氣溫的地區差異
由於地形南北狹長，氣候可分為亞寒帶多雨氣候地區(北海道、東北)、亞熱帶氣候地區(奄美大島、衝繩)與溫暖潮濕氣候地區(其他地區)。氣溫的地區差別和同一地點一年之內的氣溫差別都很大。
多雨多雪
年平均降水量約1800毫米。降水量多的地方達4000毫米，少的地方也達1000毫米。國土麵積的平均降水量大大超過世界的平均水平。以北海道、東北及北陸地區為中心，冬季降雪量多。北海道和日本海一側的主要城市，積雪期有150天～200天。
貧乏的自然資源
盡管日本已經發展成為世界第二號經濟強國，科技水平和生產力水平均居世界前列，但是，日本卻是一個地道的資源十分貧乏的國家，它所需要的原料和能源嚴重依賴國外的進口。
日本的自然資源貧乏，除森林、硫磺、鋅有一定儲量外，其他絕大部分工業原料和燃料都需進口。日本的能源主要是石油和煤。石油約占日本能源消耗總量的3/4，而日本的石油的99.8%依賴進口，約占世界石油進口總量的16%。日本進口石油的76.3%來自中東國家，16%左右來自印度尼西亞。日本煤的理論儲量為212億噸，1980年日本煤的消耗量約占能源消費總量的17%。以1980年為例，當年日本自產煤隻有1809.5萬噸，而當年對煤的需求量是9237萬噸，其中76%以上依賴進口，進口來源主要是澳大利亞和美國。天然氣，日本自己隻能生產一點點，82%需要進口。
日本的礦產資源十分貧乏，發展迅速的工業部門中，原材料消費多的工業，如鋼鐵、造船、石油化工、電力等，原材料進口占的比例很大。鐵礦石的98.4%依賴進口，其中50%來自澳大利亞。鉛礦的78.6%，鋅礦的62.4%，銅礦的91%和錫礦的98%也需要進口。更為嚴重的是，鋁、鐵礬土和鎳全部都要進口。此外，羊毛、棉花和天花橡膠也需要百分之百地依賴進口。
日本的森林茂密，麵積廣闊，森林覆蓋麵積占全國總麵積的66.8%，約為2526萬公頃。主要樹種有鬆樹、杉樹、柏樹和毛櫸屬、櫟屬林木、毛竹等。盡管如此，木材的供應量遠不能滿足日本工業發展的需要，木材自給率約為40%，60%要靠進口。日本是世界上購買木材最多的國家，主要來源於美國、馬來西亞、印度尼西亞和前蘇聯等國。
日本主要是由本州、九州、四國、北海道四大島和近4000多個島嶼組成的，總麵積為38萬平方公裏。其中山地和火山占日本國土的60%以上，可耕地麵積528萬公頃，隻占全國總麵積14%。日本的主要糧食作物是水稻，1989年產量為1029.7萬噸，按單位麵積的產量計劃，居世界第一位。由於日本工業的迅猛發展，有限的耕地不斷被擠占，可耕地麵積不斷減少，加之勞動力的不足，日本的糧食生產日趨減少，糧食自給率隻在50%左右，另一半則依賴進口。
日本的水力資源比較豐富，水能蘊藏量達4732萬千瓦。同時，由於日本四周環海，海岸線很長，為33000多公裏，又處於太平洋暖流(黑潮暖流)和寒流(親潮寒流)在日本東北沿海彙合處，因此，日本的漁業資源十分豐富，是世界四大著名漁場之一。1988年日本年捕魚量為1278.5萬噸，居世界首位。
由上可見，日本除了森林、水力、硫磺等，總的說，資源十分貧乏。