮中原，哪時軒轅黃帝功蓋天下，萬民臣服。
再說炎帝他在東嶽泰山見眾皆重舉軒轅取代他為天下共主不由大怒，但當時又不好發作隻得服氣而歸，回到嶺南舊地他一想手下五大戰神八位玄仙如今隻有自己與刑天，其他不是戰死就是進忠，但到捂為隻得一追封諡號，想到此他每日與刑天對坐思愁。日久時長他確心中漸生不平，於是南刑天商議不如再興雄帥必得天下舊部響應，哪時也可重得天下共主，於是他二次興兵南嶺討閥軒轅。
哪知此時軒轅民望至極兵威更重，哪炎帝望威日落遠非夕日。他雖有嶺南之地，但眾心不服無一從應者。就如此炎黃三戰版泉決戰逐鹿。哪軒轅黃帝多設伏兵居高而下，以河設險牧野疑兵搶占要道最終大敗炎帝將其生擒。
但軒轅念其功德就將玉龍炎帝宮改為火雲宮。後來他封神敕仙又封炎帝為開世玄炎大帝，昊帝為開世昊天玄龍大帝，與後世的禹王稱為開世治水玄元大帝，世稱開世三元大帝，是重建玄天火雲宮讓此三聖同住還真。
而此時炎帝手下大將司雷戰神刑天不服，他與軒轅約戰要單打獨鬥以武決勝敗定輸贏。眾仙及軒轅手下大將都想齊取刑天，但軒轅黃帝確道：“戰神刑天有大功於天地，其忠勇動天，為成其義行我必得一戰。於是軒轅黃帝手提火龍玉晶槍，後背軒轅弓玄天箭腰懸馭光乙天神劍胯騎麒麟寶獸與刑天獨鬥。
哪刑天左手提神盾右手早將開山利斧舞成雪片劍山，哪軒轅更無半點驚懼之色，他將玉晶槍舞動開來確如遊龍又似閃電。就如此二人大戰數百回合不分勝負，此真是靈聖玉結同心著，若分輸贏天地知。你想軒轅雖是凡體但得自仙傳又有聖靈石護體五寶加身，總然哪刑天本是天神將體也不是天精真元聖主的敵手。
哪刑天見軒轅槍法精妙實難一見，而自己空有開天神力確難動其半根毫毛，再戰半日恐自己力盡難支，於是想用玄法取勝，就見刑天展開神斧化做無數險峰巨石加雜著驚雷向軒轅擊來，其勢驚人無與論比。哪軒轅一見刑天想用玄法取勝，就見他念動真言向空中祭其一物，初時大如印章近而大如磨盤不一時確大如泰山一般，哪刑天一見知此乃是玄主翻天神印若被打中不死也必受重傷，暗道一聲不妙想化身而去，哪知早被此神印打下雲光。
刑天身受重傷，但他終是戰神之體，身體未增落地就想化光而逃，軒轅一見情急之下本想摘軒轅神弓取玄天箭，如要神箭一出哪刑天縱有通天之術也必得神魂俱散再劫難再逃，但若不將刑天治服他必會多生事端，想到此忙從跨下抽出馭光神劍望空一斬，好可憐哪戰神三光蹦出七魂離體早已身首異處。軒轅黃帝一見也不禁心中一動，本當將其神魂收伏封印陰冥，突然靈光一動又念其忠勇怎能趕盡於是停雲光回轉大營，命人將其厚葬在常羊山麓，並追其為上古五極戰神司雷天君。