第二次忍界大戰的戰火還未徹底熄滅，除了此次大戰中以一己之力對抗世界的火之國在實力大損的同時，還能發出勝利的笑聲外，留給世界的，隻有憎恨和悲傷！
而這份憎恨和哀傷仍然在繼續蔓延著……
川之國，作為夾在忍界大國之間的眾多小國之一，更是被當做忍界戰爭的一個戰場，受到的破壞更甚，到處是戰火殘留的悲傷，流離失所的難民，荒無人際的村莊，廢墟般的城鎮，在這個細雨霏霏的國度裏顯得更加悲涼和無助……
未名鎮，作為近川之國忍村——雨忍村的幾個重要商業城鎮，是川之國為數幾個在戰火中受損程度較小的城鎮，但是受到戰爭影響，昔日的商業城鎮，如今也是無比蕭條，鎮東的一大片居民住宅在數月前也毀於暫時棲息木葉忍者的反應過激的忍術中……
“戰火和哀鳴在空氣回蕩，這是一個悲哀的時代，這也是一個流淚的世界……”
稚嫩的聲音輕輕回蕩在人數寥寥的武士道場中，外貌已經五六歲長門躺在房屋中沙發大臥椅中，透過門戶，看著道場中蒙蒙細雨，輕輕地抿了一口口中的熱茶，歎息道。
在長門身邊，留著淺藍紫色短發的蘿莉同樣躺在一個沙發中，淺橘色的雙眸仔細觀看手中的卷軸，仔細沉思著，對長門的輕語不聞不問，完全陷入了自己的世界。她的名字叫小南，一個月前長門外出劫富濟貧時，順手撿到的一隻蘿莉。
看著小蘿莉的專注，長門笑了笑，他知道，這是那段流離失所的經曆太深刻了，讓她對於擁有力量有了極大的渴望，對此長門自然是熱見其成。輕輕一笑，看著大院裏的雨幕，長門一邊慢慢地汲取世界之力淬煉身體和雙眸中的輪回眼，一邊陷入了自己的世界。
長門原本不是這個世界的人，而是來自名為地球的蔚藍星球的一介畢業大學生，從小是個孤兒，為人也比較孤僻，朋友不多，知己更是一個也無，在找工作的日子裏來回奔波，在未來還未有著落的時候，突如其來的地震就將長門送入輪回。
漫長的沉睡後，長門蘇醒後，發現自己在一個五歲的饑餓小孩身上借屍還魂了，而且這個小孩長門認識，竟是傳說中第三六道，漩渦長門抑或稱佩恩六道！
日本動漫《火影忍者》中的人物，漩渦一族的後裔，佩恩六道操控者，曉組織首領，第三個六道；大蛤蟆仙人稱他和漩渦鳴人為預言之子；被宇智波斑選定為輪回眼的繼承人。
經曆了父母及摯友彌彥之死的痛楚，他繼承了彌彥的組織，成為曉組織第二任首領，追求理想是在痛苦的輪回中孕育和平。
後被命運主角漩渦鳴人神奇力量感化，重拾年少時期的夢想，用輪回天生複活木葉一戰所死之人，將自己的意誌托付給了鳴人，期待鳴人能夠完成《鳴人物語》，力竭而亡。
除了成了某位強大又可悲的大boss後，長門還意外獲得一個超級金手指——萬界之匙！
在經曆了短暫的驚慌失措後，長門便接受了事實，並了解了萬界之匙這件無法觸摸，隻存在靈魂之中的神秘之物的作用，簡而言之，就是打開諸天萬界的大門，讓宿主合理合法地行走在諸天萬界。
當然，這個主要作用暫時對長門沒有什麼作用，倒是它的兩個副作用，讓長門更加看重，那就是吸收存儲世界之力和時空之力。