在薩拉托加拖著主角胡鬧的同時，另一處，幽靈船與大西洋壁壘接觸，得到重要劇情線索，大西洋壁壘正保護著某人。
回到戰場的主角被瞬間卷入，被重創後昏迷，被布呂歇爾誤認為深海艦而追殺，在不知火的幫助下得救。與空想等人成功彙合，接觸了倫敦、肯特、天後之後，走在過道上時，被能力暴走的吹雪卷入，之後又目睹了克隆艦前衛被消滅的一幕。
這時發現嗜睡的藍嶺弄丟了，空想、麻司與主角出發尋找。期間發生重要劇情，出場歐陽家葉菟少校，以及她對於吹雪有所行動。在途中遭遇了重要人物流浪提督辛怵，出場了列克星敦，關島、阿拉斯加姐妹，以及回歸分解的不知火。
找回藍嶺後，接到突襲任務，並且在船上結識了安德烈亞多利亞。空想依靠標槍所贈送的結晶建造出了黑背豺，從基地調度了曉加入艦隊，主角跟隨並參加此次任務。
同時深海輕母追趕者與重巡希佩爾上將開始執行任務，企圖接觸主角。
於此跳轉至革命篇同時開啟破界篇，以初代Z1為主視角，目睹幾項重要劇情線索，1、要塞姬進入人類內陸；2、提督狄晴波在叛離人類；3、主角接觸了巷子裏的人影。在酒館中聽黑背豺講述戰役故事，再次跳轉回未完的戰役篇。
深海生物化為人形“”，同時破界艦隊進入，開始執行對人類沿岸炮擊的任務。追趕者與希佩爾在主角與空想分開的情況下，對幾人發起了襲擊，最後因為空想的即使趕到而放棄接觸。
完成任務回歸後，主角得知安德烈亞多利亞因不明原因關押後，襲擊監獄釋放了安德烈亞，自己卻被關押。於是情況逆轉，安德烈亞返回救出來主角，則和空想她們進行獲取赦免令的任務。
逃至無人島後安德烈炮擊山體導致滑坡，兩人被埋坑中，與能量的缺失主角喪失意識，安德烈在“不可抗力”的作用下，以自己體內的“？？”救助了主角，主角得到安德烈的艦裝並得救。
最後便是吃喝搞百合，吹雪突然登場，日係小學生則因為葉菟放走吹雪的緣故而出發尋找吹雪。
理了理雖然還是有些亂，但好歹可以接受了，也許我還忘了些什麼。
希望各位能繼續支持哦，革命篇結束代表前期的終結。
革命篇分為幾方勢力，安大校為首的革命派（最大優勢），大元帥為首的保守派（決定退出），歐陽家為代表的中立派。
參雜外部勢力，深海，破界艦隊，人類艦娘。
由於艦娘在陸地上戰鬥不像海上一樣，是得不到能量補充的，所以人類的革命中，艦娘的作用不大。